基于DNA甲基化的分子亚型可预测肝细胞癌患者的预后

目的研究甲基化位点联合基因表达预测肝细胞癌患者预后的作用。方法基于癌症基因组图谱数据库(TCGA)的424例肝细胞癌样本,通过COX比例风险回归分析筛选出具有独立预后能力的CpG位点,然后利用一致性聚类方法进行肿瘤分型,对差异CpG位点相应的启动子基因进行功能富集分析,最后根据分型差异分析构建甲基化位点的预后模型,以及Suivival、ROC曲线判断风险模型的临床应用价值。结果在癌组织和正常组织中成功筛选出具有独立预后能力的2248个差异甲基化位点,利用一致性聚类方法得到7个肿瘤亚组,亚组间的预后差异有统计学意义(P<0.05),亚组间临床特征如TMN分期、年龄、病理分期(Stage)和组织学分级(Grade)各不相同,这种临床差异和预后也密切关联。对差异甲基化位点相应的启动子基因进行功能富集分析,它们主要涉及RNA运输、细胞周期、p53信号通路和剪接体。多变量Cox回归构建肿瘤预后风险模型:风险评分=4.98×cg05489143-21.18×cg09600437+3.50×cg19165652+4.59×cg19569208+11.08×cg22732432+5.07×cg22958262-16.02×cg24153171+4.75×cg2545598。根据该模型计算,随着风险评分的增高,高风险组的生存时间虽然没有明显下降,但是死亡率明显升高。另外,高低风险两组的预后具有显著差异,同时,ROC曲线的AUC值为0.822。结论在癌组织和癌旁组织中成功筛选出2248个差异甲基化位点并通过一致性聚类方法得到7个肿瘤亚组,根据分型差异分析构建甲基化位点的预后模型,该模型可以很好地预测患者的存活率。

LINC00092介导谷氨酸的兴奋性毒性在肝性脑病中的作用机制

目的:探索LINC00092在肝性脑病(HE)的发生发展中的作用机制.方法:从基因表达数据库(GEO)下载芯片GSE57193的数据,并使用R-limma包筛选出HE组和健康对照组中的差异表达基因,接着利用R-clusterProfiler包对差异表达基因进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析.从miRcode数据库预测差异表达长链非编码RNA(LncRNA)靶向的miRNA,然后使用Targetscan、miRdb和miRTarBase预测miRNA靶向的mRNA,与差异表达mRNA取交集得到目标mRNA,Cytoscape用于构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络.通过RNA结合蛋白数据库预测LINC00092的结合蛋白,根据表达的相关性和RNA结合蛋白,提出LINC00092在肝性脑病中的机制假说.结果:从正常脑组织中筛选出HE的9个特异的LncRNA和728个特异的mRNA,其中LINC00092相对健康对照组在HE中特异性高表达.差异表达基因的KEGG富集分析显示它们主要集中在脂肪酸降解、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、矿物质的吸收、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的降解、β-丙氨酸新陈代谢、脂肪酸代谢通路上.结合ceRNA网络和LINC00092的结合蛋白,LINC00092在HE中可能存在3个调控路径:(1)LINC00092/hsa-miR206/GJA1轴介导谷氨酸的神经兴奋性毒性损伤;(2)LINC00092/hsa-miR184/LRRC8A轴介导星形胶质细胞的溶胀激活和ATP诱导的兴奋性氨基酸释放;(3)LINC00092-A2BP1轴介导的谷氨酸再摄取.结论:LINC00092在HE中特异性高表达,一方面通过半通道和体积调节阴离子通道介导谷氨酸的释放,同时使细胞内线粒体Ca2+超载而造成神经元功能障碍和细胞死亡,另一方面LINC00092-A2BP1轴介导的谷氨酸-谷氨酰胺循环障碍,导致谷氨酸的细胞外蓄积,两方面共同导致神经元的兴奋性毒性.

胃食管反流病内镜下治疗进展

胃食管反流病的治疗一直以来以质子泵抑制剂为主导,手术方式以腹腔镜胃底折叠术为主要方式,随着消化内镜内镜技术的进步,逐步演化出多种内镜下的新技术,它们具有住院天数短、症状评分下降明显、并发症少、经济等优势,如内镜下抗反流粘膜切除术、贲门缩窄术、射频消融术、胃底折叠术或缝合术等,本文对此类内镜技术进行综合叙述。

全科住院医师规范化培训的技能教学探索——以成人体重管理为例

目的目前国内的全科住培医师教育主要集中在疾病的诊断与治疗上,对慢性病管理教学较为缺乏,本文将以成人体重管理为例探讨住院医师规范化培训中的技能教学。方法与结果借鉴国内外有关超重、肥胖诊疗指南、临床实践从三方面制定教学内容:(1)提高学员们对肥胖患者的识别能力;(2)树立正确的诊断意识;(3)应用"ABCDEF"体重管理策略;并结合住院医师规范化培训的门诊教学,以教师示范-学员实践-师生反馈的方式制定教学实践计划。结论全科住院医师规范化培训将成为我国全科医生输出的最大体系,因此体重管理技能教学应是规范化培训内容的重要组成部分,尽管该教学方法的临床适应性仍需探索,但它定能促进全科教学技能的发展,为未来的"健康守门人"赋予更强大的岗位胜任力。