间型假丝酵母菌株对多种水果蔬菜腐败霉菌的拮抗效果和拮抗机制的研究

在腐败玉米中分离到多株有生物防治效果的酵母菌 ,从中最终筛选到拮抗效果最好的 1株酵母菌 ,经鉴定为间型假丝酵母 (Candidaintermedia) ,它对多种果蔬腐败均有显著抑制效果。并做了初步的拮抗机制和拮抗效果的研究。证明间型假丝酵母的拮抗作用主要为营养竞争 。

合成生物学与微生物遗传物质的重构

作为一门新兴学科的合成生物学已经展现出巨大的科学价值和应用前景。近年来已经发表了多篇综述文章,从不同角度对合成生物学进行了总结和论述。文章首次对合成生物学和微生物遗传学之间的关系进行了阐述,同时介绍了合成生物学在微生物遗传物质的重构方面最近的研究进展,包括微生物遗传物质的合成、设计和精简,遗传元件的标准化和遗传线路的模块化。也探讨了合成生物学与微生物遗传工程的关系。

一株生防酵母菌的筛选与生理生化特性的研究

在腐败玉米中分离到多株有生防效果的酵母菌 ,从中最终筛选到拮抗效果最好的一株酵母菌 ,经对其细胞形态的观察和生理特征测定 ,初步鉴定为间型假丝酵母 (Candidaintermedia)。

一个感应调控因子控制生物膜形成功能和蹭行运动的研究

分离自废水中的食酸菌属菌株Q1能够在液固界面形成成熟的生物膜。利用转座子插入得到突变株△twbS,该突变株在生物膜形成功能缺失。经过序列分析,转座子插入基因与Acidovorax avenae sub sp.citrulli AAC00-1和Diaphorobacter sp.TPSY的感应激酶调控因子TwbS分别有60%和61%氨基酸同源性。进一步的研究表明该twbS基因与细菌的蹭行运动和Type IV菌毛的装配有关,从而影响细菌的初步粘附功能,最终达到调控生物膜形成。突变株△twbS可以通过回复突变实验恢复上述功能。

非豆科植物的根瘤菌促生机制的研究进展

近年来,随着对根瘤菌与宿主植物的信号交流和结瘤机制研究的逐步深入,以及非豆科植物的基因改造技术的成熟,根瘤菌的宿主植物范围不断扩大,在非豆科植物中其促生作用不断增强。从非豆科植物中不同根瘤菌促生机制的角度,分别介绍了近年来该领域研究与应用的现状,并对根瘤菌在非豆科植物,尤其是禾本科植物中的应用前景进行展望。

CMH统计分析方法在多中心试验s×r表资料的应用

多中心试验中，有时试验的对象分为两组或两组以上，分别给予不同的处理，其结果作为反应变量不仅仅是二分类，也可能是多分类，且属性可能是有序的，也可能是无序的或名义的，这样构成分层的ｓ×ｒ列联表资料。多中心试验的２×２、２×ｒ（列变量为有序变量）和ｓ×２（...

Delftia tsuruhatensis AD9苯胺双加氧酶基因的过量表达及多功能降解工程菌的构建

Delftia tsuruhatensis AD9和Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2分别能利用苯胺和苯酚作为唯一碳源生长,降解的第一个中间产物均为邻苯二酚,随后裂解为参与三羧酸循环的中间产物。通过PCR方法克隆到苯胺高效降解菌AD9的苯胺双加氧酶基因,并构建表达苯胺双加氧酶的广宿主质粒载体pVD,通过三亲接合,导入到AD9和PHEA-2中。对两种重组菌中苯胺双氧酶基因的表达及苯胺降解特性的分析结果表明,增加苯胺双加氧酶基因的拷贝数可以提高野生型AD9的苯胺降解速率,同时该基因的表达使PHEA-2菌获得苯胺降解能力。

高效降解苯胺的菌株AD9的分离、生理生化特性分析和分子鉴定

从活性污泥中分离到一株能以苯胺为唯一碳源、氮源生长的苯胺降解菌株AD9,该菌株最适生长的苯胺浓度为1000mg/L,降解效率可达90%,对苯胺耐受程度高达4500mg/L,降解苯胺的最适pH值为7.0,最适温度为30℃.以上实验结果表明,AD9具有降解苯胺速率快、耐受苯胺浓度高的特性.该菌具有氨苄青霉素、卡那霉素和利福平抗性,无氯霉素、四环素抗性,其16S rDNA序列与多株Delftia sp.菌有很高的同源性,其G+C含量为66.8 mol%,非常接近于标准菌株D.tsuruhatensis T7(66.2 mol%).另外该菌和T7的DNA-DNA杂交率为83.8%.结合AD9的表型鉴定将该菌株归属为D.tsuruhatensisas.这是D.tsuruhatensis菌种苯胺降解细菌菌株的首次报道.

