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小麦KNOX基因家族鉴定与生物信息学分析
被引量:
6
1
作者
宋宁宁
梁慧慧
+7 位作者
安义伟
柏胜龙
麻菲菲
张震
李浩
周云
郭光辉
宋纯鹏
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第7期2105-2117,共13页
KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。然而,关于小麦KNOX基因家族的研究很少。本研究利用生物信息学手段从小麦基因组中鉴定到分布于18条染色体上的36个KNOX基因,所有鉴定...
KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。然而,关于小麦KNOX基因家族的研究很少。本研究利用生物信息学手段从小麦基因组中鉴定到分布于18条染色体上的36个KNOX基因,所有鉴定到的家族成员均含有KNOX1或KNOX2结构域。本研究对KNOX基因家族的系统进化、基因结构、蛋白结构域、顺式作用元件和基因表达模式进行了分析。根据其系统发育关系,将小麦KNOX基因分为ClassⅠ和ClassⅡ两大亚类,两亚类又进一步分为5个进化分支。大多数小麦KNOX基因含有典型KNOX1、KNOX2、ELK、HOX四个蛋白保守结构域。小麦KNOX基因的启动子分析发现了一些与激素、生长发育和胁迫响应相关的顺式作用调控元件。不同组织器官转录组数据分析显示,ClassⅠ类KNOX基因具有明显的组织特异性,ClassⅡ类KNOX基因的表达部位更广泛。本研究为进一步分析小麦KNOX基因家族的功能和调控机制提供了重要信息。
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关键词
小麦
KNOX基因家族
基因结构
基因表达
原文传递
单细胞组学技术及其在植物保卫细胞研究中的应用
被引量:
2
2
作者
牛艳丽
柏胜龙
+1 位作者
王麒云
刘凌云
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期788-796,共9页
单细胞组学技术在动物研究中已经得到广泛应用,但在植物学领域尤其是保卫细胞研究中还处于起步阶段。由保卫细胞构成的气孔承担着植物生命过程中水分散发及气体交换大门的作用。将单细胞组学技术应用到保卫细胞功能解析中将有助于了解...
单细胞组学技术在动物研究中已经得到广泛应用,但在植物学领域尤其是保卫细胞研究中还处于起步阶段。由保卫细胞构成的气孔承担着植物生命过程中水分散发及气体交换大门的作用。将单细胞组学技术应用到保卫细胞功能解析中将有助于了解保卫细胞参与的基本生理过程。该文综述了植物单细胞组学技术的发展、保卫细胞研究现状及单细胞组学技术在植物保卫细胞研究中的初步应用,为借助该技术解决植物生物学中保卫细胞发育、代谢及对环境胁迫响应等基本问题提供研究思路和方法。
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关键词
单细胞
保卫细胞
功能分析
信号转导
原文传递
题名
小麦KNOX基因家族鉴定与生物信息学分析
被引量:
6
1
作者
宋宁宁
梁慧慧
安义伟
柏胜龙
麻菲菲
张震
李浩
周云
郭光辉
宋纯鹏
机构
河南大学生命科学学院省部共建作物逆境适应与改良国家重点实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第7期2105-2117,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31901547)
中国博士后基金项目(2018M642741)
河南省博士后科研项目(001801-013)共同资助。
文摘
KNOX基因家族是编码同源异型盒蛋白的转录因子,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。然而,关于小麦KNOX基因家族的研究很少。本研究利用生物信息学手段从小麦基因组中鉴定到分布于18条染色体上的36个KNOX基因,所有鉴定到的家族成员均含有KNOX1或KNOX2结构域。本研究对KNOX基因家族的系统进化、基因结构、蛋白结构域、顺式作用元件和基因表达模式进行了分析。根据其系统发育关系,将小麦KNOX基因分为ClassⅠ和ClassⅡ两大亚类,两亚类又进一步分为5个进化分支。大多数小麦KNOX基因含有典型KNOX1、KNOX2、ELK、HOX四个蛋白保守结构域。小麦KNOX基因的启动子分析发现了一些与激素、生长发育和胁迫响应相关的顺式作用调控元件。不同组织器官转录组数据分析显示,ClassⅠ类KNOX基因具有明显的组织特异性,ClassⅡ类KNOX基因的表达部位更广泛。本研究为进一步分析小麦KNOX基因家族的功能和调控机制提供了重要信息。
关键词
小麦
KNOX基因家族
基因结构
基因表达
Keywords
Wheat
KNOX gene family
Gene structure
Gene expression
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
单细胞组学技术及其在植物保卫细胞研究中的应用
被引量:
2
2
作者
牛艳丽
柏胜龙
王麒云
刘凌云
机构
河南大学生命科学学院
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期788-796,共9页
基金
河南省自然科学基金(No.162300410008)
河南省高等学校重点科研项目(No.15A180012)
文摘
单细胞组学技术在动物研究中已经得到广泛应用,但在植物学领域尤其是保卫细胞研究中还处于起步阶段。由保卫细胞构成的气孔承担着植物生命过程中水分散发及气体交换大门的作用。将单细胞组学技术应用到保卫细胞功能解析中将有助于了解保卫细胞参与的基本生理过程。该文综述了植物单细胞组学技术的发展、保卫细胞研究现状及单细胞组学技术在植物保卫细胞研究中的初步应用,为借助该技术解决植物生物学中保卫细胞发育、代谢及对环境胁迫响应等基本问题提供研究思路和方法。
关键词
单细胞
保卫细胞
功能分析
信号转导
Keywords
single cell, guard cells, functional analysis, signaling
分类号
Q942 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦KNOX基因家族鉴定与生物信息学分析
宋宁宁
梁慧慧
安义伟
柏胜龙
麻菲菲
张震
李浩
周云
郭光辉
宋纯鹏
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022
6
原文传递
2
单细胞组学技术及其在植物保卫细胞研究中的应用
牛艳丽
柏胜龙
王麒云
刘凌云
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
原文传递
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