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猪源G3BP1基因的稳定敲低PK-15细胞系构建及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
林馨倩
郭紫晶
+6 位作者
张瑞
向晗一
林含睿
黄雄挺
陈劲松
张志东
李彦敏
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期970-984,共15页
【背景】Ras-GTP酶活化蛋白SH3结构域结合蛋白1(Ras-GTPase-activating protein SH3 domain binding protein 1,G3BP1)是应激颗粒(stress granule,SG)的重要组成部分和标志性蛋白,在宿主抵抗病原体入侵过程中发挥重要作用。【目的】构建...
【背景】Ras-GTP酶活化蛋白SH3结构域结合蛋白1(Ras-GTPase-activating protein SH3 domain binding protein 1,G3BP1)是应激颗粒(stress granule,SG)的重要组成部分和标志性蛋白,在宿主抵抗病原体入侵过程中发挥重要作用。【目的】构建G3BP1稳定敲低的PK-15细胞系,探究敲低G3BP1基因对水泡性口炎病毒(vesicular stomatitis virus,VSV)、塞内卡病毒(seneca virus,SVV)和痘苗病毒(vaccinia virus,VACV)复制的影响和对肿瘤坏死因子-α(tumour necrosis factorα,TNF-α)、白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)、抗黏病毒蛋白1(myxovirus resistance protein 1,Mx1)、干扰素刺激基因54(IFN-stimulated gene 54,ISG54)和干扰素β(interferonβ,IFN-β)表达的影响,并对该基因进行生物信息学分析。【方法】利用慢病毒载体构建稳定敲低G3BP1基因的PK-15细胞系,利用逆转录实时定量PCR(reverse transcription quantitative real-time PCR,RT-qPCR)和实时定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)分析敲低G3BP1基因对VSV、SVV和VACV复制的影响,利用RT-qPCR分析感染VSV、SVV和VACV后敲低G3BP1基因对TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的影响,通过在线工具对G3BP1基因进行生物信息学分析。【结果】RT-qPCR和免疫印迹(Western blotting,WB)结果显示成功构建稳定敲低G3BP1的PK-15细胞系;RT-qPCR和qPCR结果显示敲低G3BP1基因可极显著促进VSV和SVV的复制(P<0.0001),但对VACV的复制无显著影响(P>0.05);RT-qPCR结果显示VSV和SVV感染可显著或极显著促进TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的mRNA表达水平(P<0.05,P<0.0001),敲低G3BP1基因可极显著抑制上述细胞因子的mRNA表达(P<0.01,P<0.0001),RT-qPCR结果显示VACV感染可以极显著抑制上述细胞因子的mRNA表达(P<0.01,P<0.0001),敲低G3BP1基因对VACV抑制的细胞因子mRNA表达无显著影响(P>0.05);理化性质预测结果显示,猪源G3BP1蛋白存在30个磷酸化位点,具有不稳定性和亲水性,属于非跨膜和非分泌蛋白;蛋白质高级结构预测显示,该蛋白的二级结构主要由无规则卷曲(52.47%)组成,主要定位于细胞质和细胞核中,分别占34.38%和31.25%。【结论】本研究获得了猪源G3BP1基因稳定敲低的PK-15细胞系,敲低该基因可极显著促进VSV和SVV的复制,但对VACV的复制无显著影响;敲低该基因可显著或极显著抑制TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的产生;预测该蛋白存在30个磷酸化位点,为非跨膜和非分泌蛋白,具有不稳定性和亲水性。这些结果可为进一步研究G3BP1在病毒感染过程中的作用机制提供工具和参考依据。
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关键词
PK-15细胞
G3BP1基因
细胞因子
生物信息学
原文传递
塞内卡病毒通过激活自噬降解FBXW7拮抗宿主的抗病毒应答
2
作者
向晗一
张瑞
+5 位作者
林馨倩
林含睿
黄雄挺
周泷
张志东
李彦敏
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期573-581,共9页
【背景】塞内卡病毒(seneca valley virus,SVV)可引起猪严重的水疱性疾病,但目前仍无商业化疫苗,解析其与宿主抗病毒分子的相互作用具有重要意义。【目的】探究E3泛素连接酶(F-box and WD repeat domain containing 7,FBXW7)在抗SVV感...
