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基于Miseq测序的长江中游枯水季水体菌群结构
被引量:
5
1
作者
梁杰超
季斌
+5 位作者
陈威
宋宏娇
姚嘉雄
龚喜平
肖曹帆
刘扬
《科学技术与工程》
北大核心
2019年第14期84-89,共6页
采用基于16S rRNA基因的Illumina Miseq测序方法,对长江中游枯水季冬季的水质及水体细菌群落多样性进行系统分析。研究发现,所测长江水段当季属于《地表水环境质量标准》(GB 3838-2002)Ⅲ类水。长江中菌群多样性高,变形菌门(Proteobacte...
采用基于16S rRNA基因的Illumina Miseq测序方法,对长江中游枯水季冬季的水质及水体细菌群落多样性进行系统分析。研究发现,所测长江水段当季属于《地表水环境质量标准》(GB 3838-2002)Ⅲ类水。长江中菌群多样性高,变形菌门(Proteobacteria,44. 9%)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria,32. 9%)以及丛毛单胞菌科(Comamonadaceae,30. 6%)分别在门、纲、科上为优势菌。除此之外,长江水体中大量的优势菌科与生物除氮相关,其中具有好氧反硝化功能的丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)相对丰度最大,对于控制水体中氮素的污染指标,促进水体自净修复有积极的作用。PICRUSt功能预测分析表明水体中菌群在碳水化合物代谢和氨基酸代谢方面功能最强。在菌种关联网络中,拟杆菌属(Bacteroides)、黄杆菌属(Luteolibacter)、Pseudarcicella等在共存网络菌群中具有正相关的关系,可以抑制微囊藻的生长。研究揭示了长江枯水季的水质与其微生物群落结构的内在关系,可以为长江枯水季饮用水源地水质安全保障提供理论依据。
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关键词
长江
枯水季
水质
微生物多样性
丛毛单胞菌
黄杆菌属
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职称材料
基于Linemod-2D与Otsu的多目标工件快速分拣方法研究
被引量:
2
2
作者
杨俊杰
袁清珂
+1 位作者
梁杰超
叶凯冬
《组合机床与自动化加工技术》
北大核心
2022年第10期79-82,87,共5页
针对多目标工件快速分拣的需求,提出一种改进的边缘特征模板匹配算法。首先,采取图像金字塔搜索策略提高实时性;其次,在金字塔顶层用Linemod-2D的快速查表法进行所有旋转模板的全局粗匹配;再次,采用双阈值最大类间方差法获取自适应梯度...
针对多目标工件快速分拣的需求,提出一种改进的边缘特征模板匹配算法。首先,采取图像金字塔搜索策略提高实时性;其次,在金字塔顶层用Linemod-2D的快速查表法进行所有旋转模板的全局粗匹配;再次,采用双阈值最大类间方差法获取自适应梯度幅值阈值,以此来筛选顶层中参与相似性度量的梯度方向;最后,精匹配的过程交由传统边缘特征模板匹配来完成。实验结果表明,改进算法比传统边缘特征模板匹配算法快了5倍,解决了传统算法搜寻多旋转位姿多目标耗时较长的问题,并且保持着传统算法的准确性和稳定性,可有效提高多目标工件分拣效率。
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关键词
工件分拣
边缘特征
Linemod-2D
模板匹配
最大类间方差法
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职称材料
啮齿目动物宿主——冠状病毒的另一个潘多拉魔盒?
3
作者
梁杰超
王嘉
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1474-1483,共10页
过去的几十年中,大多数病毒性新发传染病都由野生动物来源的病原体所引起,其中就包括冠状病毒。在所有公认的宿主中,蝙蝠(翼手目)被认为是冠状病毒的储存宿主,储蓄着大量古老且多样的冠状病毒。尽管啮齿目动物通常被视为传播病原体的另...
