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一株猪丹毒丝菌的全基因组测序及SpaA基因分析
1
作者
彭凌
林锦铨
+2 位作者
李玲慧
刘博婷
蔡巩林
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第3期694-698,共5页
本研究测定猪丹毒丝菌临床毒株SG7的全基因组序列,并运用生物信息学方法对测定的全基因组序列及猪丹毒丝菌表面保护性抗原A基因(SpaA)进行分析。SG7菌株的基因组全长为1834291.00 bp,G+C含量为36.3%,基因总数1846个。将SG7菌株与GenBank...
本研究测定猪丹毒丝菌临床毒株SG7的全基因组序列,并运用生物信息学方法对测定的全基因组序列及猪丹毒丝菌表面保护性抗原A基因(SpaA)进行分析。SG7菌株的基因组全长为1834291.00 bp,G+C含量为36.3%,基因总数1846个。将SG7菌株与GenBank中8条完整的猪丹毒丝菌全基因组序列进行比较,发现国内外不同菌株间基因组的基本信息存在不同程度差异。基于全基因组单核苷酸多态性(SNPs)的系统发育分析结果表明,9株菌株聚为3个分支,国内菌株并不完全处于同一分支,SG7菌株与国内常见菌株不属于同一进化分支。SpaA基因高变区的分析结果显示,9株菌株亦可分为3个SpaA型,SG7菌株为携带Met203的高致病性菌株。除SG7菌株外,其他8株菌株的SpaA基因分型结果与基于全基因组SNPs分析的结果一致,说明SG7菌株的遗传背景复杂。本研究结果可为猪丹毒丝菌基因组整体水平研究和疫苗的研发奠定基础。
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关键词
猪丹毒丝菌
全基因组测序
表面保护性抗原A(SpaA)
下载PDF
职称材料
猪丹毒丝菌spaA基因的敲除及其致病作用的初步研究
2
作者
陈富海
林晓君
+5 位作者
凃彦芳
刘博婷
余璐
蔡巩林
林锦铨
彭凌
《韶关学院学报》
2020年第3期46-51,共6页
为阐明SpaA在猪丹毒丝菌致病中的作用,以临床分离的猪丹毒丝菌野生强毒株为材料采用DNA重组技术构建spaA基因敲除载体,并利用该敲除载体通过同源重组敲除强毒株的spaA基因,比较强毒株和敲除株对小鼠毒力的差异.结果表明敲除株相比野生...
为阐明SpaA在猪丹毒丝菌致病中的作用,以临床分离的猪丹毒丝菌野生强毒株为材料采用DNA重组技术构建spaA基因敲除载体,并利用该敲除载体通过同源重组敲除强毒株的spaA基因,比较强毒株和敲除株对小鼠毒力的差异.结果表明敲除株相比野生株对小鼠的毒力降低102倍,这说明SpaA与猪丹毒丝菌的致病性有关.
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关键词
猪丹毒丝菌
spaA基因
基因敲除
同源重组
下载PDF
职称材料
猪丹毒丝菌SpaA蛋白的表达与纯化
3
作者
刘博婷
李肇高
+4 位作者
严舒焕
李荣君
蔡巩林
林锦铨
彭凌
《生物技术》
CAS
2020年第1期12-16,共5页
[目的]在大肠杆菌中表达猪丹毒丝菌spaA基因并纯化重组蛋白。[方法]利用PCR扩增猪丹毒丝菌临床分离株spaA基因,构建重组质粒p GEX-4T-1-spaA,转化大肠杆菌BL21(DE3)进行诱导表达融合蛋白GST-SpaA,并优化表达条件。最后采用GST琼脂糖纯...
