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正交设计优化果梅ISSR反应体系 被引量:43
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作者 桂腾琴 孙敏 +1 位作者 乔爱民 王心燕 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期108-112,共5页
以果梅(Prunus mume Sieb.et Zucc.)品种鸳鸯梅为试材,采用改良的CTAB法提取果梅嫩叶DNA,利用正交设计L16(4^5)探讨Mg^2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及模板DNA用量对果梅ISSR—PCR反应的影响,正交试验的结果采用直观分析和... 以果梅(Prunus mume Sieb.et Zucc.)品种鸳鸯梅为试材,采用改良的CTAB法提取果梅嫩叶DNA,利用正交设计L16(4^5)探讨Mg^2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及模板DNA用量对果梅ISSR—PCR反应的影响,正交试验的结果采用直观分析和方差分析相结合。建立了果梅的ISSR—PCR优化反应体系,在20μL反应体系中含2μL 10×Buffer,2.5mmol·L^-2 Mg^2+,0.2mmol·L^-1 dNTPs,0.32μmol·L^-1引物,20—80ng模板DNA,0.75U Taq DNA聚合酶。在此基础上探讨了引物UBC840的最适退火温度、最佳循环次数及延伸时间,引物UBC840的最适退火温度为50.6℃。应用该优化反应体系,用2个不同引物对19份果梅资源DNA进行ISSR—PCR扩增,结果显示优化的反应体系具有较高的稳定性。 展开更多
关键词 果梅 简单序列重复区间(ISSR) 正交设计 反应体系
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果梅ISSR-PCR反应体系的建立和优化 被引量:15
2
作者 桂腾琴 乔爱民 +2 位作者 孙敏 王心燕 孙雪梅 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期124-128,共5页
以果梅品种桃梅为试材,通过单因子试验分别研究了DNA模板浓度、引物浓度、Mg^2+浓度、dNTPs浓度、退火温度及循环数等对果梅ISSR-PCR反应的影响.建立了果梅ISSR-PCR的最佳反应体系:20μL反应体系中含10×buffer2μL,2.5mmol/... 以果梅品种桃梅为试材,通过单因子试验分别研究了DNA模板浓度、引物浓度、Mg^2+浓度、dNTPs浓度、退火温度及循环数等对果梅ISSR-PCR反应的影响.建立了果梅ISSR-PCR的最佳反应体系:20μL反应体系中含10×buffer2μL,2.5mmol/LMgCl2,0.2mmol/LdNTPs,0.32μmol/L引物,20~80ng模板DNA,1UTaq DNA聚合酶.利用优化的反应体系,对19个果梅品种进行体系稳定性检测,结果表明该反应体系的重复性和稳定性良好. 展开更多
关键词 果梅 简单序列重复间区(ISSR) 反应体系优化 稳定性
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果梅种质资源亲缘关系的ISSR分析 被引量:11
3
作者 桂腾琴 乔爱民 +2 位作者 孙敏 王心燕 吴和原 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第27期12957-12959,共3页
利用ISSR技术对39份果梅种质资源多样性和亲缘关系分析,结果表明,从51条引物中筛选出10条分辨率强的引物,共扩增出120个位点,其中,多态性位点98个,约占总数的81.67%。基于Jaccard系数对ISSR扩增结果进行UPGMA法聚类,聚类结果将供试材料... 利用ISSR技术对39份果梅种质资源多样性和亲缘关系分析,结果表明,从51条引物中筛选出10条分辨率强的引物,共扩增出120个位点,其中,多态性位点98个,约占总数的81.67%。基于Jaccard系数对ISSR扩增结果进行UPGMA法聚类,聚类结果将供试材料分成3类,与传统园艺学分类基本一致,表明供试材料间的聚类与地域无明显相关性。 展开更多
