基于TCGA和GEO数据库分析MAFG在肝癌中的表达及临床意义

目的通过对TCGA和GEO数据库中肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的数据挖掘,探讨V-maf鸟类肌筋膜纤维肉瘤癌基因同源物G(V-maf avian musculoaoneurotic fibroscarcoma oncogene homolog G,MAFG)基因在HCC中的表达及临床意义。方法通过TCGA和GEO数据库分析MAFG在HCC组织及癌旁组织的表达差异,通过HPA数据库分析MAFG表达水平与患者预后的关系。采用实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)法检测HCC组织中MAFG的表达水平。利用TCGA R软件,对交集差异基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果TCGA和GEO数据集分析均发现MAFG在HCC组织中呈显著高表达(P<0.05)。RT-qPCR验证结果显示,与癌旁组织相比,MAFG在HCC组织中表达显著增高(P<0.05)。MAFG高表达组HCC患者5年内的生存率要低于MAFG低表达的患者。MAFG可能通过细胞分化、细胞迁移、炎性反应等生物学过程以及代谢通路、P53信号通路等信号通路进一步影响HCC发生、发展及预后。结论MAFG在HCC组织中呈高表达,其高表达预示HCC患者预后不佳,可为日后HCC的诊断和治疗提供新思路。