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急性脑出血瘀热病机生物标志物的血浆差异代谢组学研究
被引量:
1
1
作者
杨晓娟
高觉民
+5 位作者
张宁
杨诗锦
杨东清
于明
田婷
李国春
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2019年第10期2062-2072,共11页
目的采用血浆差异代谢组学的方法筛选和评价急性脑出血瘀热病机的特征代谢物,并确立生物标志物。方法根据《中医脑出血瘀热评分量表》,采用匹配的方法收集临床瘀热型与非瘀热型急性ICH患者各40例,健康对照40例,应用液相色谱-质谱联用技...
目的采用血浆差异代谢组学的方法筛选和评价急性脑出血瘀热病机的特征代谢物,并确立生物标志物。方法根据《中医脑出血瘀热评分量表》,采用匹配的方法收集临床瘀热型与非瘀热型急性ICH患者各40例,健康对照40例,应用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)检测瘀热组(YP)、非瘀热组(FP)及健康组(JP)之间血浆差异代谢物。采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)和正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)对代谢组学数据进行多维统计分析,筛选急性脑出血瘀热病机单元的特征代谢物。结果YP/JP检测出27个差异代谢物;FP/JP检测出23个差异代谢物;FP/YP检测出14种差异代谢物,主要涉及类固醇激素合成、组氨酸代谢、半乳糖代谢等9个通路。结论可的松21-乙酸酯、酸甲酯和甘油三酯可作为一组急性脑出血瘀热病机的潜在生物标志物。
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关键词
脑出血
瘀热病机
代谢组学
生物标志物
下载PDF
职称材料
凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响
被引量:
2
2
作者
李薇懿
李国春
+6 位作者
魏乐心
钱勤
郭晴晴
杨诗锦
杨晓娟
王鹏程
陈杨
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022年第5期1933-1943,共11页
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,...
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。
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关键词
凉血通瘀方
miRNA
高通量测序
大鼠脑组织
差异表达
急性脑出血
下载PDF
职称材料
题名
急性脑出血瘀热病机生物标志物的血浆差异代谢组学研究
被引量:
1
1
作者
杨晓娟
高觉民
张宁
杨诗锦
杨东清
于明
田婷
李国春
机构
南京中医药大学公共卫生学系
南京中医药大学附属江苏省中医院神经外科
邳州市中医院神经内科
江苏大学附属江滨医院神经内科
南京中医药大学附属南京市中医院急诊科
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2019年第10期2062-2072,共11页
基金
国家自然科学基金委员会面上项目(81373512):急性脑出血瘀热病机单元的动态测量及其生物标志物的研究,负责人:李国春
文摘
目的采用血浆差异代谢组学的方法筛选和评价急性脑出血瘀热病机的特征代谢物,并确立生物标志物。方法根据《中医脑出血瘀热评分量表》,采用匹配的方法收集临床瘀热型与非瘀热型急性ICH患者各40例,健康对照40例,应用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)检测瘀热组(YP)、非瘀热组(FP)及健康组(JP)之间血浆差异代谢物。采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)和正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)对代谢组学数据进行多维统计分析,筛选急性脑出血瘀热病机单元的特征代谢物。结果YP/JP检测出27个差异代谢物;FP/JP检测出23个差异代谢物;FP/YP检测出14种差异代谢物,主要涉及类固醇激素合成、组氨酸代谢、半乳糖代谢等9个通路。结论可的松21-乙酸酯、酸甲酯和甘油三酯可作为一组急性脑出血瘀热病机的潜在生物标志物。
关键词
脑出血
瘀热病机
代谢组学
生物标志物
Keywords
Intracerebral Hemorrhage
Pathogenesis of stasis-heat
Metabonomics
Biomarkers
分类号
R44 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响
被引量:
2
2
作者
李薇懿
李国春
魏乐心
钱勤
郭晴晴
杨诗锦
杨晓娟
王鹏程
陈杨
机构
南京中医药大学公共卫生系
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022年第5期1933-1943,共11页
基金
国家自然科学基金委员会面上项目(81373512):急性脑出血瘀热病机单元的动态测量及其生物标志物的研究,负责人:李国春。
文摘
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。
关键词
凉血通瘀方
miRNA
高通量测序
大鼠脑组织
差异表达
急性脑出血
Keywords
Liangxue Tongyu Prescription
miRNA
High-throughput sequencing technology
Rat brain tissue
Differential expression
Acute stage of cerebral hemorrhage
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
急性脑出血瘀热病机生物标志物的血浆差异代谢组学研究
杨晓娟
高觉民
张宁
杨诗锦
杨东清
于明
田婷
李国春
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2019
1
下载PDF
职称材料
2
凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响
李薇懿
李国春
魏乐心
钱勤
郭晴晴
杨诗锦
杨晓娟
王鹏程
陈杨
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022
2
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职称材料
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