[目的]在大肠杆菌中表达猪丹毒丝菌spaA基因并纯化重组蛋白。[方法]利用PCR扩增猪丹毒丝菌临床分离株spaA基因,构建重组质粒p GEX-4T-1-spaA,转化大肠杆菌BL21(DE3)进行诱导表达融合蛋白GST-SpaA,并优化表达条件。最后采用GST琼脂糖纯化树脂纯化,SDS-PAGE和Western Blotting检测。[结果]成功扩增spaA基因,获得重组表达菌株BL21(DE3)/p GEX-4T-1-spaA;在菌体OD600为0.9时,加入IPTG至终浓度0.1 mmol/L,34℃诱导6 h的条件下表达效果最好。经SDS-PAGE检测和纯化后得到大小为97 kDa的GST-SpaA;Western Blotting检测结果表明,GST-SpaA具有良好的免疫原性。[结论]成功在大肠杆菌中表达了SpaA蛋白,经纯化得到具有免疫原性的重组蛋白,为后续研制猪丹毒丝菌SpaA蛋白亚单位疫苗奠定基础。
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关键词
猪丹毒丝菌
表达
spaA基因
纯化
原文传递
题名
一株猪丹毒丝菌的全基因组测序及SpaA基因分析
1
作者
彭凌
林锦铨
李玲慧
刘博婷
蔡巩林
机构
韶关学院英东生物与农业学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第3期694-698,共5页
基金
广东省自然科学基金项目(2017A030307041)
国家级大学生创新创业训练计划项目(201910576002)。
文摘
本研究测定猪丹毒丝菌临床毒株SG7的全基因组序列,并运用生物信息学方法对测定的全基因组序列及猪丹毒丝菌表面保护性抗原A基因(SpaA)进行分析。SG7菌株的基因组全长为1834291.00 bp,G+C含量为36.3%,基因总数1846个。将SG7菌株与GenBank中8条完整的猪丹毒丝菌全基因组序列进行比较,发现国内外不同菌株间基因组的基本信息存在不同程度差异。基于全基因组单核苷酸多态性(SNPs)的系统发育分析结果表明,9株菌株聚为3个分支,国内菌株并不完全处于同一分支,SG7菌株与国内常见菌株不属于同一进化分支。SpaA基因高变区的分析结果显示,9株菌株亦可分为3个SpaA型,SG7菌株为携带Met203的高致病性菌株。除SG7菌株外,其他8株菌株的SpaA基因分型结果与基于全基因组SNPs分析的结果一致,说明SG7菌株的遗传背景复杂。本研究结果可为猪丹毒丝菌基因组整体水平研究和疫苗的研发奠定基础。
关键词
猪丹毒丝菌
全基因组测序
表面保护性抗原A(SpaA)
Keywords
Erysipelothrix rhusiopahiae
whole-genome sequencing
surface protective antigen A(SpaA)
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
猪丹毒丝菌spaA基因的敲除及其致病作用的初步研究
2
作者
陈富海
林晓君
凃彦芳
刘博婷
余璐
蔡巩林
林锦铨
彭凌
机构
韶关学院英东生物与农业学院
出处
《韶关学院学报》
2020年第3期46-51,共6页
基金
广东省自然科学基金资助项目(2017A030307041)
广东省大学生创新创业训练计划资助项目(201810576040)
广东省科技创新战略专项资金——“攀登计划”专项资金(pdjh2020b0537).
文摘
为阐明SpaA在猪丹毒丝菌致病中的作用,以临床分离的猪丹毒丝菌野生强毒株为材料采用DNA重组技术构建spaA基因敲除载体,并利用该敲除载体通过同源重组敲除强毒株的spaA基因,比较强毒株和敲除株对小鼠毒力的差异.结果表明敲除株相比野生株对小鼠的毒力降低102倍,这说明SpaA与猪丹毒丝菌的致病性有关.
关键词
猪丹毒丝菌
spaA基因
基因敲除
同源重组
Keywords
Erysipelothrix rhusiopathiae
spaA gene
gene knockout
homologous recombination technology
分类号
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
猪丹毒丝菌SpaA蛋白的表达与纯化
3
作者
刘博婷
李肇高
严舒焕
李荣君
蔡巩林
林锦铨
彭凌
机构
韶关学院英东生物与农业学院
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所-韶关学院动物疫病诊断中心联合实验室
出处
《生物技术》
CAS
2020年第1期12-16,共5页
基金
广东省自然科学基金项目(2017A030307041)
粤北生猪生产及疫病防控协同创新发展中心资助项目
+2 种基金
2018年度广东省大学生创新创业训练计划资助项目(201810576039)
韶关学院生态学重点扶持学科(230079030101)
2020年广东省科技创新战略专项资金-“攀登计划”专项资金(pdjh2020b0537)。
文摘
[目的]在大肠杆菌中表达猪丹毒丝菌spaA基因并纯化重组蛋白。[方法]利用PCR扩增猪丹毒丝菌临床分离株spaA基因,构建重组质粒p GEX-4T-1-spaA,转化大肠杆菌BL21(DE3)进行诱导表达融合蛋白GST-SpaA,并优化表达条件。最后采用GST琼脂糖纯化树脂纯化,SDS-PAGE和Western Blotting检测。[结果]成功扩增spaA基因,获得重组表达菌株BL21(DE3)/p GEX-4T-1-spaA;在菌体OD600为0.9时,加入IPTG至终浓度0.1 mmol/L,34℃诱导6 h的条件下表达效果最好。经SDS-PAGE检测和纯化后得到大小为97 kDa的GST-SpaA;Western Blotting检测结果表明,GST-SpaA具有良好的免疫原性。[结论]成功在大肠杆菌中表达了SpaA蛋白,经纯化得到具有免疫原性的重组蛋白,为后续研制猪丹毒丝菌SpaA蛋白亚单位疫苗奠定基础。
关键词
猪丹毒丝菌
表达
spaA基因
纯化
Keywords
Erysipeiothrix rhusiopahiae
expression
spaA gene
purification
分类号
S855.99 [农业科学—临床兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株猪丹毒丝菌的全基因组测序及SpaA基因分析
彭凌
林锦铨
李玲慧
刘博婷
蔡巩林
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
2
猪丹毒丝菌spaA基因的敲除及其致病作用的初步研究
陈富海
林晓君
凃彦芳
刘博婷
余璐
蔡巩林
林锦铨
彭凌
《韶关学院学报》
2020
0
下载PDF
职称材料
3
猪丹毒丝菌SpaA蛋白的表达与纯化
刘博婷
李肇高
严舒焕
李荣君
蔡巩林
林锦铨
彭凌
《生物技术》
CAS
2020
0
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