关键词 果梅 种质资源 遗传多样性 亲缘关系 ISSR
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荷花品种不同部位DNA提取的比较研究 被引量:8
4
作者 桂腾琴 伍伟 +4 位作者 卢鹏 王颖娟 张万芹 马彩瑜 陈鹏 《种子》 北大核心 2016年第7期41-44,共4页
采用改良的3×CTAB法提取荷花品种笛女、国庆红、红苔莲的叶片、叶柄和花不同部位的DNA,并对提取的DNA进行琼脂糖凝胶电泳检测、纯度检测和ISSR分析。结果表明,除叶柄中提取的DNA效果不理想外,其余从叶片、花中提取的DNA纯度高、得... 采用改良的3×CTAB法提取荷花品种笛女、国庆红、红苔莲的叶片、叶柄和花不同部位的DNA,并对提取的DNA进行琼脂糖凝胶电泳检测、纯度检测和ISSR分析。结果表明,除叶柄中提取的DNA效果不理想外,其余从叶片、花中提取的DNA纯度高、得率高,OD260/280比值在1.80左右,OD260/230比值在2.01左右。以红苔莲的花为试材,对改良的3×CTAB法提取基因组DNA的参数进行正交试验,选出提取DNA的最优组合。通过荷花基因组DNA的ISSR分析,完全满足实验要求。 展开更多
关键词 荷花 基因组DNA 不同部位 改良的3×CTAB
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贵州地方梨品种资源遗传多样性ISSR分析 被引量:5
5
作者 桂腾琴 郭计华 +2 位作者 王颖娟 梁娴 张万芹 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1076-1083,共8页
【目的】探讨贵州地方梨品种资源的亲缘关系和遗传多样性,为品种资源的开发利用、品种鉴定提供理论依据。【方法】采用ISSR标记研究48份梨品种的遗传多样性。【结果】12对ISSR引物在48个梨品种中扩增出126个位点,其中多态性位点114条,... 【目的】探讨贵州地方梨品种资源的亲缘关系和遗传多样性,为品种资源的开发利用、品种鉴定提供理论依据。【方法】采用ISSR标记研究48份梨品种的遗传多样性。【结果】12对ISSR引物在48个梨品种中扩增出126个位点,其中多态性位点114条,多态性比率(PPB)为90.48%;所检测品种群体具有中等程度的遗传多样性,有效等位基因数Ne为1.487 4,Nei’s的遗传多样性指数(He)为0.285 2,Shannon信息指数(I)为0.430 7。采用NTsys 2.10e软件计算种质间Jaccard遗传相似系数,48个梨品种的遗传相似性分析表明,各基因型间的Jaccard相似系数为0.484~0.952。通过非加权算术平均数聚类法(UPGMA),绘制了48个梨品种遗传关系树状图。以0.67为阈值,将48份材料分为3大类群。【结论】供试48个梨品种遗传多样性丰富,大部分的砂梨品种聚在一起,白梨品种聚在一起。研究中发现,白梨和砂梨系统品种间存在广泛的种间杂交现象,种质之间渗入程度较大,但个别品种间的聚类结果与实际情况有所出入。 展开更多
关键词 贵州省 品种资源 遗传多样性 ISSR
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果梅基因组DNA提取方法的比较及ISSR分析 被引量:11
6
作者 桂腾琴 乔爱民 +2 位作者 孙敏 王心燕 孙雪梅 《北方园艺》 CAS 北大核心 2008年第4期212-215,共4页
以果梅品种鸳鸯梅、皇后梅和肖山选的幼嫩叶片为试材,提取果梅的DNA。针对果梅组织细胞体内含有较多的酚类、糖类及萜类等次生代谢物质的特点,采用传统的CTAB法、改良的CTAB法和改良的SDS法提取果梅基因组DNA,并比较其提取效果。结果表... 以果梅品种鸳鸯梅、皇后梅和肖山选的幼嫩叶片为试材,提取果梅的DNA。针对果梅组织细胞体内含有较多的酚类、糖类及萜类等次生代谢物质的特点,采用传统的CTAB法、改良的CTAB法和改良的SDS法提取果梅基因组DNA,并比较其提取效果。结果表明:改良的CTAB法可获得高质量、高得率的基因组DNA,OD260/280比值在1.80左右。通过基因组DNA-IS-SR分析,完全满足试验要求。并进一步对改良的CTAB法的关键步骤作出具体的分析讨论。 展开更多
