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基于药物表达谱模式筛选结肠癌候选治疗药物 被引量:3
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作者 王纯忠 杨邵宇 +2 位作者 肖慧莲 刘丽娜 王桂平 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期212-217,共6页
目的:药物表达谱是发现药物新用途的重要模式,本项目探讨药物表达谱模式在结肠癌候选药物筛选中的应用价值。方法:首先,从Pub Med的GEO数据库中获取结肠癌表达谱数据集(No.GSE41258),从美国Memorial Sloan-Kettering癌症中心筛选出53对... 目的:药物表达谱是发现药物新用途的重要模式,本项目探讨药物表达谱模式在结肠癌候选药物筛选中的应用价值。方法:首先,从Pub Med的GEO数据库中获取结肠癌表达谱数据集(No.GSE41258),从美国Memorial Sloan-Kettering癌症中心筛选出53对配对的结肠癌与癌旁正常组织样本数据,采用RMAexpress软件进行质量分析;然后,采用Dchip软件建立结肠癌特征性表达谱;最后通过Connectivity Map(CMAP)进行结肠癌候选化合物的筛选和实验验证。结果:经芯片质量分析,选择36对配对样本进行后续分析;构建了一个由371个基因组成的结肠癌特征性表达谱,其中上调基因94个,下调基因277个;通过CMAP分析,筛选到vorinostat、tanespimycin(17-AAG)等10种候选药物,选择其中一种富集分数较高的药物17-AAG进行验证;后续实验证实17-AAG可有效抑制结肠癌SW480和HT29株细胞的增殖,其作用24和48 h时,SW480细胞的IC50分别为0.73和0.41μmol/L;而HT29细胞的IC50分别为0.72和0.50μmol/L。流式术分析显示,17-AAG可使结肠癌细胞阻滞于G1期。结论:本项目基于药物表达谱模式筛选到多种结肠癌候选药物,揭示药物表达谱模式在药物发现中具有重要意义。 展开更多
关键词 基因表达谱 结肠癌 CONNECTIVITY Map 候选治疗药物
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白藜芦醇的抗结肠癌作用及其机制研究 被引量:3
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作者 王纯忠 杨邵宇 +2 位作者 肖慧莲 刘丽娜 王桂平 《广州医科大学学报》 2016年第2期9-12,共4页
目的:观察白藜芦醇对结肠癌SW480细胞生长抑制作用,并探讨其作用机制。方法:采用CCK-8试剂盒评价白藜芦醇对SW480细胞的增殖抑制效应;采用流式细胞技术检测白藜芦醇对SW480细胞的细胞周期和细胞凋亡影响;通过Tar Fis Dock分子对接分析工... 目的:观察白藜芦醇对结肠癌SW480细胞生长抑制作用,并探讨其作用机制。方法:采用CCK-8试剂盒评价白藜芦醇对SW480细胞的增殖抑制效应;采用流式细胞技术检测白藜芦醇对SW480细胞的细胞周期和细胞凋亡影响;通过Tar Fis Dock分子对接分析工具,对白藜芦醇可能作用靶点进行预测分析。结果:白藜芦醇可明显抑制结肠癌SW480细胞的生长,白藜芦醇作用24 h时,其IC_(50)值为191.5μmol/L;而48 h时的IC_(50)值为117.6μmol/L。流式分析显示,白藜芦醇可使SW480细胞阻滞于G1期,并诱导细胞凋亡。靶点预测分析筛选到10个白藜芦醇作用候选靶点,其中基质金属蛋白酶8(MMP8)、人组蛋白脱乙酰化酶2(HDAC2)、乙酰胆碱酯酶等3个靶点可能是白藜芦醇抗结肠癌的新靶点。结论:白藜芦醇具有良好的抗结肠癌效应,可能成为结肠癌治疗的新的候选药物或增敏剂。 展开更多
关键词 白藜芦醇 结肠肿瘤 SW480细胞 生长抑制
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干细胞相关因子在大肠癌组织及SW620细胞株的表达 被引量:2
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作者 李秋娴 黄颖峰 +6 位作者 魏亚明 王晓华 罗宏图 杨邵宇 许艳丽 黄于艺 叶亨 《中国组织工程研究与临床康复》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1015-1019,共5页
背景:肿瘤细胞有多种干细胞标记的表达,深入研究其表达规律有助于揭示肿瘤发病机制、完善肿瘤干细胞理论。目的:检测大肠癌实体组织中干细胞相关分子标记CD133、CD166、Oct4、Sox2、C-myc、Klf4、Bmi-1与癌旁组织的表达差异,以及CD133... 背景:肿瘤细胞有多种干细胞标记的表达,深入研究其表达规律有助于揭示肿瘤发病机制、完善肿瘤干细胞理论。目的:检测大肠癌实体组织中干细胞相关分子标记CD133、CD166、Oct4、Sox2、C-myc、Klf4、Bmi-1与癌旁组织的表达差异,以及CD133免疫磁珠分选阳性与阴性SW620细胞中上述基因的表达差异。方法:选临床病理诊断清楚的29例大肠癌组织标本提取RNA,RT-PCR检测CD133、CD166、Oct4、Sox2、C-myc、Klf4、Bmi-1在大肠癌组织与癌旁对照组织中的表达。CD133免疫磁珠分选SW620,提取CD133细胞与CD133阴性细胞RNA,RT-PCR检测分选后上述基因的表达差异。结果与结论:29例标本均诊断为低、中分化腺癌或黏液腺癌,干细胞相关分子标记癌组织与癌旁组织表达灰度相对值癌组织表达均高于癌旁组织(P<0.05)。RT-PCR检测分选后CD133+细胞CD133,CD166,Oct4,Sox2,C-myc,Klf4,Bmi-1表达,结果均高于CD133-细胞。提示,CD133、CD166、Oct4、Sox2、C-myc、Klf4、Bmi-1相关干细胞标记可作为大肠癌肿瘤干细胞标记并有望用于诊断检测。 展开更多
关键词 大肠癌 肿瘤干细胞 CD133 CD166 OCT4 SOX2 KLF4 C-myc BMI-1
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