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饲喂青贮黄梁木代替青贮玉米川中黑山羊肝转录组的表达分析
被引量:
1
1
作者
张德安
杨若渚
+6 位作者
刘杰
刘德武
邓铭
柳广斌
孙宝丽
郭勇庆
李耀坤
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期232-244,共13页
旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平...
旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平均体重(21.07±4.05)kg]并随机分为两组,试验组为青贮黄梁木替代50%青贮玉米组,对照组为青贮玉米组。试验期间采用全混合日粮(TMR)进行饲喂。于试验期的最后1 d对山羊进行屠宰并取其肝,提取肝组织的RNA,构建文库后使用高通量测序技术进行转录组测序,以P<0.05为阈值筛选出差异mRNA和lncRNA,进行生物学功能富集分析并构建靶向关系网络。再从差异表达lncRNA和mRNA中各随机选择3个基因,采用RT-qPCR进行验证分析。结果表明,共发现差异表达的mRNA有1696个,其中943个上调,753个下调;差异表达lncRNA共有33个,其中22个上调,11个下调。结合差异表达lncRNA的靶基因与差异表达mRNA的交集基因的富集分析发现,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5参与肝功能相关的信号通路,如多糖代谢过程、葡聚糖分解代谢过程、纤维素分解代谢等。结合lncRNA靶基因预测发现,GSTA3、GSTA 4基因参与肝功能相关的信号通路如药物代谢-细胞色素P450及细胞色素P450对异源物质的代谢等代谢通路。本研究发现,在饲喂青贮黄梁木川中黑山羊的肝组织中,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5以及GSTA3、GSTA 4等可能从营养物质代谢和毒素代谢等方面影响肝功能。
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关键词
青贮黄粱木
川中黑山羊
肝
lncRNA
mRNA
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题名
饲喂青贮黄梁木代替青贮玉米川中黑山羊肝转录组的表达分析
被引量:
1
1
作者
张德安
杨若渚
刘杰
刘德武
邓铭
柳广斌
孙宝丽
郭勇庆
李耀坤
机构
华南农业大学动物科学学院
华南农业大学畜禽育种国家地方联合工程研究中心
华南农业大学广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期232-244,共13页
基金
石山羊的遗传选育和高效养殖技术示范推广应用(KTP20210344)
广东省现代农业产业技术体系项目(2021KJ127)。
文摘
旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊[5月龄,平均体重(21.07±4.05)kg]并随机分为两组,试验组为青贮黄梁木替代50%青贮玉米组,对照组为青贮玉米组。试验期间采用全混合日粮(TMR)进行饲喂。于试验期的最后1 d对山羊进行屠宰并取其肝,提取肝组织的RNA,构建文库后使用高通量测序技术进行转录组测序,以P<0.05为阈值筛选出差异mRNA和lncRNA,进行生物学功能富集分析并构建靶向关系网络。再从差异表达lncRNA和mRNA中各随机选择3个基因,采用RT-qPCR进行验证分析。结果表明,共发现差异表达的mRNA有1696个,其中943个上调,753个下调;差异表达lncRNA共有33个,其中22个上调,11个下调。结合差异表达lncRNA的靶基因与差异表达mRNA的交集基因的富集分析发现,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5参与肝功能相关的信号通路,如多糖代谢过程、葡聚糖分解代谢过程、纤维素分解代谢等。结合lncRNA靶基因预测发现,GSTA3、GSTA 4基因参与肝功能相关的信号通路如药物代谢-细胞色素P450及细胞色素P450对异源物质的代谢等代谢通路。本研究发现,在饲喂青贮黄梁木川中黑山羊的肝组织中,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS 5以及GSTA3、GSTA 4等可能从营养物质代谢和毒素代谢等方面影响肝功能。
关键词
青贮黄粱木
川中黑山羊
肝
lncRNA
mRNA
Keywords
silage Neolamarckia Cadamba
Chuanzhong Black Goat
liver
lncRNA
mRNA
分类号
S813 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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被引量
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1
饲喂青贮黄梁木代替青贮玉米川中黑山羊肝转录组的表达分析
张德安
杨若渚
刘杰
刘德武
邓铭
柳广斌
孙宝丽
郭勇庆
李耀坤
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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