关键词 果梅 基因组DNA DNA提取 CTAB SDS
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梨ISSR-PCR反应体系的正交优化研究 被引量:5
7
作者 桂腾琴 孙敏 +3 位作者 陆春连 刘群 代婷 柏和燕 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期37-42,共6页
以‘饼子梨’为试材,利用正交设计L16(45)研究了反应体系中引物、模板DNA浓度等5个因素4个水平对梨反应体系的影响,PCR结果应用极差分析和MINITAB软件对扩增结果进行方差分析.梨最佳ISSR-PCR反应体系:25μL反应体系中含2.5μL 10×B... 以‘饼子梨’为试材,利用正交设计L16(45)研究了反应体系中引物、模板DNA浓度等5个因素4个水平对梨反应体系的影响,PCR结果应用极差分析和MINITAB软件对扩增结果进行方差分析.梨最佳ISSR-PCR反应体系:25μL反应体系中含2.5μL 10×Buffer,2.0mmol/L Mg2+,0.25mmol/L dNTPs,0.25μmol/L引物,60ng模板DNA,0.75UTaq DNA聚合酶.优化的ISSR-PCR反应体系稳定性高和重复性较好,为梨品种指纹图谱构建和遗传多样性分析奠定基础. 展开更多
关键词 正交设计 ISSR体系优化
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果梅种质资源亲缘关系的ISSR分析(英文) 被引量:4
8
作者 桂腾琴 乔爱民 +2 位作者 孙敏 王心燕 吴和原 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第5期92-95,共4页
利用ISSR技术分析39份果梅种质资源多样性和亲缘关系。结果表明,从51条引物中筛选出10条分辨率强的引物,共扩增出120个位点,平均每个引物扩增出12个位点,最多为16(UBC834),最少为10(UBC857),其中,多态性条带98条,多态性比率(PPB)为81.6... 利用ISSR技术分析39份果梅种质资源多样性和亲缘关系。结果表明,从51条引物中筛选出10条分辨率强的引物,共扩增出120个位点,平均每个引物扩增出12个位点,最多为16(UBC834),最少为10(UBC857),其中,多态性条带98条,多态性比率(PPB)为81.67%,表明ISSR标记在检测果梅基因组遗传多态性上有较显著的检出效率。DNA片段大小分布在0.2~3.0kb。基于各材料的Jaccard系数,利用UPGMA法进行聚类分析构建亲缘关系树状图。各材料之间的亲缘关系较复杂,并非平行分化的关系。39份供试材料的相似系数为0.5263~0.9910,其中,相似系数最大的为浙江的白毛和肖山选,达0.9910,属于青梅类,表明两者的亲缘关系最近;相似系数最小的为广东的矮白梅和湖南的红梅二号,仅为0.5263,表明两者的遗传差异较大。以0.65为阈值将39份材料分为3个类,第Ⅰ类为矮白梅一个品种,该品种因其树形矮化,适熟时果皮呈均匀的浅绿色,无红晕,梅果含酸量高等特征独立于其他品种之外,可能是一份比较特殊的种质资源;第Ⅱ类包括4个品种,白毛、肖山选、红梅2号和木瓜梅,其余的34个品种为第Ⅲ类。在第Ⅲ类的34个品种中,以0.71水平值又可以分为5个亚类,第1亚类(ⅢA)包括21个品种,可再分成5个组:第1组(a)包括大叶青、桐绿四号、石庵白粒圆、三排早、中脂梅、核梅、腊梅、新白梅等8个品种,除中脂梅和腊梅外,其余的6个品种属于青梅类;第2组(b)包括软枝大粒梅、大沛梅2号、大青梅、三排选一、山溪选一、软枝乌叶梅、大沛梅10号和白粉梅等8个品种,除三排选一、山溪选一属于青梅类外,其余的6个品种属于红梅类;第3组(c)包括竹梅和沙梅;第4组(d)包括白梅和桃梅,都属于红梅类;第5组(e)包括1个品种,沅江青梅。第2亚类(ⅢB)包括9个品种,皇后梅、胭腊梅、青水梅、大横核、横核、天水梅、双水梅、白头鹰和红面梅,除皇后梅、胭腊梅、红面梅属于红梅类,其余的6个品种属于青梅类。第3亚类为(ⅢC)大核青。第4亚类(ⅢD)为鸳鸯梅和红花梅。第5亚类(ⅢE)是李梅。供试材料间的聚类结果与传统园艺学分类基本一致,表明供试材料间的聚类与地域无明显相关性。 展开更多