【背景】塞内卡病毒(seneca valley virus,SVV)可引起猪严重的水疱性疾病,但目前仍无商业化疫苗,解析其与宿主抗病毒分子的相互作用具有重要意义。【目的】探究E3泛素连接酶(F-box and WD repeat domain containing 7,FBXW7)在抗SVV感染中的作用及其机制。【方法】利用小干扰技术敲低PK-15细胞FBXW7,结合RT-qPCR、组织半数感染量(tissue culture infective dose 50%,TCID50)和Western blotting分析FBXW7对SVV在PK-15细胞中复制及细胞因子的影响。【结果】Western blotting结果显示,SVV感染能够抑制PK-15细胞中FBXW7蛋白表达水平;敲低FBXW7后促进SVV复制,同时炎性细胞因子IL-6、IFN-β、TNF-αmRNA水平均显著降低;进一步研究显示,敲低ATG5抑制自噬后抑制FBXW7蛋白降解,SVV复制水平下降。【结论】本研究发现FBXW7对SVV复制具有抑制作用,SVV通过激活自噬介导FBXW7降解,为研发抗病毒靶点提供了新策略。
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关键词
塞内卡病毒
FBXW7
自噬
细胞因子
原文传递
题名
猪源G3BP1基因的稳定敲低PK-15细胞系构建及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
林馨倩
郭紫晶
张瑞
向晗一
林含睿
黄雄挺
陈劲松
张志东
李彦敏
机构
西南民族大学动物医学四川省高校重点实验室
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期970-984,共15页
基金
西南民族大学引进高层次人才科研资助金项目(RQD202100)
四川省自然科学基金(2022NSFSC0073)
中央高校基本科研业务费专项基金(ZYN2023042)。
文摘
【背景】Ras-GTP酶活化蛋白SH3结构域结合蛋白1(Ras-GTPase-activating protein SH3 domain binding protein 1,G3BP1)是应激颗粒(stress granule,SG)的重要组成部分和标志性蛋白,在宿主抵抗病原体入侵过程中发挥重要作用。【目的】构建G3BP1稳定敲低的PK-15细胞系,探究敲低G3BP1基因对水泡性口炎病毒(vesicular stomatitis virus,VSV)、塞内卡病毒(seneca virus,SVV)和痘苗病毒(vaccinia virus,VACV)复制的影响和对肿瘤坏死因子-α(tumour necrosis factorα,TNF-α)、白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)、抗黏病毒蛋白1(myxovirus resistance protein 1,Mx1)、干扰素刺激基因54(IFN-stimulated gene 54,ISG54)和干扰素β(interferonβ,IFN-β)表达的影响,并对该基因进行生物信息学分析。【方法】利用慢病毒载体构建稳定敲低G3BP1基因的PK-15细胞系,利用逆转录实时定量PCR(reverse transcription quantitative real-time PCR,RT-qPCR)和实时定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)分析敲低G3BP1基因对VSV、SVV和VACV复制的影响,利用RT-qPCR分析感染VSV、SVV和VACV后敲低G3BP1基因对TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的影响,通过在线工具对G3BP1基因进行生物信息学分析。【结果】RT-qPCR和免疫印迹(Western blotting,WB)结果显示成功构建稳定敲低G3BP1的PK-15细胞系;RT-qPCR和qPCR结果显示敲低G3BP1基因可极显著促进VSV和SVV的复制(P<0.0001),但对VACV的复制无显著影响(P>0.05);RT-qPCR结果显示VSV和SVV感染可显著或极显著促进TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的mRNA表达水平(P<0.05,P<0.0001),敲低G3BP1基因可极显著抑制上述细胞因子的mRNA表达(P<0.01,P<0.0001),RT-qPCR结果显示VACV感染可以极显著抑制上述细胞因子的mRNA表达(P<0.01,P<0.0001),敲低G3BP1基因对VACV抑制的细胞因子mRNA表达无显著影响(P>0.05);理化性质预测结果显示,猪源G3BP1蛋白存在30个磷酸化位点,具有不稳定性和亲水性,属于非跨膜和非分泌蛋白;蛋白质高级结构预测显示,该蛋白的二级结构主要由无规则卷曲(52.47%)组成,主要定位于细胞质和细胞核中,分别占34.38%和31.25%。【结论】本研究获得了猪源G3BP1基因稳定敲低的PK-15细胞系,敲低该基因可极显著促进VSV和SVV的复制,但对VACV的复制无显著影响;敲低该基因可显著或极显著抑制TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的产生;预测该蛋白存在30个磷酸化位点,为非跨膜和非分泌蛋白,具有不稳定性和亲水性。这些结果可为进一步研究G3BP1在病毒感染过程中的作用机制提供工具和参考依据。
关键词
PK-15细胞
G3BP1基因
细胞因子
生物信息学
Keywords
PK-15 cells
G3BP1 gene
cytokine
bioinformatics
分类号
S852.4 [农业科学—基础兽医学]
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
塞内卡病毒通过激活自噬降解FBXW7拮抗宿主的抗病毒应答
2
作者
向晗一
张瑞
林馨倩
林含睿
黄雄挺
周泷
张志东
李彦敏
机构
西南民族大学动物医学四川省高校重点实验室
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期573-581,共9页
基金
中央高校基本科研业务费专项资金优秀学生培养工程项目(2022NYXXS023)
西南民族大学“双一流”项目(XM2023012)
四川省自然科学基金(2022NSFSC0073)。
文摘
【背景】塞内卡病毒(seneca valley virus,SVV)可引起猪严重的水疱性疾病,但目前仍无商业化疫苗,解析其与宿主抗病毒分子的相互作用具有重要意义。【目的】探究E3泛素连接酶(F-box and WD repeat domain containing 7,FBXW7)在抗SVV感染中的作用及其机制。【方法】利用小干扰技术敲低PK-15细胞FBXW7,结合RT-qPCR、组织半数感染量(tissue culture infective dose 50%,TCID50)和Western blotting分析FBXW7对SVV在PK-15细胞中复制及细胞因子的影响。【结果】Western blotting结果显示,SVV感染能够抑制PK-15细胞中FBXW7蛋白表达水平;敲低FBXW7后促进SVV复制,同时炎性细胞因子IL-6、IFN-β、TNF-αmRNA水平均显著降低;进一步研究显示,敲低ATG5抑制自噬后抑制FBXW7蛋白降解,SVV复制水平下降。【结论】本研究发现FBXW7对SVV复制具有抑制作用,SVV通过激活自噬介导FBXW7降解,为研发抗病毒靶点提供了新策略。
关键词
塞内卡病毒
FBXW7
自噬
细胞因子
Keywords
seneca valley virus
FBXW7
autophagy
cytokines
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪源G3BP1基因的稳定敲低PK-15细胞系构建及生物信息学分析
林馨倩
郭紫晶
张瑞
向晗一
林含睿
黄雄挺
陈劲松
张志东
李彦敏
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
原文传递
2
塞内卡病毒通过激活自噬降解FBXW7拮抗宿主的抗病毒应答
向晗一
张瑞
林馨倩
林含睿
黄雄挺
周泷
张志东
李彦敏
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
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