IFITM3单核苷酸多态性与急性白血病的患病风险评估

分别探讨IFITM3基因3个位点(rs3888188、rs7478728、rs7479267)单核苷酸多态性与急性髓系白血病、急性淋巴细胞白血病、男性急性白血病、女性急性白血病的患病风险。方法 共收集437例研究对象,使用SNaPshot测序并对结果进行统计分析。结果 rs7478728和rs7479267的CT基因型、C等位基因、(CT+CC)联合基因均表明是急性髓系白血病的保护性因子。结论 IFITM3基因位点rs7478728和rs7479267的部分基因变异可能与急性髓系白血病的患病风险呈负相关。

泌尿道解葡萄糖苷棒状杆菌的分离、鉴定和药敏分析

目的:对临床分离的解葡萄糖苷棒状杆菌进行鉴定和药敏分析,为临床用药提供参考。方法:将从我院泌尿系统结石致尿路感染患者中段尿标本中分离得到的2株菌株接种至哥伦比亚血平板和麦康凯平板上,观察其生长情况并计数;采用基质辅助激光解析飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)检测菌株的蛋白质谱图;提取菌株DNA,采用聚合酶链反应扩增其16S核糖体RNA(r RNA)序列,对片段大小约为1 500 bp的目标条带进行双向测序,并与Gen Bank数据库进行Blast比对,鉴定菌种;采用Etest法监测2株菌株的耐药情况。结果:2株菌株在哥伦比亚血平板上生长(菌落数>105CFU/m L),在麦康凯平板上不生长;均为革兰氏阳性棒状杆菌,多呈栅栏样或八字形排列。MALDI-TOF-MS鉴定其均为解葡萄糖苷棒状杆菌,可信度为99.9%,在m/z 2 431、3 089、3 364、3 378、4 200、5 508、6 302、6 637、6 730、6 946、12 603处出现特征峰;Blast比对结果显示,2株菌株与Gen Bank中已知解葡萄糖苷棒状杆菌的序列同源性超过98%。药敏试验结果显示,菌株1对头孢曲松、环丙沙星耐药,对青霉素G等其他14种抗菌药物敏感;菌株2对头孢曲松、红霉素、环丙沙星、四环素、克林霉素耐药,对头孢噻肟中介,对其他10种抗菌药物敏感。结论:2株菌株均为解葡萄糖苷棒状杆菌,对常用抗菌药物的耐药性有所差异。该菌为罕见的泌尿道病原菌,且呈多重耐药,临床应根据菌株鉴定及药敏试验结果合理选用抗菌药物。

MALDI-TOFMS和VITEK 2鉴定临床常见酵母菌的性能比较

目的本研究从准确性、时间和成本3方面评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与VITEK 2全自动细菌鉴定及药敏分析仪鉴定临床常见酵母菌的性能。方法采用MALDI-TOF MS和Vitek2鉴定144株酵母菌,鉴定结果不一致时进行16S rRNA基因测序分析,同时计算鉴定每株菌所消耗的试剂成本及检测时间。结果 144株酵母菌,包括7个属和7个种,MALDI-TOF MS将142(98.6%)株菌鉴定到属水平,142(98.6%)株菌鉴定到种水平。VITEK 2将139(96.5%)株菌鉴定到属水平,135(93.8%)株菌鉴定到种水平。130(90.3%)株菌经2种方法鉴定,结果完全一致。两种方法鉴定不一致的菌株有14株,MALDI-TOF MS和VITEK 2鉴定错误率分别1.4%、6.3%。2种方法鉴定酵母菌到属水平的准确率,差异无统计学意义(P>0.05),但鉴定到种水平的准确率和鉴定错误率差异有统计学意义(P<0.05)。MALDITOF MS上机操作时间(1.2±0.2)min,鉴定时间(1.3±0.1)min;VITEK 2上机操作时间(3.5±0.3)min,鉴定时间(1098.3±13.1)min;MALDI-TOF MS鉴定每株菌的试剂成本为(12.5±0.2)元,VITEK 2为(68.4±0.5)元,2种方法鉴定酵母菌的时间和试剂成本,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 MALDI-TOF MS具有操作简便、快速、成本低、错误鉴定率低的优点,在鉴定临床常见酵母菌上性能优于VITEK 2,该技术有可能在鉴定临床常见酵母菌上取代传统的生化鉴定方法。

MALDI-TOF MS鉴定临床微生物的研究进展

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是近年发展起来的一种新型软电离质谱技术,其准确、简便、快速、廉价、高通量的特点为微生物的鉴定带来革命性的变化。本文对MALDI-TOF MS的原理、微生物鉴定、时间成本3个内容进行综述。