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不同海拔高度低氧环境差异对EPAS1基因多态性的影响 被引量:10
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作者 柯金坤 姚宇峰 +8 位作者 刘舒媛 史磊 于亮 林克勤 陶玉芬 史荔 易文 黄小琴 褚嘉祐 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期583-588,共6页
目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对内皮PAS蛋白1基因(endothelial PAS domain protein1,EPAS1)的选择作用。方法选取西藏藏族58名(居住海拔约3700米)、青海藏族47名(居住海拔约3100米)、云南藏族43名(居住海拔约2500米)、... 目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对内皮PAS蛋白1基因(endothelial PAS domain protein1,EPAS1)的选择作用。方法选取西藏藏族58名(居住海拔约3700米)、青海藏族47名(居住海拔约3100米)、云南藏族43名(居住海拔约2500米)、山东汉族47名(居住海拔约50米)的4个不同海拔高度的群体,应用限制性片段长度多态性一聚合酶链反应技术检测EPAS1基因的14个单核苷酸多态性位点。结果在4个群体中,山东汉族、云南藏族与西藏藏族、青海藏族在大部分位点的等位基因频率、基因型频率以及单倍型频率的差异具有统计学意义;但在山东汉族与云南藏族之间的差异无统计学意义。结论海拔高度不同引起的低氧环境差异有可能对基因EPASj有选择作用。 展开更多
关键词 内皮PAS蛋白1 单核苷酸多态性 低氧环境 海拔 限制性片段长度多态性
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三个不同海拔藏族群体HIF1A基因九个单核苷酸多态性位点研究 被引量:5
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作者 柯金坤 姚宇峰 +8 位作者 史磊 于亮 林克勤 陶玉芬 史荔 易文 黄小琴 孙浩 褚嘉祏 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期584-589,共6页
目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对基因缺氧诱导因子1a基因(hypoxia inducible factor 1 alpha,HIF1A)的选择作用。方法选取世居于西藏、青海、云南的3个不同海拔高度的藏族群体,利用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术检... 目的研究不同海拔高度的低氧环境差异对基因缺氧诱导因子1a基因(hypoxia inducible factor 1 alpha,HIF1A)的选择作用。方法选取世居于西藏、青海、云南的3个不同海拔高度的藏族群体,利用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术检测HIF1A基因的9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点。结果所有非同义突变SNP位点的基因型频率与等位基因型频率在3个藏族群体之间差异无统计学意义,而rs11549465位点的基因型频率在云南藏族分别与西藏藏族和青海藏族之间差异有统计学意义(P〈0.05)。4个内含子SNP位点基因型频率与等位基因频率在西藏藏族与青海藏族之间差异均无统计学意义;但在西藏藏族和青海藏族分别与云南藏族比较时,基因型频率与等位基因频率差异均有统计学意义(P〈0.05),且跟海拔差异有相关性。结论海拔高度不同引起的低氧环境差异有可能对HIF1A基因有选择作用。 展开更多
关键词 藏族群体 缺氧诱导因子1Α 单核苷酸多态性 低氧环境 海拔 限制性片段长 度多态性
原文传递
GPx4基因调控区单核苷酸多态性与寡弱精症男性不育的相关性 被引量:1
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作者 刘舒媛 张昌军 +9 位作者 司小敏 姚宇峰 史磊 柯金坤 于亮 史荔 杨昭庆 黄小琴 孙浩 褚嘉祐 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期270-274,共5页
目的研究磷脂氢谷胱甘肽过氧化酶(phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase,PHGPx或GPx4)基因5’非翻译区(5’untranslated region,5'-UTR)区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与寡弱精症男性不... 目的研究磷脂氢谷胱甘肽过氧化酶(phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase,PHGPx或GPx4)基因5’非翻译区(5’untranslated region,5'-UTR)区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与寡弱精症男性不育的相关性。方法采用测序的方法,对131例寡弱精症男性不育患者和109名健康已育男性的GPx4基因的5LUTR区域进行测序分析。结果测序结果与美国国立生物技术信息中心数据库对比,发现该区域有9个SNPs(rs757228、rs757229、rs757230、rs4588110、rs3746165、rs3746166、rs34044728、rs757231、rs1808194)位点在所检测的人群中存在多态性分布,但这9个位点的等位基因和基因型频率在病例组和对照组中的差异没有统计学意义。对9个多态位点进行连锁不平衡分析,发现rs757229、rs757230、rs4588110、rs3746165、rs3746166五个位点连锁,对连锁的SNP构建单倍型后发现,单倍型(rs757229-rs757230-rs4588110-rs3746165-rs3746166:c—GGT—A)只在正常对照组中出现,而患者组中没有,该单倍型可能是一种保护性的单倍型。结论GPx4基因5'-UTR区域的SNPs(rs757228、rs757229、rs757230、rs4588110、rs3746165、rs3746166、rs34044728、rs757231、rs1808194)与寡弱精症男性不育可能不相关,单倍型(rs757229rs757230-rs4588110-rs3746165-rs3746166:C—GGT—A)可能降低男性不育的患病风险。 展开更多
关键词 磷脂氢谷胱甘肽过氧化酶 单核苷酸多态性 寡弱精症男性不育
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