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皮肤鳞状细胞癌免疫细胞浸润与基因富集分析
1
作者
柳若冰
郑德义
李伟人
《医学综述》
CAS
2024年第6期761-768,共8页
目的通过生物信息学方法分析皮肤鳞状细胞癌(CSCC)中免疫细胞浸润相关基因差异表达及其意义。方法从基因表达数据库(GEO)搜索并下载CSCC数据集,经过检索及筛选得到临床信息GSE45216和GSE108008两个数据集,使用R语言CIBERSORT函数分析免...
目的通过生物信息学方法分析皮肤鳞状细胞癌(CSCC)中免疫细胞浸润相关基因差异表达及其意义。方法从基因表达数据库(GEO)搜索并下载CSCC数据集,经过检索及筛选得到临床信息GSE45216和GSE108008两个数据集,使用R语言CIBERSORT函数分析免疫细胞浸润情况,以及它们在CSCC组和对照组中的差异性。使用vioplot软件绘制差异细胞的小提琴图,R软件clusterProfiler包对靶基因通过基因本体(GO)功能注释和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路数据库进行信号通路富集分析。结果与对照组相比,CSCC组中380个差异表达基因,其中76个上调基因、304个下调基因,通过分析差异表达基因筛选排名前10的关键基因分别为人乳铁蛋白、G蛋白偶联受体1、RPTN、天冬氨酰氨基葡糖苷酶、PAN3、烟酰胺N-甲基转移酶、分泌粒蛋白5、叶酸受体3、维甲酸诱导蛋白14、多肽N-乙酰半乳糖氨基转移酶14;CSCC发生发展中导致浆细胞数量增加,M1型巨噬细胞数量减少,记忆性CD4+T细胞为高浸润性,且细胞溶解活性与嗜酸粒细胞呈正相关(r=0.530,P<0.001),而与M2型巨噬细胞呈显著负相关(r=-0.570,P<0.001),影响CSCC预后。GO富集分析显示,基因功能主要与角质细胞分化、细胞防御、存在于细胞膜或细胞核内的蛋白酶体有关。KEGG信号通路富集显示,差异表达基因主要参与胆固醇代谢、脂肪酸等脂质代谢通路。结论部分免疫细胞浸润及其相关基因差异表达在CSCC发生过程及其预后中起重要作用,角质细胞分化、脂质代谢信号通路改变可能与CSCC的发病机制密切相关。
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关键词
皮肤鳞状细胞癌
免疫细胞浸润
差异表达基因
GEO数据库
生物信息分析
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职称材料
股前外侧或股前内侧穿支皮瓣修复皮肤鳞状细胞癌切除后皮肤软组织缺损的临床效果
2
作者
柳若冰
郑德义
+1 位作者
王宝云
李伟人
《中华烧伤与创面修复杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期564-571,共8页
目的探讨股前外侧或股前内侧穿支皮瓣修复皮肤鳞状细胞癌(CSCC)切除后皮肤软组织缺损的临床效果。方法该研究为回顾性观察性研究。2015年7月-2022年7月,贵州省人民医院烧伤整形科收治21例CSCC患者,其中男15例、女6例,年龄27~74岁。CSCC...
目的探讨股前外侧或股前内侧穿支皮瓣修复皮肤鳞状细胞癌(CSCC)切除后皮肤软组织缺损的临床效果。方法该研究为回顾性观察性研究。2015年7月-2022年7月,贵州省人民医院烧伤整形科收治21例CSCC患者,其中男15例、女6例,年龄27~74岁。CSCC扩大切除后皮肤软组织缺损面积为7.5 cm×4.0 cm~23.0 cm×8.5 cm。18例患者创面采用股前外侧穿支皮瓣修复;术中观察到3例患者旋股外侧动脉降支穿支血管存在变异,采用股前内侧穿支皮瓣修复创面。皮瓣面积为8.0 cm×5.0 cm~25.0 cm×10.0 cm。将19例患者供瓣区创面直接缝合,采用对侧大腿薄中厚皮片修复2例患者供瓣区创面。观察术后皮瓣成活情况及血管危象发生情况。记录手术时长和住院天数。术后随访时,观察患者肿瘤复发情况、供受区外形、供瓣区功能等。末次随访时,评估患者对疗效的满意度。结果20例患者术后皮瓣成活;1例患者于术后48 h内发生血管危象,立即行急诊手术处理后皮瓣成活。患者手术时长为4~5 h,住院15~38 d。术后随访1~6年见局部肿瘤无复发;皮瓣色泽、质地与周围组织差异不大,弹性良好,外形较佳;2例患者供瓣区皮片存活良好,出现局部色素沉着;所有患者供瓣区仅有线状瘢痕,感觉及运动功能无明显影响。末次随访时,对疗效满意者15例、一般者6例。结论对于CSCC切除后皮肤软组织缺损,可优先采用股前外侧穿支皮瓣修复,在旋股外侧动脉降支穿支血管存在变异的情况下,选择股前内侧穿支皮瓣修复。2种皮瓣切取面积大,可根据缺损组织量调整皮瓣面积,精准有效修复CSCC切除后皮肤软组织缺损,术后外观及功能良好。
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关键词
创伤和损伤
穿支皮瓣
癌
皮肤鳞状细胞癌
血管变异
创面修复
原文传递
题名
皮肤鳞状细胞癌免疫细胞浸润与基因富集分析
1
作者
柳若冰
郑德义
李伟人
机构
贵州医科大学临床医学院
贵州省人民医院烧伤整形科
出处
《医学综述》
CAS
2024年第6期761-768,共8页
文摘
