牡蛎诺如病毒受体类Lewis抗原合成相关基因CgFUT5的克隆与表达鉴定

Lewis抗原被认为是诺如病毒特异性结合受体,作为诺如病毒传播载体,牡蛎中也存在着类Lewis抗原,但牡蛎合成这种碳水化合物的途径尚未阐明。为解析牡蛎中诺如病毒受体类Lewis抗原的合成路径,利用cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆得到太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)的CgFUT5基因全序列并进行生物信息学分析,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析其在5种组织中的表达情况。构建原核表达质粒转化大肠杆菌(Escherichia coli)实现异源表达,并通过免疫印迹法(Western blot)鉴定免疫原性。克隆得到了具有1173 bp开放阅读区的CgFUT5基因cDNA序列,系统发育树显示CgFUT5基因与多个物种具有合成Lewis抗原功能的岩藻糖基转移酶基因遗传学关系较近。重组CgFUT5蛋白可在大肠杆菌中过量表达,且表达的重组CgFUT5蛋白与抗人FUT5抗体及抗6×His标签抗体均能特异性结合。研究发现CgFUT5基因在牡蛎鳃组织中大量表达,CgFUT5蛋白与人FUT5蛋白具有相似的免疫原性,推测牡蛎中存在着类Lewis抗原的合成通路,并且调控牡蛎类Lewis抗原合成的基因还具有组织表达差异性。

海藻中砷的形态分析研究进展

我国的海藻产业是沿海区域重要的渔业经济组成。海藻因其富含多糖、膳食纤维和矿物质等营养物质,成为重要的食品、饲料来源。然而海藻中砷元素含量相对较高,已成为目前海藻摄食的关键风险因素之一。该文对海藻中砷元素的毒性、相关标准限量、分离提取技术、形态分析技术以及海藻中的砷元素分析现状进行综述,为大型经济藻类的利用与产业发展提供参考。

牡蛎诺如病毒受体合成基因类FUT10的克隆与组织表达

目的克隆太平洋牡蛎类FUT10基因的cDNA序列,探究类FUT10 mRNA在牡蛎各组织中的表达差异。方法基于同源比对方法,利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆完整的类FUT10基因,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析其组织分布。结果类FUT10基因cDNA长度为2291 bp,含有111 bp的5’非翻译区、1401 bp编码466个氨基酸的开放阅读框及779 bp的3’非翻译区。基因进化树显示类FUT10与FUT10家族较相似。类FUT10 mRNA在太平洋牡蛎的肝胰腺中表达量高于鳃等组织。结论本研究克隆了牡蛎类FUT10基因,证实其在牡蛎肝胰腺中有显著表达,推测牡蛎很可能具有与人类相似的Ⅱ型类Lewis血型抗原合成路径,研究结果为进一步探究牡蛎富集诺如病毒的分子机制、探索诺如病毒的食源性防控策略提供基础。

太平洋牡蛎中类FUT10蛋白的原核表达及免疫印迹鉴定

目的 获取太平洋牡蛎类α1,3岩藻糖基转移酶10 (α1,3 fucosyl-transferase 10-like, FUT10-like)蛋白并探究与人FUT10的免疫相似性。方法 本研究基于课题组前期克隆完整的类FUT10基因cDNA,依照大肠杆菌表达蛋白的密码子偏爱性,利用GenSmart Optimization在线优化软件对类FUT10基因开放阅读框序列进行优化并合成,亚克隆至载体pET-28a(+),得到重构质粒pET-OFu3,转入大肠杆菌BL21(DE3),通过异丙基-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-D-thiogalactoside,IPTG)诱导后获取目的蛋白,进行蛋白质印迹法(Westernblot)鉴定。结果 在37℃、IPTG终浓度为1.0 mmol/L诱导4 h后,出现蛋白分子量大小约为55 kDa的条带。该蛋白条带与抗6×His(组氨酸标签)抗体、抗人FUT10抗体均能发生特异性结合。结论 优化后的类FUT10蛋白与人体转移酶FUT10具有相似的免疫原性,类FUT10蛋白的可溶性表达为探究太平洋牡蛎体内Ⅱ型血型抗原合成路径提供研究基础。

基于小波分解和1D-GoogLeNet的心律失常检测

心电图(ECG)信号的准确分类对于心脏病的自动诊断非常重要。为了实现对心律失常的智能分类,该文提出一种基于小波分解和1D-GoogLeNet的精确分类方法。在该方法中,利用Db6小波对ECG信号进行8级分解,得到既含时域信息又有频域信息的多维数据。随后,分解的样本用作1D-GoogLeNet的输入训练该模型。在提出的1D-GoogLeNet模型中,借鉴Inception在图像特征提取中的优异性能,将2维卷积变换为1维卷积学习ECG的特征,并且简化各个Inception的结构,降低模型参数。该文提出的神经网络分类器能够有效缓解计算效率低、收敛困难和模型退化的问题。在实验中,选用MIT-BIH心律失常数据集测试所提模型的性能,对比了信号的不同分解分量组合作为输入的检测结果,当输入数据由{d2-d7}组合时,所提1D-GoogLeNet模型可以达到96.58%的平均准确率。此外,还对比了该模型与未经结构优化的简单1维GoogLeNet在数据集上的表现,前者在准确率上比后者提高了4.7%,训练效率提高了118%。

经济高质量发展路径研究——基于fsQCA的多因素组态分析

推动经济高质量发展是当前我国发展的重中之重,文章参考新发展理念并分析其内涵,构建了相应的评价指标体系,运用模糊集定性比较分析法(fsQCA)探索了指标体系不同维度间的组合效应以及驱动经济高质量发展的组合路径。研究发现:经济高质量发展的核心条件有创新发展、协调发展、开放发展;驱动经济高质量发展的组合路径有三条,包括创新、协调、开放主导的发展模式,创新、开放主导的共享发展模式,创新、协调主导的共享发展模式。

基于16SrDNA高通量测序分析循环水养鱼微生物群落结构研究

循环水养殖系统(RAS)是一种提高水产品品质、高效利用水资源的养殖方式,具有环境可控、节水、高效、环保和安全等优点。解析RAS中的微生物种群结构,对于保持RAS内部的生态平衡、避免使用药物、确保水产品质量安全具有现实意义。本研究运用16S rDNA高通量测序技术,研究RAS的水体与鱼体中微生物种群结构,确定循环水养殖系统中的微生物群落特征,比较水体与鱼体之间、不同鱼种之间微生物群落结构。

基于fsQCA的我国区域建筑产业竞争力影响因素研究

本文指出建筑产业对地方经济增长和社会发展具有重要的推动作用,着眼于如何提升区域建筑产业竞争力并关注多重因素对建筑产业竞争力的协同影响,本文基于建筑产业竞争力原理,采用fsQCA研究方法,应用组态思维,以我国31个省(市、自治区)为样本,探讨了产业规模、产业效益、产业结构、产业技术装备水平4个条件变量对区域建筑产业竞争力的协同影响机制。研究发现:一是产业效益单独构成区域建筑产业强竞争力的必要条件。二是区域建筑产业强竞争力的路径一共有3条:拥有较好产业效益的“产业效益型”、拥有较好的产业效益和较为合理的产业结构的“产业效益-均衡型”、拥有较大的产业规模和较为合理的产业结构的“产业规模-产业结构型”。三是区域建筑产业非强竞争力的路径也有3条,与强竞争力的路径存在非对称关系。