关键词 果梅 种质资源 遗传多样性 亲缘关系 ISSR
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梨品种ISSR-PCR反应体系的优化与应用 被引量:2
9
作者 桂腾琴 乔爱民 +3 位作者 陆春连 刘群 代婷 柏和燕 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第24期117-120,共4页
以海子梨(Haizili)品种的DNA为材料,对影响ISSR—PCR扩增的重要因子进行单因素的优化设计,建立了最佳体系:25μL反应体系中含2.5μL 10×buffer、0.75U Taq DNA聚合酶、0.2mmol/L dNTPs、2.5mmol/L MgCl2、0.25μmol/... 以海子梨(Haizili)品种的DNA为材料,对影响ISSR—PCR扩增的重要因子进行单因素的优化设计,建立了最佳体系:25μL反应体系中含2.5μL 10×buffer、0.75U Taq DNA聚合酶、0.2mmol/L dNTPs、2.5mmol/L MgCl2、0.25μmol/L引物、10-60ng模板DNA。将最佳体系应用于黔西南的22个梨品种,证实了该体系的重复性好,很稳定。 展开更多
关键词 ISSR—PCR 体系优化
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叶绿体基因工程的研究进展 被引量:6
10
作者 桂腾琴 孙敏 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第8期3429-3431,3434,共4页
介绍了叶绿体基因工程的特点、叶绿体转化方法、转化中存在的问题及解决策略以及前景展望等,重点阐述了叶绿体基因工程的研究新进展。
关键词 叶绿体基因工程 叶绿体转化 同质化
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正交设计优化荷花品种ISSR-PCR反应体系 被引量:1
11
作者 桂腾琴 伍伟 +4 位作者 卢鹏 王颖娟 张万芹 子文童 李珏 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第7期71-73,共3页
以东方明珠荷花为试验材料,应用L9(34)正交设计,探讨反应体系中引物、Taq DNA聚合酶等4个不同因素的3个水平对荷花品种反应体系的影响,正交设计所用引物为UBC843,PCR结果应用MINITAB软件进行方差分析和极差分析。结果表明,荷花最佳ISSR-... 以东方明珠荷花为试验材料,应用L9(34)正交设计,探讨反应体系中引物、Taq DNA聚合酶等4个不同因素的3个水平对荷花品种反应体系的影响,正交设计所用引物为UBC843,PCR结果应用MINITAB软件进行方差分析和极差分析。结果表明,荷花最佳ISSR-PCR反应体系(25μL):2.5μL 10×buffer,2.0 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L d NTPs,0.40μmol/L引物,20~80 ng模板DNA,1.00 U Taq DNA聚合酶。优化的ISSR-PCR反应体系稳定性高、重复性较好,为从分子水平对荷花品种进行各项研究奠定了基础。 展开更多
关键词 荷花 正交设计 ISSR-PCR 体系优化
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木兰科植物系统学的研究进展 被引量:3
12
作者 桂腾琴 《种子》 CSCD 北大核心 2010年第9期56-59,共4页
木兰科植物分布范围广及美洲、亚洲的温带、亚热带和热带,存在较多的性状交叉和形态变异,在属的界限和种的确定上有较大的争议。根据形态解剖学的主要特征,提出把木兰科分为木莲属、厚壁木属、华盖木属、木兰属、盖裂木属、南美盖裂木... 木兰科植物分布范围广及美洲、亚洲的温带、亚热带和热带,存在较多的性状交叉和形态变异,在属的界限和种的确定上有较大的争议。根据形态解剖学的主要特征,提出把木兰科分为木莲属、厚壁木属、华盖木属、木兰属、盖裂木属、南美盖裂木属、香木兰属、拟单性木兰属、单性木兰属、长蕊木兰属、南洋含笑属、含笑属、合果木属、观光木属、鹅掌楸属等15个属,并讨论了木兰科的演化途径和形态特征的进化趋势及其细胞学和分子生物学的研究进展。 展开更多
