基于单细胞RNA测序及生物信息学分析AFAP1L1在胃癌中的临床意义

目的分析肌动蛋白丝相关蛋白1相似蛋白1(AFAP1L1)在胃癌(GC)中的预后价值和分子功能。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)的大量RNA测序数据,以及来自基因表达综合(GEO)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据。采用Kaplan-Meier生存分析验证AFAP1L1的预后价值。富集分析探讨AFAP1L1的潜在生物学功能。另外,本研究确定AFAP1L1和抗肿瘤药物敏感性的关系。在单细胞水平上分析AFAP1L1的表达特征。结果AFAP1L1在GC患者中过表达与预后不良相关并参与血管生成的调控。此外,AFAP1L1与达沙替尼和福瑞替尼等抗肿瘤药物的敏感性相关。单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析显示,AFAP1L1主要表达于GC样本中的内皮细胞中。结论基于生物信息学分析研究结果,AFAP1L1可以作为GC的预后生物标志物。