桑树(川桑Morus notabilis)全基因组测序

人类栽桑养蚕起始于5000年之前,所开创的丝绸之路极大地影响了世界历史的进程。家蚕的基因组已经被解析,与之相辅,我们在此描述了桑树(川桑)的基因组。经过组装之后的桑树基因组大小为330Mb,含有128Mb的重复序列,编码了29 338个基因,转录组数据支持了其中60.8%的基因。分析桑树基因组发现,桑树基因的进化速度是蔷薇目其他物种的大约3倍,这一特征可能促进了其在地球上的传播和分布。桑树在过去的1亿年中没有经历基因组加倍事件,这一现象只在除了几个蔷薇目物种的少数真双子叶植物中出现。然而,在桑树及其他树种中却发现了一系列新的多倍体类型,这一种新型的加倍事件可能对其更加有利。在家蚕的血淋巴和丝腺中鉴定到了5个预测的桑树来源的miRNA,暗示了植物和植食性昆虫之间在分子水平上存在相互作用。除此之外,对桑树中与分化选择、抗性和乳汁中表达的蛋白酶抑制子等相关的编码基因的鉴定和分析将推进桑树改良的研究进程。