我国野鸟新城疫病毒流行调查及遗传进化分析

目的掌握我国野鸟中新城疫病毒(NDV)的流行及遗传进化特征。方法结合候鸟的分布、迁徙规律以及栖息环境等信息,在途经中国的东亚-澳大利亚和西太平洋候鸟迁徙路线及其他重要野鸟栖息、停歇地作为监测哨点,采集环境样品、组织及咽肛拭子等样品进行NDV鉴定,阳性样品按照地域、物种和采集时间划分挑取代表株并进行F基因序列测定,构建NJ进化树并分析F蛋白裂解位点。结果2013-2021年共采集环境样品、拭子及组织样品113017份,分离获得67株候鸟NDV,均来自常规监测中采集的拭子和环境样品,死亡野鸟中未检出NDV。历年野鸟中NDV的分离率分别为:2013年0.21%,2014年0.23%,2015年0.04%,2016年0.05%,2017年0.03%,2018年0.03%,2020年0.06%,2021年0.01%。F基因遗传进化分析表明,26株代表株中有20株NDV为ClassⅠ(14株genotypeⅠ.1.1.2,6株genotypeⅠ.1.2),宿主分布为苍鹭、赤麻鸭、斑嘴鸭、红腹滨鹬、海鸬鹚及鸥类;6株NDV为ClassⅡ(1株为genotypeⅠ.1.1,1株为genotypeⅠ.1.2.1,4株为genotypeⅠ.2),宿主分布为豆雁、翘嘴鹬、绿头鸭、红头潜鸭。经F蛋白裂解位点分析,26株新城疫病毒代表株均符合弱毒株分子特征。结论新城疫病毒野鸟宿主种类呈多样性,且同时存在ClassⅠ和ClassⅡ两类新城疫弱毒株。可为我国野鸟中新城疫病毒的流行、进化和宿主多样性提供数据资料。