成人肾上腺皮质癌预后影响因素研究进展

肾上腺皮质癌(ACC)是一种罕见且恶性程度较高的侵袭性肿瘤,预后极差。目前评估ACC患者预后主要依据肿瘤分期和肿物切除状态,但其逐渐不能满足临床对ACC总体疗效、患者病情进展程度的评估。而肾上腺皮质激素、血钾、血清白蛋白、年龄、性别、微RNA、着丝粒蛋白F基因、N 6-甲基腺嘌呤修饰相关基因、G 0/G 1开关基因2等因素均可影响ACC患者的预后。因此,深入了解影响成人ACC预后的影响因素不仅有助于临床医师准确判断患者状况,还可为探究ACC新的诊断标志物及靶向治疗的靶点提供新思路。

基于生物信息学分析铜死亡相关基因CDKN2A在肾上腺皮质癌中的作用机制

目的通过生物信息学分析铜死亡相关基因在肾上腺皮质癌(ACC)中的相关作用机制。方法联合肿瘤基因图谱(TCGA)以及GTEx数据库(肾上腺皮质癌:77例, 对照:128例)筛选出目标基因(CDKN2A)。通过临床相关性分析、生存分析、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析从而探讨目标基因的相关功能以及在ACC中对预后的影响。通过免疫相关分析、药物敏感性分析研究目标基因与ACC中免疫细胞浸润以及药物敏感性之间的关系。通过卡方检验判断CDKN2A在不同临床因素分型中的表达差异性、通过R软件包的"survival"方法进行生存相关分析, 探讨CDKN2A的预后价值, 通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析探讨CDKN2A的相关功能。通过免疫相关分析、药物敏感性分析研究目标基因与ACC中免疫细胞浸润以及药物敏感性之间的关系。结果 CDKN2A在皮质癌中的表达量高于对照组(|log2FC|>2, P<0.05), CDKN2A的表达与ACC患者临床分级(χ^(2)=12.63, P<0.01)以及T分期(χ^(2)=14.17, P<0.01)相关。生存分析结果显示, CDKN2A表达量高的ACC患者预后较表达量低的患者差(风险比1.818, 95%可信区间:1.295~2.552, P<0.05)。富集分析的结果显示CDKN2A与肿瘤的发生发展相关。CDKN2A在ACC中与多种抗肿瘤药物的敏感性以及免疫检查点IDO1密切相关(cor=0.3, P<0.05), 且与ACC的肿瘤突变负荷呈正相关(R=0.49, P<0.01)。结论铜死亡相关基因CDKN2A与ACC预后、侵袭、免疫微环境以及药物敏感性密切相关。

基于生物信息学分析转移性嗜铬细胞瘤的机制

目的通过生物信息学分析鉴定转移性嗜铬细胞瘤的关键基因及分析相关的生物学通路,为临床诊断及治疗提供参考。方法从GEO数据库中下载51例样本(转移性嗜铬细胞瘤11例,对照组40例)的RNA表达谱数据,利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)分析识别与转移性嗜铬细胞瘤最为相关的模块。提取与转移性嗜铬细胞瘤密切相关的模块基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。接着,以基因显著性(GS)>0.4;成员之间相关性(MM)>0.6为阈值对模块基因进行初步筛选。为了防止过拟合,Lasso回归算法对初步鉴定的基因进一步筛选。最后采用受试者工作特征(ROC)曲线计算数据集的曲线下面积(AUC)值。结果通过对数据集进行WGCNA分析,共获得24个基因模块,其中浅蓝色基因模块与转移性嗜铬细胞瘤相关性最高(r=0.65),共包含218个基因。GO分析结果提示模块基因主要富集于细胞连接、细胞黏附分子等生物学功能;KEGG分析提示模块基因主要集中在"Wnt信号通路"等信号通路。对浅蓝色模块初步筛选,得到候选关键基因77个。通过Lasso回归算法进一步分析,鉴定出2个关键基因,即IRX3、KCNG3。ROC曲线结果提示IRX3、KCNG3在数据集中AUC值分别为0.897、0.878。结论利用生物信息学分析揭示与嗜铬细胞瘤转移相关的关键基因IRX3、KCNG3,为转移性嗜铬细胞瘤临床诊断和治疗提供基础。