目的分析螨虫过敏原Der f 22的氨基酸序列特性与二级结构,构建其三维结构模型并基于此对其B、T细胞表位进行预测与分析。方法通过ProtParam对Der f 22的理化性质进行计算。根据其理化性质与氨基酸序列,使用AlphaFold 2和GalaxyRefined2...目的分析螨虫过敏原Der f 22的氨基酸序列特性与二级结构,构建其三维结构模型并基于此对其B、T细胞表位进行预测与分析。方法通过ProtParam对Der f 22的理化性质进行计算。根据其理化性质与氨基酸序列,使用AlphaFold 2和GalaxyRefined2构建并优化Der f 22过敏原的三维结构,进一步利用DNAStar、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTope 2.0和TepiTool预测Der f 22的B细胞表位和T细胞表位。结果基于氨基酸序列,我们得到了Der f 22蛋白的二级结构特征与三维结构。利用多种生物信息学工具,我们预测并筛选出6个线性B细胞表位、19个参与形成构象B细胞表位的关键残基和4个T细胞表位。结论本研究得到的蛋白质结构和抗原表位为进一步对Der f 22功能改造及低免疫原性疫苗的开发奠定基础。展开更多
目的:分析粉尘螨过敏原Der f 38的理化性质及结构特征,并综合生物信息学工具预测其免疫优势B、T细胞表位。方法:从世界卫生组织/国际免疫学联合会的过敏原数据库中获取Der f 38的氨基酸序列信息,利用ProtParam对Der f 38的理化性质特征...目的:分析粉尘螨过敏原Der f 38的理化性质及结构特征,并综合生物信息学工具预测其免疫优势B、T细胞表位。方法:从世界卫生组织/国际免疫学联合会的过敏原数据库中获取Der f 38的氨基酸序列信息,利用ProtParam对Der f 38的理化性质特征进行分析。通过SWISS-MODEL、AlphaFold2及GalaxyRefine对Der f 38的三维结构模型进行综合构建、优化得到最佳的蛋白模型。利用DNAStar Protean、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTop、TepiTool进行Der f 38蛋白的B细胞线性、构象型表位以及T细胞表位的综合预测。结果:Der f 38为分子量13.99kDa且等电点为9.08,总平均亲水性为-0.337,不稳定指数为31.79。通过多种生物信息学工具综合分析,共得到4个优势B细胞线性表位、8个B细胞构象表位和8个T细胞表位。结论:Der f 38属于碱性蛋白,具有一定的亲水性和稳定性,含有多个免疫优势的B细胞和T细胞抗原表位,为进一步针对该蛋白的疫苗和过敏原特异性免疫疗法的设计与开发提供理论参考。展开更多
文摘目的分析螨虫过敏原Der f 22的氨基酸序列特性与二级结构,构建其三维结构模型并基于此对其B、T细胞表位进行预测与分析。方法通过ProtParam对Der f 22的理化性质进行计算。根据其理化性质与氨基酸序列,使用AlphaFold 2和GalaxyRefined2构建并优化Der f 22过敏原的三维结构,进一步利用DNAStar、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTope 2.0和TepiTool预测Der f 22的B细胞表位和T细胞表位。结果基于氨基酸序列,我们得到了Der f 22蛋白的二级结构特征与三维结构。利用多种生物信息学工具,我们预测并筛选出6个线性B细胞表位、19个参与形成构象B细胞表位的关键残基和4个T细胞表位。结论本研究得到的蛋白质结构和抗原表位为进一步对Der f 22功能改造及低免疫原性疫苗的开发奠定基础。
文摘目的:分析粉尘螨过敏原Der f 38的理化性质及结构特征,并综合生物信息学工具预测其免疫优势B、T细胞表位。方法:从世界卫生组织/国际免疫学联合会的过敏原数据库中获取Der f 38的氨基酸序列信息,利用ProtParam对Der f 38的理化性质特征进行分析。通过SWISS-MODEL、AlphaFold2及GalaxyRefine对Der f 38的三维结构模型进行综合构建、优化得到最佳的蛋白模型。利用DNAStar Protean、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTop、TepiTool进行Der f 38蛋白的B细胞线性、构象型表位以及T细胞表位的综合预测。结果:Der f 38为分子量13.99kDa且等电点为9.08,总平均亲水性为-0.337,不稳定指数为31.79。通过多种生物信息学工具综合分析,共得到4个优势B细胞线性表位、8个B细胞构象表位和8个T细胞表位。结论:Der f 38属于碱性蛋白,具有一定的亲水性和稳定性,含有多个免疫优势的B细胞和T细胞抗原表位,为进一步针对该蛋白的疫苗和过敏原特异性免疫疗法的设计与开发提供理论参考。