目的通过生物信息学方法分析皮肤鳞状细胞癌(CSCC)中免疫细胞浸润相关基因差异表达及其意义。方法从基因表达数据库(GEO)搜索并下载CSCC数据集,经过检索及筛选得到临床信息GSE45216和GSE108008两个数据集,使用R语言CIBERSORT函数分析免疫细胞浸润情况,以及它们在CSCC组和对照组中的差异性。使用vioplot软件绘制差异细胞的小提琴图,R软件clusterProfiler包对靶基因通过基因本体(GO)功能注释和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路数据库进行信号通路富集分析。结果与对照组相比,CSCC组中380个差异表达基因,其中76个上调基因、304个下调基因,通过分析差异表达基因筛选排名前10的关键基因分别为人乳铁蛋白、G蛋白偶联受体1、RPTN、天冬氨酰氨基葡糖苷酶、PAN3、烟酰胺N-甲基转移酶、分泌粒蛋白5、叶酸受体3、维甲酸诱导蛋白14、多肽N-乙酰半乳糖氨基转移酶14;CSCC发生发展中导致浆细胞数量增加,M1型巨噬细胞数量减少,记忆性CD4+T细胞为高浸润性,且细胞溶解活性与嗜酸粒细胞呈正相关(r=0.530,P<0.001),而与M2型巨噬细胞呈显著负相关(r=-0.570,P<0.001),影响CSCC预后。GO富集分析显示,基因功能主要与角质细胞分化、细胞防御、存在于细胞膜或细胞核内的蛋白酶体有关。KEGG信号通路富集显示,差异表达基因主要参与胆固醇代谢、脂肪酸等脂质代谢通路。结论部分免疫细胞浸润及其相关基因差异表达在CSCC发生过程及其预后中起重要作用,角质细胞分化、脂质代谢信号通路改变可能与CSCC的发病机制密切相关。
关键词
皮肤鳞状细胞癌
免疫细胞浸润
差异表达基因
GEO数据库
生物信息分析
Keywords
Cutaneous squamous cell carcinoma
Immune cell infiltration
Differentially expressed genes
GEO database
Bioinformatics analysis
分类号
R34 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
股前外侧或股前内侧穿支皮瓣修复皮肤鳞状细胞癌切除后皮肤软组织缺损的临床效果
2
作者
柳若冰
郑德义
王宝云
李伟人
机构
贵州医科大学附属金阳医院皮肤科
贵州医科大学临床医学院
贵州省人民医院烧伤整形科
出处
《中华烧伤与创面修复杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期564-571,共8页
基金
国家自然科学基金地区科学基金项目(81760021)。
文摘
目的探讨股前外侧或股前内侧穿支皮瓣修复皮肤鳞状细胞癌(CSCC)切除后皮肤软组织缺损的临床效果。方法该研究为回顾性观察性研究。2015年7月-2022年7月,贵州省人民医院烧伤整形科收治21例CSCC患者,其中男15例、女6例,年龄27~74岁。CSCC扩大切除后皮肤软组织缺损面积为7.5 cm×4.0 cm~23.0 cm×8.5 cm。18例患者创面采用股前外侧穿支皮瓣修复;术中观察到3例患者旋股外侧动脉降支穿支血管存在变异,采用股前内侧穿支皮瓣修复创面。皮瓣面积为8.0 cm×5.0 cm~25.0 cm×10.0 cm。将19例患者供瓣区创面直接缝合,采用对侧大腿薄中厚皮片修复2例患者供瓣区创面。观察术后皮瓣成活情况及血管危象发生情况。记录手术时长和住院天数。术后随访时,观察患者肿瘤复发情况、供受区外形、供瓣区功能等。末次随访时,评估患者对疗效的满意度。结果20例患者术后皮瓣成活;1例患者于术后48 h内发生血管危象,立即行急诊手术处理后皮瓣成活。患者手术时长为4~5 h,住院15~38 d。术后随访1~6年见局部肿瘤无复发;皮瓣色泽、质地与周围组织差异不大,弹性良好,外形较佳;2例患者供瓣区皮片存活良好,出现局部色素沉着;所有患者供瓣区仅有线状瘢痕,感觉及运动功能无明显影响。末次随访时,对疗效满意者15例、一般者6例。结论对于CSCC切除后皮肤软组织缺损,可优先采用股前外侧穿支皮瓣修复,在旋股外侧动脉降支穿支血管存在变异的情况下,选择股前内侧穿支皮瓣修复。2种皮瓣切取面积大,可根据缺损组织量调整皮瓣面积,精准有效修复CSCC切除后皮肤软组织缺损,术后外观及功能良好。
关键词
创伤和损伤
穿支皮瓣
癌
皮肤鳞状细胞癌
血管变异
创面修复
Keywords
Wounds and injuries
Perforator flap
Carcinoma
Cutaneous squamous cell carcinoma
Vascular variation
Wound repair
分类号
R739.5 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
皮肤鳞状细胞癌免疫细胞浸润与基因富集分析
柳若冰
郑德义
李伟人
《医学综述》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
股前外侧或股前内侧穿支皮瓣修复皮肤鳞状细胞癌切除后皮肤软组织缺损的临床效果
柳若冰
郑德义
王宝云
李伟人
《中华烧伤与创面修复杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
已选择
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