关键词 木兰科 分类系统 进化趋势
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落叶松体细胞胚胎发生的研究进展 被引量:3
13
作者 桂腾琴 《黔西南民族师范高等专科学校学报》 2006年第3期91-94,共4页
落叶松体细胞胚胎发生属于间接体细胞胚胎发生途径,主要包括三个步骤:胚性培养物诱导、继代与增殖及其体胚成熟和萌发。供体植物的基因型及其培养基的成分等是影响落叶松体细胞胚胎发生的重要因素。体细胞胚胎发生是一种有效的大规模克... 落叶松体细胞胚胎发生属于间接体细胞胚胎发生途径,主要包括三个步骤:胚性培养物诱导、继代与增殖及其体胚成熟和萌发。供体植物的基因型及其培养基的成分等是影响落叶松体细胞胚胎发生的重要因素。体细胞胚胎发生是一种有效的大规模克隆繁殖方法,并且在许多有重要经济价值的树种中都取得了很大进展,目前已从30多种松柏类植物诱导出体细胞胚。落叶松体细胞胚胎发生的应用大多数集中于胚性培养物的超低温保存、原生质体培养、转基因等技术,并对落叶松体细胞胚胎发生的研究趋势作了展望。 展开更多
关键词 落叶松 体细胞胚胎发生 超低温保存 原生质体 转基因
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生物化学实验技术在植物遗传标记中的应用 被引量:1
14
作者 桂腾琴 《黔西南民族师范高等专科学校学报》 2007年第1期121-124,共4页
生物化学是一门迅速发展的现代自然科学,随着生物化学和分子生物学的发展,它们相应的技术渗透于植物学中,促使植物学在植物遗传标记等方面得到了很好的应用。通过对形态标记、细胞学标记、生化标记和DNA分子标记之间差异,可知分子标记... 生物化学是一门迅速发展的现代自然科学,随着生物化学和分子生物学的发展,它们相应的技术渗透于植物学中,促使植物学在植物遗传标记等方面得到了很好的应用。通过对形态标记、细胞学标记、生化标记和DNA分子标记之间差异,可知分子标记是一种理想的方法。 展开更多
关键词 生化实验技术 遗传标记 生化标记 分子标记
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《从地方分治到参与共治——中国流域水污染治理研究》读后
15
作者 桂腾琴 《首都师范大学学报(社会科学版)》 CSSCI 北大核心 2012年第S1期167-169,共3页
一口气读完胡若隐著的《从地方分治到参与共治———中国流域水污染治理研究》这本书,了解到我国水资源污染严重,治理效能低,尤其是体制机制不健全,加剧了我国水资源的紧张程度。即便现有工程技术加强。
关键词 水资源 水污染治理 流域水污染 滇池治理 治理研究 共治 污染严重 分治 水环境承载能力 工程技术
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分枝法在遗传学自由组合规律的应用 被引量:1
16
作者 桂腾琴 《黔西南民族师范高等专科学校学报》 2009年第2期122-124,共3页
在遗传学中占有重要地位的自由组合规律,是教学的重点和难点,教材只对它作简单的讲述,学生对此理解不透,也不能灵活运用。分枝法作为遗传学上推算遗传比例的方法,与传统思维方式相比:它可以准确、快速地分析杂合体产生的配子种类及比例... 在遗传学中占有重要地位的自由组合规律,是教学的重点和难点,教材只对它作简单的讲述,学生对此理解不透,也不能灵活运用。分枝法作为遗传学上推算遗传比例的方法,与传统思维方式相比:它可以准确、快速地分析杂合体产生的配子种类及比例,杂合体之间杂交产生子代的表现型、基因型种类及比例;思路清晰、化繁为简,解决遗传分析中的难题。 展开更多
关键词 分枝法 自由组合规律(独立分配规律) 概率论
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水稻CRE基因的克隆、分析及其高效表达载体的构建
17
作者 桂腾琴 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第14期136-138,共3页
