多数据库对影响肺腺癌发生发展关键基因的初步筛选

目的利用基因表达数据库(GEO)和Oncomine数据库筛选与肺腺癌发生发展相关的关键基因,并对其在肺腺癌患者预后中的价值进行分析。方法利用GEO对肺腺癌表达数据集(GSE10072)进行基因分层富集分析,利用Oncomine对肺腺癌的相关研究进行荟萃分析筛选上调和下调基因。对两个结果比对筛选在两个结果中都存在的基因,利用GEPIA在线工具评价这些基因对肺腺癌患者生存期的影响。结果基因富集分析结果显示,吸烟肺腺癌富集信号通路最多,戒烟肺腺癌富集到的通路次之,不吸烟肺腺癌富集的信号通路最少。将基因富集分析结果中前100个基因与Oncomine荟萃分析结果比较,筛选出肺腺癌中27个上调和44个下调的关键基因。进一步生存分析结果显示,13个上调和6个下调的基因可影响肺腺癌患者预后(所有Logrank P<0.05)。结论对不同吸烟状态肺腺癌发生发展的信号通路进行分析后,筛选出来的19个肺腺癌发生发展关键基因,可以在后续的研究中进一步评价这些标志物在肺腺癌中的诊断价值以及应用价值。