浙江大学林爱福研究员团队揭示LncRNA通过液-液相分离机制调控Hippo信号活化

本刊编委、浙江大学林爱福研究员团队于2021年7月15日在国际知名期刊Cell Research上在线发表了题为“A phosphatidic acid-binding LncRNA SNHG9 facilitates LATS1 liquid-liquid phase separation to promote oncogenic YAP signaling”的研究论文(https://doi.org/10.1038/s41422-021-00530-9)。该研究发现磷脂酸结合型LncRNA(长链非编码RNA)SNHG9(小核仁RNA宿主基因9)通过调控Hippo信号节点激酶LATS1(大型肿瘤抑制因子1)相分离.

斑马鱼Cyclin C的cDNA克隆及其在发育过程中的表达

细胞周期蛋白C(cyclin C)与细胞周期依赖性蛋白激酶cdk8结合,通过磷酸化RNA聚合酶Ⅱ和TFIIH调控转录.在脊椎动物胚胎发育过程中有关细胞周期蛋白C合子型转录激活机制尚知甚少.本研究克隆了斑马鱼细胞周期蛋白C基因,并用Northern杂交和整体原位杂交技术检测其在胚胎发育过程中的表达状态.结果显示,斑马鱼细胞周期蛋白C高度保守,与人细胞周期蛋白C有88%的蛋白序列同源;斑马鱼细胞周期蛋白C在母型期开始表达,其表达伴随中囊胚转换时期的合子型转录激活以及整个胚胎发育过程.

兔血清白蛋白和IgG的分离纯化与鉴定

目的:以兔血清白蛋白和IgG的分离纯化与鉴定实验为例,阐述了血清蛋白制备与分析的过程。方法:使用了硫酸铵分级沉淀、凝胶过滤层析、DEAE离子交换层析、亲和层析、醋酸纤维薄膜电泳、SDS-PAGE、HPLC等分离纯化鉴定蛋白质的方法。结果:制备了兔血清白蛋白和γ-球蛋白(IgG),测定被分离物质的相对分子量,鉴定纯化产品的均一性。结论:该实验作为一门生物综合性大型实验,非常有利于培养学生掌握蛋白质制备与分析的综合技能。

线粒体基因编辑技术研究进展

线粒体DNA(mtDNA)突变会导致多种遗传病的发生。mtDNA编辑技术作为新兴的治疗手段基本基于蛋白质识别靶点,核酸识别型mtDNA编辑技术较少。以锌指核酸酶技术、转录激活因子样效应核酸酶技术、碱基编辑技术为代表的蛋白质识别型mtDNA编辑技术取得了一定进展,但识别序列设计复杂的弊端阻碍其进一步推广。CRISPR/Cas9等核酸识别型编辑技术以其结构简单、易于设计和修饰的特色展现出优越性,但缺乏将核酸递送进入线粒体的有效手段限制了其在mtDNA编辑领域的应用。随着对内源性、外源性导入途径的研究和DNA修复机制的深化理解,越来越多的证据表明核酸递送的可行性和核酸识别型mtDNA编辑技术的广阔应用前景。本文基于识别元件分类,总结了当前线粒体基因编辑技术的原理和发展现状,展望了核酸识别型mtDNA编辑技术的潜在价值。

五种江蓠切段离体培养的研究

江蓠是重要的经济红藻，是目前制造琼胶的主要原料之一。近年来，由于琼胶在工、农、医药等方面的用途日益广泛，特别是农业上作为细菌肥料和医药上作为微生物培养基，对江蓠的需求量日益增多。随着琼胶制造业的迅速发展，引起了人们对江蓠养殖的重视，同时也大大促进了江蓠养殖业的发展。

长链非编码RNA编码小肽的生物医学意义及研究策略

长链非编码RNA(lncRNA)通常认为不具有蛋白质编码能力,广泛参与细胞增殖、信号转导等生命过程。但近年来研究表明,部分lncRNA的短开放阅读框(sORF)可编码具有生物活性的短于100个氨基酸的小肽,在钙离子稳态、胚胎发育等生命活动及恶性肿瘤的发生发展中发挥作用,是潜在的药物靶点和癌症生物标志物。目前大多采用生物信息学工具预测可编码的sORF、核糖体图谱筛选潜在编码的lncRNA、体外翻译初步检测lncRNA的编码能力、质谱鉴定潜在翻译的小肽、特异性抗体及表位标签验证小肽的内源性表达等。本文介绍了近年来鉴定的lncRNA编码小肽的生理功能、病理作用以及预测lncRNA编码潜力的研究策略。