基于GenBank中公布的水稻(Oryza sativa)基因组序列信息,设计特异引物,结合RT-PCR技术克隆水稻细胞分裂素受体(CTK response,CRE)基因的cDNA全长序列,并利用生物信息学工具进行初步分析。通过限制性内切酶将目的基因片段连接在载体pCAMB... 基于GenBank中公布的水稻(Oryza sativa)基因组序列信息,设计特异引物,结合RT-PCR技术克隆水稻细胞分裂素受体(CTK response,CRE)基因的cDNA全长序列,并利用生物信息学工具进行初步分析。通过限制性内切酶将目的基因片段连接在载体pCAMBIA 1390-35S上,重组质粒分别通过PCR检测和酶切鉴定,成功获得水稻CRE基因的高效表达载体,可直接用于水稻的遗传转化研究。 展开更多
关键词 水稻 pCAMBIA 1390-35S CRE 载体构建
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遗传学课堂深化概念图教学
18
作者 桂腾琴 《兴义民族师范学院学报》 2011年第4期76-78,共3页
概念图是显示概念之间意义联系的空间网络结构图。在遗传学教学中,选择性地使用概念图有助于教师进行课程内容的组织与复习,检测学生的学习成果;也可有效地提高学生的逻辑思维和创造能力。
关键词 概念图 遗传学教学 学生
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水杨酸对NaCl胁迫下黄芩幼苗生长的影响 被引量:21
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作者 王淑芳 杨雪清 +3 位作者 田桂香 桂腾琴 杨蕊 孙敏 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期159-162,共4页
温室条件下研究NaCl(0·5%)胁迫和外施不同浓度的水杨酸(salicylicacid,SA)对黄芩幼苗生理活动的影响.NaCl胁迫处理的幼苗与未经过NaCl胁迫处理相比,叶绿素a、叶绿素b含量明显下降,SOD、POD、CAT活性上升后急速下降,引起H2O2和MDA... 温室条件下研究NaCl(0·5%)胁迫和外施不同浓度的水杨酸(salicylicacid,SA)对黄芩幼苗生理活动的影响.NaCl胁迫处理的幼苗与未经过NaCl胁迫处理相比,叶绿素a、叶绿素b含量明显下降,SOD、POD、CAT活性上升后急速下降,引起H2O2和MDA含量显著增加;外施不同浓度的SA和0·5%NaCl共同处理的黄芩幼苗与NaCl胁迫处理相比,叶绿素a、叶绿素b都有不同程度增加,H2O2和MDA含量则有不同程度降低,SOD、CAT活性上升,POD活性显著上升.其中S2,S3在提高NaCl胁迫抗性时效果最佳.以上结果表明适当浓度SA对黄芩幼苗生理活性有一定的改善,增强了植株对盐胁迫的抗性. 展开更多
关键词 水杨酸 黄芩 NACL胁迫 生理指标
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27个菜心品种遗传多样性的ISSR分析 被引量:14
20
作者 孙雪梅 乔爱民 +2 位作者 孙敏 桂腾琴 尹彩霞 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期119-123,共5页
利用ISSR技术对27个菜心品种的遗传多样性进行了分析.结果表明,12条引物共检测到103个可重复位点,其中多态位点58个,多态位点百分率(P)为56.31%.平均多样性指数(I)为0.229,遗传相似系数(H)为0.144,观察等位基因数(Na)和有效等位基因数(... 利用ISSR技术对27个菜心品种的遗传多样性进行了分析.结果表明,12条引物共检测到103个可重复位点,其中多态位点58个,多态位点百分率(P)为56.31%.平均多样性指数(I)为0.229,遗传相似系数(H)为0.144,观察等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为1.563和1.225,遗传距离(GD)的范围在0.029~0.344之间,表明菜心遗传多样性较低.经UPGMA聚类分析,将27个菜心品种分为六大类群. 展开更多
关键词 菜心 遗传多样性 ISSR
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