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基于网络药理学探索甘露饮药方治疗复发性口腔溃疡的作用机制
1
作者
林楚奇
张炆晗
+3 位作者
彭鲜
颜杨
周琳
周学
《生物医学》
2024年第2期121-132,共12页
目的:运用网络药理学的方法探索甘露饮药方治疗复发性口腔溃疡(Recurrent Oral Ulcer, ROU)的活性成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM获取甘露饮药方单味中药有效成分及相关靶点,利用PubChem...
目的:运用网络药理学的方法探索甘露饮药方治疗复发性口腔溃疡(Recurrent Oral Ulcer, ROU)的活性成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM获取甘露饮药方单味中药有效成分及相关靶点,利用PubChem、NovoPro等数据库进行活性成分靶点预测并用UniProt数据库矫正靶点,利用人类基因数据库GeneCards筛选复发性口腔溃疡的疾病靶点,采用Venny 2.1工具将药物靶点和疾病靶点做交集,通过STRING数据库和Cytoscape 3.10.0软件绘制中药–成分–靶点网络以及蛋白相互作用(PPI)网络,使用Metascape数据库进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果:共筛选出166个活性成分,与疾病交集靶点278个。主要活性成分包括光甘草定、苏荠黄酮、黄芩新素、黄芩黄酮、去甲汉黄芩素、槲皮素、异鼠李素、山奈酚等;PPI靶点预测出的核心靶点共10个,包括STAT3,SRC,PIK3CA,PIK3R1,PIK3CD,AKT1,EGFR,HSP90AA1,ESR1,PTPN11;KEGG富集分析显示,与甘露饮治疗复发性口腔溃疡有关的通路包括化学致癌–受体激活通路、癌症中的蛋白聚糖、催乳素信号通路、幽门螺杆菌感染中的上皮细胞信号传导、脂肪细胞因子信号通路等。结论:初步验证了甘露饮治疗复发性口腔溃疡药效基础,可为复发性口腔溃疡治疗提供理论基础。
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关键词
复发性口腔溃疡
网络药理学
甘露饮
活性成分
作用机制
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题名
基于网络药理学探索甘露饮药方治疗复发性口腔溃疡的作用机制
1
作者
林楚奇
张炆晗
彭鲜
颜杨
周琳
周学
机构
南京师范大学泰州学院化学与生物工程学院
出处
《生物医学》
2024年第2期121-132,共12页
文摘
目的:运用网络药理学的方法探索甘露饮药方治疗复发性口腔溃疡(Recurrent Oral Ulcer, ROU)的活性成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM获取甘露饮药方单味中药有效成分及相关靶点,利用PubChem、NovoPro等数据库进行活性成分靶点预测并用UniProt数据库矫正靶点,利用人类基因数据库GeneCards筛选复发性口腔溃疡的疾病靶点,采用Venny 2.1工具将药物靶点和疾病靶点做交集,通过STRING数据库和Cytoscape 3.10.0软件绘制中药–成分–靶点网络以及蛋白相互作用(PPI)网络,使用Metascape数据库进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果:共筛选出166个活性成分,与疾病交集靶点278个。主要活性成分包括光甘草定、苏荠黄酮、黄芩新素、黄芩黄酮、去甲汉黄芩素、槲皮素、异鼠李素、山奈酚等;PPI靶点预测出的核心靶点共10个,包括STAT3,SRC,PIK3CA,PIK3R1,PIK3CD,AKT1,EGFR,HSP90AA1,ESR1,PTPN11;KEGG富集分析显示,与甘露饮治疗复发性口腔溃疡有关的通路包括化学致癌–受体激活通路、癌症中的蛋白聚糖、催乳素信号通路、幽门螺杆菌感染中的上皮细胞信号传导、脂肪细胞因子信号通路等。结论:初步验证了甘露饮治疗复发性口腔溃疡药效基础,可为复发性口腔溃疡治疗提供理论基础。
关键词
复发性口腔溃疡
网络药理学
甘露饮
活性成分
作用机制
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学探索甘露饮药方治疗复发性口腔溃疡的作用机制
林楚奇
张炆晗
彭鲜
颜杨
周琳
周学
《生物医学》
2024
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