鉴定气单胞菌DNA条形码的筛选与评价

为筛选合适的DNA条形码对气单胞菌属(Aeromonas)进行鉴定,以33株气单胞菌为材料,选取cpn60、recA和ppsA 3个候选DNA条形码进行PCR扩增及序列分析。以种间和种内遗传距离、序列扩增测序成功率、DNA条形码间隙(DNA barcoding gap)和系统发育树作为评价条形码片段的指标,筛选出该属的DNA条形码。分析表明,cpn60基因的扩增及测序的成功率最高,种内遗传平均距离(0.017)和种间遗传平均距离(0.133)差异显著,且存在较明显的DNA barcoding gap,表明cpn60可作为气单胞菌鉴定的DNA条形码。

基于PCR技术的DNA marker的研制

20世纪70年代末至80年代初,由于近代生物学的不断发展,分子生物学、基因工程、DNA重组技术等的问世,基于生物遗传物质DNA为基础,从微观角度阐释生命活动规律成为研发的热点。在这些涉及核酸物质DNA的研发中,DNA marker是使用最为广泛的试剂之一,其能判断和指示核酸大小,