白菜基因组导入芥菜的远缘杂交及后代分离偏向性

【目的】研究远缘杂交将结球白菜的A基因组导入包心芥菜,利用高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)结合InDel标记辅助选择技术,筛选出保留白菜基因较多的回交后代,改良包心芥的结球性,丰富包心芥菜的种质资源。【方法】利用幼胚培养技术辅助6份包心芥菜与2份结球白菜进行远缘杂交和回交,选取20个InDel标记追踪白菜A基因组全部染色体,从192的BC1单株中筛选出白菜A基因组标记占比较高的单株。田间调查筛选结球性近似结球白菜的单株。【结果】远缘杂交结合幼胚培养获得了9个种间杂种组合和14个BC1群体。筛选并获得203个在全基因组分布均匀的可区分白菜与芥菜的HRM-InDel标记;利用20个InDel标记追踪192株BC1单株的白菜基因,分离群体偏向传递白菜基因组,有54棵单株标记含量超过90%。【结论】幼胚培养技术可提高白菜与芥菜远缘杂交后回交的结实率,并可加快育种进程;筛选出了白菜基因组占比较高的组合和单株;分离群体明显偏向于传递白菜基因。

大熊猫9个BAC的测序、注释和进化分析

本文构建了相当于大熊猫10倍基因组覆盖度的BAC文库,并随机挑选了其中9个BAC进行测序和组装,9个BAC的选择满足更多基因更少重复序列的原则.这9个BAC的组装将为评估基于新一代IlluminaGA测序技术的大熊猫全基因组测序及组装的准确性提供有效资源.运用同源比对和从头预测的方法,对9个BAC,共约878kb的序列进行了基因和重复序列的注释以及进化分析.一共预测到12个蛋白编码基因,其中,7个基因匹配到同源基因的功能注释.这7个基因平均大小约41kb,编码区平均大小约1.2kb,每个基因平均约含6个外显子.同时预测到7个tRNA基因.大约27%的序列被注释为重复序列.同时,基于邻接法,构建了包含人、小鼠、狗、猫以及大熊猫5个物种的物种进化树,结果显示狗的基因与其他4个物种相比距大熊猫最近.本实验结果提供了大熊猫9个BAC的详细序列及注释信息,为对大熊猫的研究提供了数据资源.