核酸类药物的修饰和递送研究进展

核酸类药物是在基因水平上发挥作用的RNA或DNA。目前应用较多的有核酸适配体、反义寡核苷酸、信使RNA、微RNA、小干扰RNA、小激活RNA等。核酸类药物临床应用面临稳定性差、靶向性弱、难以跨越体内屏障等难题。通过核酸化学结构修饰可以提高部分核酸药物在体内的稳定性、靶向性,提高递送效率,同时降低药物的免疫原性;应用核酸类药物载体可以帮助药物到达病灶,有助于核酸类药物实现更高效的内体逃逸,促进药物在体内发挥作用。目前应用较多的递送载体有病毒载体、脂质纳米粒、聚合物纳米载体、无机纳米载体、蛋白载体、外泌体等。目前,单独的修饰或递送载体尚不足以克服众多障碍,将核酸化学结构修饰与药物递送系统相结合有望实现更好的治疗效果,但后者技术难度和临床转化成本也随之增加。针对更加简单实用、低毒高效、精准递送核酸药物载体和核酸化学结构修饰的研发将成为核酸药物研发的热点方向。本文综述了核酸类药物的修饰和递送研究进展,讨论了提高核酸类药物递送效率的对策,以期为核酸类药物的转化应用提供参考。

YB1在肝癌细胞中通过抑制microRNA生物合成调控miR-205/200b-ZEB1轴

背景与目的Y-box结合蛋白(YB1或YBX1)在肿瘤发生和癌症进展中发挥关键作用。然而,YB1是否可以通过调节非编码RNAs来影响肿瘤的恶性转化仍是未知的。本研究旨在探讨YB1与microRNAs之间的关系,并揭示YB1通过miRNAs介导的调控网络影响肿瘤进展的潜在机制。方法通过细胞增殖、伤口愈合和Transwell侵袭实验,研究YB1在肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)细胞中的生物学功能。在HCC细胞系中进行微阵列分析,筛选YB1引起失调的miRNAs。通过实时荧光定量PCR、双荧光素酶报告基因、RNA免疫沉淀和pull-down实验分析YB1对miR-205和miR-200b的调控。通过pull-down实验和免疫共沉淀实验确定了YB1、DGCR8、Dicer、TUT4和TUT1之间的关系。采用免疫荧光染色法检测YB1、DGCR8和Dicer的细胞共定位。通过BALB/c裸鼠尾静脉注射转染了YB1 shRNA或shControl的MHCC97H细胞,检测YB1在体内对肿瘤转移的影响。采用免疫印迹法和免疫组化法检测上皮细胞向间充质转化标志物的表达水平。结果YB1不依赖Snail途径,通过调控miR-205/200b-ZEB1轴促进HCC细胞迁移和肿瘤转移。YB1与微处理器DGCR8和Dicer以及通过保守序列CSD(code shock domain)与尿苷酸末端转移酶TUT4及TUT1发生相互作用,抑制miR-205和miR-200b生物合成。随后,下调的miR-205和miR-200b增强了ZEB1的表达,从而促进细胞迁移和侵袭。此外,对肝癌细胞和正常肝组织的基因表达数据进行统计分析,发现YB1表达与ZEB1表达呈正相关,与临床预后显著相关。结论本研究揭示了YB1通过调节肝癌细胞中miR-205/200b-ZEB1轴促进肿瘤进展的新机制。研究结果还表明,YB1可能通过miRNAs介导的基因调控来发挥其生物学功能,可作为治疗癌症的潜在靶点。

斑节对虾摄食量与生长率的研究

本文在室内条件（水温24～28℃，盐度28～33．5）下以缢蛏鲜肉为饵料，对不同体长组斑节对虾的摄食量、生长速率等问题进行研究，得出斑节对虾体长（L）、体重（W）与摄食量（F）、摄食率（Ri）、生长率（Rg）和增重量（ΔW）的关系如下：W＝0．0112L3．1148F＝0．5625W0．1266Ri＝56．24W－0．2731Rg＝14．18W－0．5352ΔW＝0．0956W0．5552文中分析了对虾养殖池的生态特点，讨论了对虾中后期养殖管理过程中的某些对策问题。