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DeepOCSR:一种用于光学化学结构识别的深度编码-解码网络
1
作者
杨赵朋
李建华
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期135-143,共9页
从科学出版物中识别光学化学结构是重新发现化学结构性质的重要组成部分,对于药物研发和天然产物研究方面具有重要意义。现有的光学化学结构识别方法存在识别率较低等问题,为了有效地提高光学化学结构识别任务的识别性能,本文提出了一...
从科学出版物中识别光学化学结构是重新发现化学结构性质的重要组成部分,对于药物研发和天然产物研究方面具有重要意义。现有的光学化学结构识别方法存在识别率较低等问题,为了有效地提高光学化学结构识别任务的识别性能,本文提出了一种用于光学化学结构识别的深度学习方法(DeepOCSR)。该方法基于编码器-解码器架构,引入了Transformer和ResNeSt模型,将出版物中的化学结构图像转换为SMILES序列。构建了两种新的化学结构数据集,其中一个包含了化学文献中常见的取代基。将本文方法与现有的其他方法进行对比实验,结果表明本文方法在相似度和有效性等关键指标上均优于对比方法。
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关键词
深度学习
化学结构识别
编码器-解码器
SMILES
取代基
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职称材料
题名
DeepOCSR:一种用于光学化学结构识别的深度编码-解码网络
1
作者
杨赵朋
李建华
机构
华东理工大学信息科学与工程学院
出处
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期135-143,共9页
基金
国家科技重大专项(2018ZX09735002)。
文摘
从科学出版物中识别光学化学结构是重新发现化学结构性质的重要组成部分,对于药物研发和天然产物研究方面具有重要意义。现有的光学化学结构识别方法存在识别率较低等问题,为了有效地提高光学化学结构识别任务的识别性能,本文提出了一种用于光学化学结构识别的深度学习方法(DeepOCSR)。该方法基于编码器-解码器架构,引入了Transformer和ResNeSt模型,将出版物中的化学结构图像转换为SMILES序列。构建了两种新的化学结构数据集,其中一个包含了化学文献中常见的取代基。将本文方法与现有的其他方法进行对比实验,结果表明本文方法在相似度和有效性等关键指标上均优于对比方法。
关键词
深度学习
化学结构识别
编码器-解码器
SMILES
取代基
Keywords
deep learning
chemical structure recognition
encoder-decoder
SMILES
substituents
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DeepOCSR:一种用于光学化学结构识别的深度编码-解码网络
杨赵朋
李建华
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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