过去的几十年中,大多数病毒性新发传染病都由野生动物来源的病原体所引起,其中就包括冠状病毒。在所有公认的宿主中,蝙蝠(翼手目)被认为是冠状病毒的储存宿主,储蓄着大量古老且多样的冠状病毒。尽管啮齿目动物通常被视为传播病原体的另一关键类群,目前却很少有综述针对其所携带的冠状病毒进行介绍并评估潜在的威胁。为此,本文总结了近年来啮齿目冠状病毒流行情况的研究进展,探讨了两种人类冠状病毒的出现与啮齿目动物之间的联系,在分析了啮齿目独特的宿主习性以及相关冠状病毒的分子特征后,对该来源的冠状病毒的人兽共患病潜力进行了评估。
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关键词
冠状病毒
啮齿目动物
人兽共患病
原文传递
题名
基于Miseq测序的长江中游枯水季水体菌群结构
被引量:
5
1
作者
梁杰超
季斌
陈威
宋宏娇
姚嘉雄
龚喜平
肖曹帆
刘扬
机构
武汉科技大学城市建设学院
出处
《科学技术与工程》
北大核心
2019年第14期84-89,共6页
基金
长江水利委员会长江科学院开放研究基金(CKWV2018490/KY)
湖北省自然科学基金(2017CFB350)资助
文摘
采用基于16S rRNA基因的Illumina Miseq测序方法,对长江中游枯水季冬季的水质及水体细菌群落多样性进行系统分析。研究发现,所测长江水段当季属于《地表水环境质量标准》(GB 3838-2002)Ⅲ类水。长江中菌群多样性高,变形菌门(Proteobacteria,44. 9%)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria,32. 9%)以及丛毛单胞菌科(Comamonadaceae,30. 6%)分别在门、纲、科上为优势菌。除此之外,长江水体中大量的优势菌科与生物除氮相关,其中具有好氧反硝化功能的丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)相对丰度最大,对于控制水体中氮素的污染指标,促进水体自净修复有积极的作用。PICRUSt功能预测分析表明水体中菌群在碳水化合物代谢和氨基酸代谢方面功能最强。在菌种关联网络中,拟杆菌属(Bacteroides)、黄杆菌属(Luteolibacter)、Pseudarcicella等在共存网络菌群中具有正相关的关系,可以抑制微囊藻的生长。研究揭示了长江枯水季的水质与其微生物群落结构的内在关系,可以为长江枯水季饮用水源地水质安全保障提供理论依据。
关键词
长江
枯水季
水质
微生物多样性
丛毛单胞菌
黄杆菌属
Keywords
Yangtze River
dry season
water quality
microbial diversity
Comamonadaceae
Luleoblibacer
分类号
Q938.8 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
基于Linemod-2D与Otsu的多目标工件快速分拣方法研究
被引量:
2
2
作者
杨俊杰
袁清珂
梁杰超
叶凯冬
机构
广东工业大学机电工程学院
出处
《组合机床与自动化加工技术》
北大核心
2022年第10期79-82,87,共5页
基金
广东省省级科技计划项目(2019B040402006)。
文摘
针对多目标工件快速分拣的需求,提出一种改进的边缘特征模板匹配算法。首先,采取图像金字塔搜索策略提高实时性;其次,在金字塔顶层用Linemod-2D的快速查表法进行所有旋转模板的全局粗匹配;再次,采用双阈值最大类间方差法获取自适应梯度幅值阈值,以此来筛选顶层中参与相似性度量的梯度方向;最后,精匹配的过程交由传统边缘特征模板匹配来完成。实验结果表明,改进算法比传统边缘特征模板匹配算法快了5倍,解决了传统算法搜寻多旋转位姿多目标耗时较长的问题,并且保持着传统算法的准确性和稳定性,可有效提高多目标工件分拣效率。
关键词
工件分拣
边缘特征
Linemod-2D
模板匹配
最大类间方差法
Keywords
multi-objective sorting
edge feature
Linemod-2D
template matching
Otsu
分类号
TH162 [机械工程—机械制造及自动化]
TG68 [金属学及工艺—金属切削加工及机床]
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职称材料
题名
啮齿目动物宿主——冠状病毒的另一个潘多拉魔盒?
3
作者
梁杰超
王嘉
机构
汕头大学医学院
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期1474-1483,共10页
基金
广东省科技专项资金(项目号:2019ST042)
题目:基于大数据分析的病原诊断和防治
+1 种基金
广东省科技专项资金(项目号:210804126870918)
题目:病毒性新发传染病的研究与防治。
文摘
过去的几十年中,大多数病毒性新发传染病都由野生动物来源的病原体所引起,其中就包括冠状病毒。在所有公认的宿主中,蝙蝠(翼手目)被认为是冠状病毒的储存宿主,储蓄着大量古老且多样的冠状病毒。尽管啮齿目动物通常被视为传播病原体的另一关键类群,目前却很少有综述针对其所携带的冠状病毒进行介绍并评估潜在的威胁。为此,本文总结了近年来啮齿目冠状病毒流行情况的研究进展,探讨了两种人类冠状病毒的出现与啮齿目动物之间的联系,在分析了啮齿目独特的宿主习性以及相关冠状病毒的分子特征后,对该来源的冠状病毒的人兽共患病潜力进行了评估。
关键词
冠状病毒
啮齿目动物
人兽共患病
Keywords
Coronaviruses
Rodents
Zoonosis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Miseq测序的长江中游枯水季水体菌群结构
梁杰超
季斌
陈威
宋宏娇
姚嘉雄
龚喜平
肖曹帆
刘扬
《科学技术与工程》
北大核心
2019
5
下载PDF
职称材料
2
基于Linemod-2D与Otsu的多目标工件快速分拣方法研究
杨俊杰
袁清珂
梁杰超
叶凯冬
《组合机床与自动化加工技术》
北大核心
2022
2
下载PDF
职称材料
3
啮齿目动物宿主——冠状病毒的另一个潘多拉魔盒?
梁杰超
王嘉
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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