大豆FCS-like Zinc Finger家族基因的生物信息学鉴定

FCS-like Zinc Finger (FLZ)是一类植物特有的基因家族,在植物生长发育以及对逆境胁迫的响应中有着重要的调控作用。然而,目前对于大豆FLZ家族基因特征和功能的研究仍然缺乏。本研究利用Hmmsearch方法从大豆基因组中鉴定了40个FLZ (GmFLZs)基因,并分析了GmFLZ基因家族的蛋白理化性质、基因结构、启动子顺式作用元件、进化和基因表达等特征。结果表明,Gm FLZ蛋白平均氨基酸数目为220.7,均为亲水性蛋白。进化分析表明Gm FLZ蛋白可分为7个亚组。GmFLZ基因启动子序列中有丰富的与光信号、激素和胁迫响应相关的顺式作用元件。GmFLZ家族基因分布于20条染色体上,之间未发现串联重复,而有28个基因参与片段重复。共线性分析表明15个GmFLZ基因同时与绿豆和拟南芥FLZ基因间存在同源关系。Ka/Ks分析结果表明GmFLZ基因在进化过程中经历了不同的进化方向。蛋白质Docking模拟结果表明GmFLZ7和GmFLZ9可与SnRK1α亚基对接。本研究结果为阐明大豆FLZ家族基因的功能提供了参考。