蛋白质组学分析小鼠动脉血栓揭示新的血栓调控通路

目的本研究采用蛋白质组学对小鼠动脉血栓相关蛋白进行分析,明确参与调控动脉血栓形成的蛋白分子。方法应用30%氯化铁诱导小鼠颈动脉血栓形成,收集带血栓的血管组(血栓组)和颈动脉假手术血管组(非血栓组)。使用非靶向无标记液相色谱⁃质谱联用蛋白质组学定量方法对样本进行蛋白质鉴定。绘制火山图、热图并进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路和蛋白质相互作用网络等生物信息学分析两组间显著差异表达蛋白(DEPs)。结果共鉴定出2896个血栓相关蛋白质,通过对血栓组与非血栓组蛋白质组学比较,火山图和热图展示了249个组间显著差异表达的蛋白(P<0.05,|Log2(fold change)|>2),其中211个表达显著上调,38个表达显著下调。GO分析和KEGG代谢通路富集分析显示,DEPs主要参与血小板活化(脱颗粒)、粘附、聚集,补体与凝血级联反应,内皮细胞受体交互作用,中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)形成等生物学过程。其中,TGFb1、ITGa6、LY6G6F、MPIG6B、FGA、NR3C1、PDLIM2、PDGFRA与动脉血栓发生密切相关。结论除凝血系统和血小板激活之外,补体系统、天然免疫反应释放的NETs可能参与动脉血栓形成。血栓关键蛋白的发现为血栓发生机制及防治提供了新研究方向和潜在干预靶点。

基于生物信息学分析花生四烯酸代谢在缺血性心脏病中的作用

目的 基于生物信息学分析缺血性心脏病(IHD)患者花生四烯酸代谢通路(AMP)基因差异表达情况,并探讨AMP基因在IHD发生与发展中的作用。方法 对IHD患者和健康对照者心脏组织转录组数据进行分析以鉴定差异表达基因,并运用机器学习算法筛选与IHD相关的AMP关键基因。这些核心基因被用于IHD诊断模型的开发和验证,并结合单细胞转录组数据进一步研究这些基因在IHD中的功能。结果 转录组数据分析显示,AMP基因在IHD中表达失调,并且鉴定出5个核心基因:PLA2G2A、CYP2J2、ACE、GPX3和EPHX2。基于这5个核心基因构建的模型在训练集和验证集中均表现出良好的诊断性能。这些核心基因主要在成纤维细胞和心肌细胞中表达,并与多种炎症因子及M2型巨噬细胞浸润高度相关。结论 PLA2G2A、CYP2J2、ACE、GPX3和EPHX2可作为IHD的诊断标志物,并与IHD中免疫细胞浸润密切相关。这些发现将为深入研究IHD疾病机制及开发靶向药物提供参考。

中性粒细胞胞外诱捕网在血栓形成中作用的研究进展

血栓栓塞性疾病是全球性重大健康问题。多项研究表明中性粒细胞与血栓形成密切相关。活化的中性粒细胞可以响应各种刺激释放中性粒细胞胞外诱捕网,激活凝血级联、补体系统和血小板等促进血栓形成,参与动脉血栓、静脉血栓和癌症相关血栓等各种血栓性疾病。本文就中性粒细胞胞外诱捕网在血栓形成中的作用机制进行总结,以期为抗栓治疗提供新靶点和新思路。