基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在临床微生物鉴定中的应用

基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术是近年发展起来的一种软电离新型有机质谱,它可以在几分钟内直接对平皿中或标本中的菌落进行鉴定。这种新而简单的方法大大降低了耗材成本和鉴定诊断时间。可靠性和准确性已在许多研究报告中得以证明,不同的系统设备也已在市场销售,在不久的将来,该项技术会在实际应用中拥有更加广阔的前景。MALDI-TOF MS将会成为替代传统人类病原体微生物鉴定手段的革新技术。本文将回顾MALDI-TOF MS的原理、发展、应用情况、与传统方法相比的优势及现阶段存在的局限性,着重强调该项技术在微生物系统的应用特点。

耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌的临床分布特点及耐药性分析

目的通过检测和分析深圳市耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)的临床分布特点以及耐药性,为指导临床抗生素的使用以及防止该类菌在深圳地区播散和蔓延提供科学依据。方法本实验室2015年1月~2016年10月通过全市耐药监测网筛选的美罗培南最低抑菌浓度(MIC)≥2μg/ml肠杆菌科细菌,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和VITEK-II全自动微生物分析仪完成细菌鉴定,用Kirby-Bauer(K-B)法完成药物敏感实验,用改良Hodge试验(MHT)完成耐碳青霉烯酶测定,并对临床CRE的耐药情况进行统计分析。结果本研究150株CRE细菌类型:肺炎克雷伯菌88株、大肠埃希菌21株、阴沟肠杆菌17株,粘质沙雷菌8株、变形菌7株、产气肠杆菌5株以及其他4株。细菌分布:中心重症监护室(ICU)64株、呼吸重症监护室(RICU)22株、神经外科16株、急诊监护室10株、普外科10株、呼吸科8株、老年及高等病房7株、门诊5株、其他8株。细菌来源:痰液71株、引流液22株、穿刺液17株、血液12株、尿液11株、分泌液9株、其他8株。临床上CRE对常用抗菌药物均具有较高的耐药性,除了阿米卡星为47.45%,其余均超过70.00%。结论肠杆菌科细菌对碳青霉烯类药的耐药机制在不同国家和地区之间存在差异,深圳市作为一个移民城市,外来人口居多,人口流动量大,必须寻找一种快速、准确的CRE鉴定及耐药机制检测试验方法 ,为临床抗感染治疗提供更快、更准确的检测数据,为患者尤其是危重症患者的治疗争取更多的时间,以及为控制该类菌在本地区播散和蔓延提供科学依据。

采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定血液中分离的人型支原体

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（atrixassisted laser desorption ionization—time of flight masss pectrometry，MALDI—TOFMS）技术是近年发展起来的一种软电离新型有机质谱，可在几分钟内直接对培养皿生长的或标本中本身的菌落进行鉴定分类。

基于全基因组测序技术分析深圳市人民医院2008—2016年碳青霉烯类耐药大肠埃希菌的耐药基因及分子流行病学特征

目的:用全基因组测序技术分析深圳市人民医院2008—2016年碳青霉烯类耐药大肠埃希菌(CR-ECO)的耐药基因构成情况及相关分子流行病学特征。方法:收集深圳市人民医院2008年1月1日至2016年12月31日的CR-ECO菌株,采用改良碳青霉烯类失活法和EDTA碳青霉烯类失活法进行表型确证,并采用llumina HiSeq进行二代测序,分析其耐药基因及相关分子生物学特征。结果:共收集CR-ECO非重复菌株16株,经过全基因组测序发现携带IMP-4基因5株,IMP-26基因1株,NDM-1基因1株,NDM-5基因4株,NDM-13基因2株。16株菌株中检测出AmpC酶和(或)超广谱β内酰胺酶(ESBL)基因及各类外排泵基因,11株CR-ECO出现OmpC膜孔蛋白基因缺失;多位点序列分型、血清学分型呈多样化。结论:深圳市人民医院2008—2016年CR-ECO的耐药机制主要以产IMP型或NDM型碳青霉烯酶同时合并AmpC酶和(或)ESBL为主。利用全基因组测序可快速了解菌株在基因水平上的分子生物学信息。

深圳地区孕期妇女甲状腺功能指标参考区间的初步调查

目的：探讨深圳地区孕早、中、晚期妇女甲状腺功能指标分布特征，建立深圳地区孕期妇女甲状腺功能指标的参考范围。方法选择2012年12月至2013年6月就诊于深圳市人民医院的334名健康孕早期妇女、272名健康孕中期妇女、271名健康孕晚期妇女以及77名非孕期妇女。检测4组人群甲状腺功能指标水平，包括游离三碘甲状腺原氨酸（ FT3）、游离甲状腺素（ FT4）、促甲状腺素（ TSH）、三碘甲状腺原氨酸（ TT3）、甲状腺素（ TT4），建立孕早、中、晚期甲状腺功能指标的参考区间。结果 TSH在孕早期开始下降，孕中期开始逐渐回升，孕早、中、晚期的TSH参考值范围分别为0．08～4．39、0．41～4．16、0．30～5．46 mIU/L；FT4在孕中期开始逐渐下降，孕早、中、晚期的FT4参考值范围分别为7．74～14．58、6．81～12．00、6．36～10．99 pmol/L； FT3在孕早期稍有上升，后逐渐下降，孕早、中、晚期的FT3参考值范围分别为3．59～5．59、3．34～4．91、3．09～4．58 pmol/L。结论深圳地区孕期妇女甲状腺功能指标与健康对照组妇女相比差异有统计学意义，建立深圳地区孕早、中、晚期妇女甲状腺功能指标的参考区间有重要临床意义。

深圳14例布鲁菌病患者临床特点与实验室分析

目的分析布鲁菌病(布病)病例临床及相关实验室检查结果,为布病的临床及实验室鉴别诊断提供依据。方法采用回顾性分析方法,选择2015年12月至2019年8月深圳市人民医院检验科微生物室检测确诊的布病病例作为调查对象,收集调查对象的临床资料,包括流行病学特征、临床表现、实验室检测结果、治疗及预后,进行评价分析。结果14例患者中男性9例,女性5例,年龄中位数(范围)为42(23~62)岁。患者的首诊时间集中在4-9月,占78.6%(11/14)。有明确生牛羊猪肉、羊胎盘接触史占78.6%(11/14)。发热和关节肿痛为主要临床症状,分别占100.0%(14/14),42.9%(6/14)。关节炎是最常见的并发症,占3/7。实验室结果显示,白细胞计数均不升高,C反应蛋白升高者9例,肝功能异常者9例,血沉升高者8例,血培养阳性报警时间中位数(范围)为69(48~110)h。14例患者中,7例预后良好,4例因并发症多次住院治疗,2例预后不明,1例确诊前已死亡。结论布病临床表现复杂,实验室检查无特异性,需血培养确诊。在临床诊断过程中应详细询问流行病学资料,避免误诊及漏诊。微生物检验人员应掌握布鲁菌的微生物学特征,提高鉴别能力。