灰盖拟鬼伞GH9家族内切葡聚糖酶的生物信息学分析

真菌能够诱导分泌纤维素酶,其中GH9家族蛋白是其中具有内切葡糖酶活性的纤维素酶成员之一.本研究利用生物信息学方法,分析了灰盖拟鬼伞GH9蛋白(Cc_GH9)的编码基因序列、基本理化性质、信号肽、亚细胞定位、跨膜螺旋、二级结构、三级结构、磷酸化位点、O-糖基化修饰位点、功能结构域、系统进化以及基序分析,为该基因后续的生理功能研究奠定基础,也为灰盖拟鬼伞纤维素酶的开发提供新思路.结果表明:Cc_GH9基因含有10个内含子,编码基因全长1770nt,编码589个氨基酸.Cc_GH9的N端前21个氨基酸为信号肽序列,为分泌性蛋白,定位于胞外,是稳定亲水性蛋白,在556~578位氨基酸为跨膜螺旋部分,属于跨膜蛋白.二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,在29个丝氨酸(S)上、17个苏氨酸(T)上和17个酪氨酸(Y)上可能发生磷酸化修饰,在182位丝氨酸(S)处可能发生O-糖基化修饰,含有Glyco_hydro_9保守结构域,与拟鬼伞Coprinopsis marcescibilis的GH9蛋白亲缘关系最近,包含3个基序.

毛头鬼伞漆酶基因的预测及其生物信息学分析

毛头鬼伞培养液具有较强的漆酶活性,漆酶在基质中木质素的降解和子实体的发育中发挥着重要作用。目前,人们已经完成毛头鬼伞基因组的测序,且数据已经释放至公共数据库中,但并未注释。为了掌握毛头鬼伞中漆酶的基因数量及其特征,基于已报道的毛头鬼伞漆酶蛋白的氨基酸序列,通过同源预测的方法从其基因组上预测获得21个漆酶基因,并采用ProtParam、SignalP5.0、Sompa、TMHMM2.0、SWISS-MODEL和WoLF PSORT等生物信息学工具对其中20个相应漆酶蛋白进行预测,分析其基本理化特性、信号肽、二级结构、跨膜结构、三级结构和亚细胞定位等。研究结果可为毛头鬼伞漆酶基因的克隆及分子作用机制等研究提供参考。

4种鬼伞β-1,3-葡聚糖转移酶的生物信息学分析

鬼伞是一类菌柄能在短时间内快速伸长并且伞盖易自溶形成墨汁的蘑菇,菌柄在伸长过程中细胞壁以伸长生长为主,细胞壁组分β-1,3-葡聚糖发生重构修饰,GH72家族的β-1,3-葡聚糖转移酶能够将较低聚合度的寡糖转化生成更高聚合度的糖链。β-1,3-葡聚糖转移酶可能参与鬼伞菌柄细胞壁中β-葡聚糖组分的重构修饰。以完成测序并有注释信息的灰盖拟鬼伞(Coprinopsis cinerea)、拟鬼伞(Coprinopsis marcescibilis)、晶粒小鬼伞(Coprinellus micaceus)和小脆柄菇(Psathyrella aberdarensis)等4种鬼伞的β-1,3-葡聚糖转移酶的氨基酸序列为基础,采用TargetP、WOLF PSORT、SignalP、Sompa、TMHMM 2.0、Big-PI Fungal Predictor、MEME和SISS-MODEL等生物信息学分析工具对其开展蛋白质亚细胞定位、细胞信号肽、二级结构、跨膜螺旋、糖基化磷脂酰肌醇(GPI)锚定位点、基序以及三级结构等进行分析,同时对上述序列开展遗传进化关系分析。研究结果可为进一步深入开展该蛋白在菌柄伸长过程中细胞壁β-葡聚糖组分的重构修饰研究作基础。

拼画:吉祥如意

材质:灵芝、香菇、荷叶离褶伞、羊肚菌、鹿角芝释义:利用灵芝子实体的天然色泽、形状、纹理创作形色逼真的“如意”,用鹿角芝做“如意”飘带,用多个大小不同的灵芝菌盖叠加呈现“二龙戏珠”的“珠”和“龙”,在“珠“”龙”之下,用海鲜菇、羊肚菌、仙麻菇、银耳、香菇组合出“宝珠”和“宝珠之光”,再添“吉祥”元素,丰满整体图画。整副图画密而不稠,稀而不空,疏密有致,用“如意”制作“如意”,用“吉祥”表达“吉祥”,以形表意,构思奇巧,寓意美好。

