“宣威”多结节非小细胞肺癌驱动基因突变分析

目的:探讨多结节非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的驱动基因突变情况与临床病理特征的关系,为多结节NSCLC患者治疗提供分子诊断依据。方法:本研究共纳入2018年1月至2023年10月间云南省肿瘤医院分子诊断中心检测的121例多结节NSCLC患者的253个肺结节肿瘤组织标本,以第二代测序(NGS)技术或扩增阻滞突变系统PCR(ARMS-PCR)技术检测多结节NSCLC组织中驱动基因突变情况,分析其与患者临床病理特征的关系,比较不同结节间肺癌驱动基因的突变异质性。结果:与非“宣威”NSCLC相比,“宣威”多结节NSCLC患者驱动基因突变具有显著的地域特点,表现在“宣威”患者具有较低(20%)的EGFR敏感突变(L858R、19-del)及较高(27.26%)的EGFR少见突变(主要为G719/S768I、G719);“宣威”多结节NSCLC患者的KRAS突变率(27.27%)亦显著高于非“宣威”患者突变率(12.59%)(P<0.05)。此外,“宣威”多结节NSCLC患者驱动基因突变不一致率高达69.23%,远高于非“宣威”患者驱动基因突变不一致率(55.07%)(P<0.05)。结论:“宣威”多结节NSCLC患者具有较高的EGFR少见突变及KRAS突变率,同一患者不同病灶之间存在更高的驱动基因突变异质性,本研究将为“宣威”多结节NSCLC的诊疗策略提供更多的选择。

云南地区卵巢癌患者的基因同源重组缺陷状态和BRCA1/2基因突变频率及其临床意义

目的:采用基于中国人群单核苷酸多态性位点开发的同源重组缺陷(HRD)检测工具评估云南地区卵巢癌患者的HRD状态和BRCA1/2基因突变频率并探讨其临床意义。方法:共纳入2021年1月至2023年5月间在云南省肿瘤医院收治的卵巢癌患者248例,HRD状态采用基因组瘢痕评分法(GSS)(主要依据拷贝数的长度、类型、位置及基因组断片)或HRD评分法(杂合性缺失、端粒等位基因失衡及大片段移位等基因组不稳定事件的总和)进行评估,当组织样本的GSS≥50分或HRD评分≥42分者或检测到有害的BRCA1/2基因突变时HRD被定义为阳性。分析患者HRD状态与临床病理特征的关系。结果:248名卵巢癌患者中70.97%的患者HRD呈阳性,其中BRCA1/2基因突变率为30.65%。Ⅲ~Ⅵ期、高级别浆液腺癌的卵巢癌患者具有更高的HRD阳性率(均P<0.01),HRD评分更高的患者其合并其他基因突变的频率也越高(P<0.05)。HRD状态与卵巢癌的病理类型、临床分期和其他基因突变均有关联(均P<0.01)。结论:云南地区卵巢癌患者HRD阳性率较高,HRD阳性的卵巢癌患者可以从聚ADP核糖聚合酶(PARP)抑制剂治疗中获得更大的收益。

左、右半结肠癌患者分子生物学与临床病理特征分析

目的比较左半结肠癌(LCC)和右半结肠癌(RCC)患者下一代测序基因检测结果和临床病理特征。方法回顾性收集2022年1月至2023年6月该院分子诊断中心335例结肠癌患者的下一代测序技术基因检测结果及临床病例资料,分析LCC、RCC的分子生物学和临床病理特征。结果335例患者中LCC 267例,RCC 72例。与LCC患者比较,RCC患者肿瘤最大径≥5 cm占比(44.44%vs.14.83%)及BRAF(8.33%vs.3.04%)、PTEN(12.50%vs.3.80%)、PIK3CA(26.39%vs.10.65%)、SMAD4(16.90%vs.9.47%)基因突变率和微卫星高度不稳定型(MSI-H)占比(13.89%vs.1.52%)更高,TP53基因突变率(66.67%vs.82.51%)更低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论LCC、RCC患者的分子生物学和病理特征存在差异。