生物信息学的发展及其应用

本文回顾了生物信息的人类基因组计划时期的基因组信息学与后基因组一蛋白质组时代的基因组信息学 ,简要介绍了不同时期的主要内容 ;介绍了基因组信息在核酸、蛋白质层次上使用的新技术及生物信息学在医药、农业等方面的应用 ;

合成生物学开关在代谢工程中的应用

在代谢工程研究领域中合成生物学开关主要用于调控基因的表达。传统的代谢工程改造主要通过敲除和过表达来改变特定基因的表达量。但基因敲除通常会导致菌体生长的下降。因此,我们需要适时的关闭和激活特定基因的表达。合成生物学开关就是解决这一问题的关键工具。目前,在代谢工程中常用的合成生物学开关有光控开关、温度诱导开关、拨动开关和核糖开关。其中,拨动开关和核糖开关在动态调节基因表达上拥有更大优势。介绍了代谢工程中常用的几种合成生物学开关,以及它们在代谢工程的应用。

谷氨酸棒杆菌生产异亮氨酸辅因子策略及其基因组整合研究进展

L‑异亮氨酸属于三大支链氨基酸,是人体8种必需氨基酸之一,广泛应用于食品、药品、保健品、化妆品等领域。目前,微生物发酵法是工业生产L‑异亮氨酸的主要方法,其中谷氨酸棒杆菌(Corynebacteriumglutamicum)是发酵生产L‑异亮氨酸的优势菌株,然而随机诱变会使产量的提高能力达到饱和,难以得到更加高产的菌株,因此针对诱变菌株进行理性改造已成为进一步提高产量的主要方式;且随着遗传操作技术在谷氨酸棒杆菌中的应用与优化,代谢工程育种已逐渐取代传统的诱变育种。综述了谷氨酸棒杆菌中L‑异亮氨酸的生物合成途径、代谢调控机制和理性改造L‑异亮氨酸生产菌株的策略,并对辅助因子工程应用于理性改造及对谷氨酸棒杆菌基因组整合策略进行了系统阐述,以期为工业水平稳定生产L‑异亮氨酸高产菌株的基因组整合策略提供参考依据。

细菌群体感应系统在细胞间通讯中的应用及其合成生物学研究进展

群体感应(quorum sensing,QS)是一种细菌细胞与细胞间的通讯系统,细菌通过分泌扩散性小分子信号感知细菌群体的密度,从而引起一组特定基因在转录水平协调表达。随着研究的不断深入,群体感应相关基因元件及调控原理逐渐清晰。近年来通过合成生物学手段构建包含细菌QS系统组成部分的基因线路,实现了种内和种间的人工通讯,而且这些基于QS的基因线路在生物技术和生物医药等领域有着巨大的应用潜力。本文综述了几种目前研究相对清楚且有代表性的微生物群体感应系统及其主要功能作用,介绍了基于群体感应系统构建的合成生物学基因线路在种内细胞间通讯和种间细胞间通讯的应用,并讨论了微生物群体感应系统研究在构建生物计算工具、调控种群密度和调节代谢流等方面的未来发展前景。

利用生物基原料合成聚羟基脂肪酸酯

聚羟基脂默醐（polyhydroxyalkanoates，PHA）是细菌胞内的一类具有相似结构的碳源和能源的储备物，由于它的力学性能与某些热塑性材料聚乙烯、聚丙烯类似，并且可以完全降解进入自然界的生态循环，因而被认为是一种“生物可降解塑料”，有可能替代传统的、不可降解的、由石油产品合成的塑料，而受到世界各国的重视。

生物降解聚烯烃类塑料研究进展

聚烯烃类塑料是一类以C–C键为骨架的高分子材料,被广泛应用于日常生活的各个领域。由于具有稳定的化学性质并且难以被环境中的微生物快速降解,聚烯烃塑料废弃物在全球范围内持续积累,造成了严重的环境污染及生态危机。近年来,利用生物方法降解聚烯烃类塑料引起了研究人员的广泛关注。自然界丰富的微生物资源为生物降解聚烯烃类塑料废弃物提供了可能,已经有一些对聚烯烃塑料具有降解能力的微生物被陆续报道。本文总结了聚烯烃类塑料生物降解资源及生物降解机制的研究进展,提出了目前聚烯烃类塑料生物降解过程存在的问题,并对未来的研究方向进行了展望。