拼画:祥瑞仙芝

拼画:祥瑞仙芝材料:灵芝、香菇、海鲜菇、羊肚菌、金耳、竹荪、银耳等七种食用菌子实体。规格:2.8 m×3.2 m释义:用灵芝等7种食用菌子实体做拼画材料,按照中国画风格构图造型,用鹿角芝制作题款和印章,创作了一幅2.8 m×3.2 m具有中国画特色和意境的“祥瑞仙芝”画,表达了“一朵仙芝五色开,轮囷都是吉祥材,甘棠自茸留遗爱,瑶草于今展异彩。”的古诗意境。

拼画:轩窗芝兰

材质:香菇、羊肚菌、平菇、鹿角芝、竹荪、玉木耳、双孢蘑菇。规格:2 m×2.8 m释义:以古窗棂为载体,用香菇和双孢蘑菇子实体镶砌窗棂外框,用竹荪和玉木耳子实体塑造白玉兰花蕾、花瓣,用鹿角芝做白玉兰花枝,用一枝探出窗棂的白玉兰寓意欣欣向荣之春色,通体红背景与紫色鹿角芝和素洁白玉兰相互映衬,题款“轩窗芝兰歌春色”,赋诗“曾闻三秀济苍生,今喜广播仙草情,轩窗芝兰歌春色,满廊菇菌映秋景”,抒怀蘑菇情深,寄情春色浪漫。

拼画:菌菇字源

材料:灵芝孢子粉、灵芝、香菇、羊肚菌、鹿角芝、双孢蘑菇、黑木耳、玉木耳、金耳、银耳、平菇等11种食用菌子实体。规格:2 m×3.8 m释义:用灵芝等11种食用菌子实体做绘画材料,用灵芝孢子粉打底色,仿照汉代宫阙图案,创作了2.0 m×3.8 m“菌菇字源”图。集中展示了菌(jūn)、蕈(xùn)、?(ruǎn)、栭(ér)、荋(ér)、栮(ěr)、(liè)、菰(gū)、蘛(yú)、椹(shèn)、(shěn)、蕍(yú)、萮(yú)、茈(zǐ)、?(zōng)、軟(ruǎn)、苬(xiú)、?(zōng)、芝(zhī)、菇(gū)、蘑(mó)、灌(guàn)、蛾(é)等25个在某一历史时期曾经表示过某一种“菌”或“菇”的汉字,探究了“菌菇”二字的历史演变,抒发了“溯菌字源阅籍典,知菇今昔探演变,醉仙济民酿琼浆,食芝无疆寿若山”的画意情愫。整幅图画用灵芝建造宫阙,借古论今,用蘑菇实物表达文字,形象直观,既表达了菌菇之美,菌文化之美,又展示了建筑之美,艺术之美,创意新颖,用材别致,科技文化巧妙融合,科普宣传轰然一体。

荷叶离褶伞漆酶的基因预测及其生物信息学分析

荷叶离褶伞(Lyophyllum decastes)胞外酶具有较高的漆酶活性,漆酶在其子实体发育中发挥着重要的作用。荷叶离褶伞基因组已完成测序,但未注释。目前,鲜有其漆酶基因的报道。本研究采用同源预测的方法对其漆酶基因进行预测并对其编码蛋白的生物特性进行探究。以灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)的漆酶氨基酸序列对荷叶离褶伞的全基因组序列进行tblastn比对,再通过Augustus进行基因预测分析得到其cDNA和蛋白序列,用Blastp验证筛选获得19个可能的荷叶离褶伞的漆酶基因。采用ProtParam、SignalP 5.0、Sompa和TMHMM 2.0等生物信息学工具进行预测并分析荷叶离褶伞漆酶的理化特性、信号肽和跨膜结构的组成成分。本研究为荷叶离褶伞漆酶的分子作用机制研究和其它食用菌漆酶的研究提供数据参考。