云南省肺癌患者表皮生长因子受体基因突变的临床特征分析

目的:探讨云南省肺癌患者表皮生长因子受体(EGFR)突变特征,为云南省肺癌的临床个体化靶向治疗提供依据。方法:收集云南省肿瘤医院2014年1月至2019年8月2967例行EGFR基因检测肺癌患者的人口学资料和临床资料,分析EGFR突变情况。结果:2967例肺癌患者的EGFR突变率为46.2%(1370/2967)。单因素分析显示,女性突变率高于男性(P<0.001);随年龄增长,突变率呈下降趋势(P=0.030);少数民族突变率高于汉族(P=0.012);无吸烟史患者突变率高于吸烟史患者(P<0.001);无饮酒史患者突变率高于饮酒史患者(P<0.001);无肺癌家族史患者突变率高于肺癌家族史患者(P=0.008);腺癌突变率高于鳞癌、腺鳞癌、小细胞癌及其他病理类型(P<0.001);早期患者突变率高于晚期患者(P<0.001);组织标本检测突变率高于细胞学检测和外周血检测(P<0.001);宣威地区突变率低于非宣威地区患者(P<0.001)。logistic多因素分析显示,仅性别(P<0.001)、年龄(P=0.036)、吸烟史(P<0.001)、病理类型(P<0.001)、标本类型(P<0.001)和是否宣威地区(P<0.001)是EGFR基因突变的独立影响因素,女性、不吸烟、腺癌、非宣威地区、病理组织标本、年轻肺癌患者更易发生EGFR基因突变。1370例EGFR突变患者的主要突变类型为19-Del和L858R,占38.2%。宣威地区G719X、G719X+L861Q、G719X+S768I和S768I的突变率高于非宣威地区(P<0.05);而19-Del、L858R、20-ins的突变率低于非宣威地区(P<0.05)。少数民族19-Del的突变率高于汉族(P<0.001);汉族G719X+L861Q的复合突变率高于少数民族(P=0.005)。结论:云南省肺癌患者EGFR突变率与亚洲和中国整体人群突变率相近,女性、不吸烟、腺癌、年轻患者EGFR突变率较高,宣威地区患者突变率较低。最常见的EGFR突变类型为19-Del和L858R,宣威地区以L858R突变为主,非宣威地区以19-Del为主。云南省肺癌患者稀有突变(G719X、G719X+L861Q、G719X+S768I、S768I)的突变率较高,宣威地区稀有突变率高于非宣威地区,汉族G719X+L861Q的复合突变率高于少数民族。

云贵高原地区非小细胞肺癌患者靶向治疗驱动基因的表达情况和突变特征

目的:探讨云贵高原地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者驱动基因的表达情况及其突变分布特征,为高发区肺癌的个体化分子靶向治疗提供依据。方法:收集云南省肿瘤医院2016年1月至2019年8月收治的行肺癌8基因[表皮生长因子受体(EGFR)、间变性淋巴瘤激酶(ALK)、鼠类肉瘤病毒癌基因(RAS)、RET原癌基因(RET)、鼠肉瘤病毒v-Raft同源致癌基因(BRAF)、肉瘤致癌因子(ROS1)、人表皮生长因子受体2(HER-2)、细胞间质上皮转化因子(MET)]联合检测的2249例NSCLC患者的临床病理资料,分析云贵高原地区NSCLC驱动基因的表达情况及其突变分布特征。结果:云贵高原地区NSCLC驱动基因表达的阳性率为67.05%(1508/2249),其中西双版纳、玉溪、宣威、红河和曲靖地区的阳性率较高,分别为76.92%、72.38%、71.88%、71.79%和71.24%;回族、哈尼族、壮族、布依族、满族、土家族和阿昌族患者的阳性率较高,分别为84.38%、85.00%、75.00%、100%、100%、100%和100%。NSCLC患者驱动基因的阳性率与性别(P<0.001)、吸烟史(P<0.001)、年龄(P<0.001)、病理类型(P<0.001)及是否宣威地区(P=0.027)有关,与民族(P=0.748)和肺癌家族史(P=0.676)无关。EGFR、RAS、BRAF、HER-2和MET基因突变率分别为44.46%、10.98%、1.24%、0.89%和0.76%,ALK、RET、ROS1基因重排率分别为4.67%、1.29%和0.89%。女性患者EGFR突变率为56.67%,高于男性患者(33.19%,P<0.001);男性患者RAS突变率为12.66%,高于女性患者(9.17%,P=0.010)。汉族患者RAS突变率为11.49%,高于少数民族患者(7.17%,P=0.032)。宣威地区患者RAS突变率为24.74%,高于非宣威地区患者(8.15%,P<0.001);而EGFR突变率为40.63%,低于非宣威地区患者(45.25%,P=0.045);ALK重排率为1.56%,低于非宣威地区患者(5.31%,P<0.001);宣威地区未检出HER-2突变患者。无吸烟史患者EGFR突变率为51.10%,高于有吸烟史患者(29.70%,P<0.001);无吸烟史患者ALK重排率为5.35%,也高于有吸烟史患者(3.16%,P<0.001);无吸烟史患者RAS突变率为9.34%,低于有吸烟史患者(14.63%,P=0.008)。结论:云贵高原地区NSCLC驱动基因表达的阳性率略低于全国平均水平,其中EGFR、RAS突变率与国内平均水平相近,ROS1、ALK和RET基因重排率以及BRAF、HER-2和MET基因突变率略低于全国平均水平。EGFR、RAS、ALK基因在云贵高原地区NSCLC患者中阳性率较高,且具有不同的人口学特征和临床特征,在选择靶向治疗人群中具有重要意义。