转座元件介导的苯胺代谢基因簇的筛选和鉴定

利用苯胺不完全降解时中间代谢产物,如邻苯二酚等的显色反应,建立了简便快速的苯胺代谢途径相关基因的功能筛选方法.从苯胺降解菌株AD9的基因组文库中筛选得到3个阳性重组子pDA1,pDB2和pDB11.AD和C23O酶活测定结果表明,pDA1和pDB11分别含有功能完整的苯胺双加氧酶或邻苯二酚双加氧酶编码基因.经核苷酸序列分析和拼接获得一个大小为24.7kb,含25个可读框的苯胺代谢基因簇,其中含有17个基因与苯胺代谢有关,包括调控基因tadR,苯胺双加氧酶基因簇tadQTA1A2B,邻苯二酚间位裂解途径酶系基因簇tadD1C1D2C2EFGIJKL.苯胺代谢基因簇两侧含有转座酶和IS1071序列.

降解石油基塑料的微生物及微生物菌群

伴随着环境污染的日益严重,处理“白色污染”成为人们面临的一个棘手难题,而各种合成塑料因为应用广泛且很难降解成为其“主要元凶”。利用自然界存在的或者是进化产生的微生物可降解合成塑料是一种环境友好型的策略。以国家自然科学基金国际(地区)合作和交流(中欧组织间合作研究NSFC-EU)项目“合成塑料降解转化微生物菌群”为基础,总结近年来筛选到的能够降解合成塑料,如聚乙烯(Polyethylene,PE)、聚丙烯(Polypropylene,PP)、聚苯乙烯(Polystyrene,PS)、聚氯乙烯(Polyvinyl chloride,PVC)、聚氨酯(Polyurethane,PUR)、聚对苯二甲酸乙二醇酯(Polyethylene terephthalate,PET)的纯细菌、纯真菌及微生物菌群的研究状况,分析了各种微生物在石油基塑料降解中的作用,讨论了微生物及其降解酶对合成塑料降解研究的优缺点。

合成未来:从大肠杆菌的重构看合成生物学的发展

合成生物学(synthetic biology)是伴随着基因工程、系统生物学以及生物信息学的发展而出现的一个新的交叉学科。大肠杆菌(Escherichia coli)作为一种宿主在合成生物学的发展中功不可没。从某种意义上讲,合成生物学的每一次进展都离不开大肠杆菌。从大肠杆菌的角度出发,对合成生物学的发展进行深入分析,并提出了合成生物学在中国发展的重点。

生物合成可降解材料PHA的研究进展和产业化趋势

聚羟基脂肪酸酯(PHA)是一种天然的可降解高分子生物材料,可应用于生物医用和生物可降解包装材料方面。目前,生物合成PHA的研究进展和产业化趋势集中在两个方面:一是进一步降低生产成本,实现生物可降解塑料的大规模生产;另一个就是改善生物可降解塑料的性质,提高生物可降解塑料的应用范围。本文主要针对性质改造方面的研究进展和趋势进行讨论。

人GLP-1-IgG Fc融合蛋白在毕赤酵母中的高效表达

目的:构建GLP-1-IgG Fc融合蛋白分子并在毕赤酵母中实现高效表达。方法:使用蛋白质工程技术改造GLP-1,去除其蛋白酶降解位点,然后利用重叠延伸PCR方法得到改造后的GLP-1与人IgG-Fc片断的嵌合体基因并将其插入pPIC9K载体中。以重组载体转化巴斯德毕赤酵母菌中进行表达。采用SDS-PAGE和Western Blot方法检测重组蛋白的表达。结果:成功的构建了GLP-1-IgG Fc嵌合体基因并使其在重组毕赤酵母中高效分泌表达。在25℃条件下,摇瓶培养添加0.5%甲醇诱导72h后融合蛋白的表达量最大,为5mg/L。SDS-PAGE和Western-Blot结果表明表达产物为GLP-1-IgG Fc融合蛋白。结论:获得了高效表达GLP-1-IgG Fc融合蛋白的毕赤酵母菌株,为GLP-1-IgG Fc的活性和半衰期测定及下一步的开发奠定了基础,并为在毕赤酵母菌中表达其他Fc融合蛋白和抗体提供了参考。