泛癌组织STIP1的表达与肿瘤免疫浸润及预后相关:基于生物信息学方法

目的本研究旨在对压力诱导磷酸蛋白1(STIP1)进行泛癌分析,探讨其表达水平与肿瘤预后的关系及其在免疫学中的作用。方法使用生物信息学方法分析TCGA、TARGET和GTEx数据库,研究STIP1在各种类型肿瘤组织中的表达及预后价值;采用免疫组化检测STIP1在10例配对结直肠癌组织以及正常组织中的表达情况;STIP1与肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定(MSI)的关系进一步被揭示;使用MCPcounter、TIMER分析STIP1的表达与免疫细胞的浸润情况;分析STIP1与免疫调节因子的相关性;根据各肿瘤中STIP1的最优截断值,将样本分为高低表达组;使用蛋白互作网络分析鉴定与STIP1相关的蛋白;通过功能富集分析寻找STIP1可能参与的调节通路。结果与正常组织相比,STIP1在大多数肿瘤中高表达(P<0.05),以及免疫组化的结果显示其在结直肠癌组织中高表达。STIP1的表达水平与多种类型肿瘤的临床分期相关(P<0.05)。在部分肿瘤中,STIP1的表达上调与肿瘤患者的不良预后(总体生存期、疾病特异性生存期、无病生存期和无进展生存期)显著相关(P<0.05)。STIP1表达与多种肿瘤的肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、免疫浸润以及免疫调节相关因子显著相关(P<0.05)。蛋白互作网络分析提示STIP1相关的蛋白有热休克蛋白A家族成员4、热休克蛋白A家族成员8、热休克蛋白90α家族A类成员1等。KEGG富集分析提示在肝癌组织中STIP1高表达可能与戊酸盐代谢、色氨酸代谢、丁酸盐代谢等通路有关;HALLMARK富集分析提示在肝癌组织中STIP1高表达可能与胆汁酸代谢、脂肪酸代谢等有关。结论STIP1在多数肿瘤中表达上调,STIP1与部分肿瘤的临床分期、不良预后、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、免疫细胞浸润以及免疫调节因子相关。

S100A4基因在肿瘤中作用机制的研究进展

肿瘤的发生与演进是多种因素协同参与、多基因共同作用、多阶段逐步发展的过程,这一过程涉及多种癌基因以及抑癌基因的异常改变。S100蛋白家族属于钙结合蛋白离子,此蛋白由2个EF一手型结构组成。S100蛋白含有能与钙离子高选择性、高亲和性的14个氨基酸序列,羧基端通常由2个氨基酸组成并与钙离子有较高的亲和性,当此区与钙离子结合后,S100蛋白构象发生改变,暴露出其与靶蛋白的结合位点，进而通过相应的靶蛋白发挥其生物效应。