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玉液汤调控自噬相关机制改善早期糖尿病肾病的机制探讨 被引量:5
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作者 吴小翠 杨诏钧 +3 位作者 杨智华 李坚昊 程亚伟 谢毅强 《海南医学院学报》 CAS 2022年第15期1162-1169,共8页
目的:运用网络药理学的研究方法联合分子对接探讨玉液汤治疗糖尿病肾病的机制。方法:通过高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)获取糖尿病肾病转录组基因表达情况,提取与自噬相关的基因。利用中药系统药理学数据库与分析... 目的:运用网络药理学的研究方法联合分子对接探讨玉液汤治疗糖尿病肾病的机制。方法:通过高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)获取糖尿病肾病转录组基因表达情况,提取与自噬相关的基因。利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)工具筛选得出玉液汤的活性成分及相关靶点,将药物预测靶点与疾病靶点进行映射得到与自噬相关的玉液治疗糖尿病肾病的靶点。利用String(search tool for the retrival of interacting genes/proteins)数据库结合Cytoscape 3.7.2软件构建玉液汤治疗糖尿病肾病的“药物-有效活性成分-靶点”网络和蛋白质相互作用网络,使用Metascape对玉液汤治疗糖尿病肾病的作用靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)生物学过程分析和京都基因和基因组数据库KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,最后运用Pymol等软件对玉液汤的核心活性成分与核心靶点蛋白进行分子对接验证。结果:(1)筛选得到符合条件的糖尿病肾病与自噬相关基因100个,玉液汤的潜在作用靶点共1428个。将获得的糖尿病肾病与自噬相关的基因与玉液汤潜在作用靶点进行映射,获得22个治疗靶点。GO生物学过程富集分析与KEGG通路富集分析发现玉液汤治疗糖尿病肾病与自噬相关的通路可能包括mTOR信号通路、磷脂酶D信号通路、胰岛素抵抗、EGFR酪氨酸激酶抑制剂抵抗、细胞凋亡、PI3K/Akt信号通路、NF-κB信号通路等。(2)蛋白互作网络表明VEGFA、ERBB2、GASP3、MAPK8、MYC、CDKN1A、EGFR、BCL2L1可能是玉液汤治疗糖尿病肾病的关键作用靶点。分子对接实现4个核心活性成分与8个核心靶点蛋白结合。结论:玉液汤通过多成分、多靶点、多通路作用治疗糖尿病肾病,为玉液汤治疗糖尿病肾病的在自噬相关方面的药理作用研究和临床应用提供新的理论依据。 展开更多
关键词 玉液汤 糖尿病肾病 自噬相关基因 网络药理学 分子对接
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基于网络药理学探究三七治疗冠心病的潜在作用机制 被引量:8
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作者 黄桂锋 郑晓虹 +3 位作者 麦喆钘 杨诏钧 林雪莹 李俊哲 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第14期1959-1965,共7页
目的:研究三七治疗冠心病的成分、靶点及通路,探讨其发挥治疗作用的潜在分子机制。方法:基于网络药理学方法,利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索获取三七的活性成分;利用DRAR-CPI服务器、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出与三七治... 目的:研究三七治疗冠心病的成分、靶点及通路,探讨其发挥治疗作用的潜在分子机制。方法:基于网络药理学方法,利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索获取三七的活性成分;利用DRAR-CPI服务器、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出与三七治疗冠心病相关的作用靶标;采用Cytoscape3.6.0软件构建三七有效成分-冠心病作用靶标网络;采用String数据库绘制作用靶标的相互作用网络,并运用NetworkAnalyzer工具计算靶标连接度,筛选出潜在核心靶标,然后通过SystemsDockWebSite服务器的分子对接验证核心靶标与有效成分的结合力;利用KEGG通路富集分析和基因本体(GO)分类富集分析获取三七治疗冠心病的重要信号通路和分子功能,并构建重要信号通路的“有效成分-作用靶标-信号通路”网络。结果:筛选出三七中治疗冠心病的5个有效成分(豆甾醇、β-谷固醇、人参皂苷rh2、槲皮素、三七皂苷r1),5个成分共作用于96个靶标并存在134种作用关系;5个核心靶标分别为蛋白激酶B(AKT)、白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、c-JUN蛋白(c-JUN)、肝磷脂结合表皮生长因子(HB-EGF),其主要通过改变蛋白结合作用以及调控磷酯酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、低氧诱导因子1(HIF-1)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路来发挥治疗冠心病的作用。结论:三七治疗冠心病不仅是通过作用于多个靶标而发挥多种效果,而且可通过靶标之间的相互作用产生复杂的网络调节效果。 展开更多
关键词 三七 冠心病 网络药理学 成分 靶标 通路 作用机制
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基于长短码联合控制的程序完整性校验方法
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作者 姬一文 杨钊 +2 位作者 王玉成 杨诏钧 康昱 《信息技术与网络安全》 2021年第4期1-6,共6页
提出了一种基于长短码联合度量的程序完整性校验方法。分析了操作系统文件系统的特点,基于LSM框架设计文件监控模块,实现对文件完整性实时标记,可主动标记识别被篡改文件;应用程序安装到操作系统时,会对该程序计算哈希值和设定短码标记... 提出了一种基于长短码联合度量的程序完整性校验方法。分析了操作系统文件系统的特点,基于LSM框架设计文件监控模块,实现对文件完整性实时标记,可主动标记识别被篡改文件;应用程序安装到操作系统时,会对该程序计算哈希值和设定短码标记,来初始化白名单数据库完成度量基准的设定;应用程序执行前触发校验模块,先检测程序的短码标记,根据检测结果再决定对程序的哈希值长码校验。使用应用程序长短码联合度量校验,提高应用程序度量校验效率;结合监控模块对程序的实时监控,并针对不同场景,设计了应用程序的标记在多种类别之间的转换规则,保证快速精细地获取程序完整的状况。整套方案实现了对应用程序实时高效的控制。 展开更多
关键词 完整性校验 完整性度量 LSM 执行控制
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