南昌市动物园圈养动物3种肠道原虫的分子检测及基因型鉴定

【目的】隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和芽囊原虫是3种常见的寄生于人、家养动物和野生动物等肠道的寄生原虫,主要引起人和动物的腹泻。试验旨在调查南昌市动物园部分圈养动物3种原虫的感染情况并鉴定其基因型,为制订动物园人兽共患病传播防控措施提供参考依据。【方法】从南昌市动物园采集非人灵长类、偶蹄类、奇蹄类、象类、有袋类、鸟类和食肉类等圈养动物粪便样品共42份,提取粪样总DNA;采用PCR技术扩增隐孢子虫小亚单位核糖体RNA(SSU rRNA)、毕氏肠微孢子虫核糖体RNA内转录间隔区(ITS)和芽囊原虫SSU rRNA基因序列;并对阳性产物进行测序、序列比对及系统进化分析,确定3种肠道原虫的感染情况和基因型。【结果】42份粪便样本中有17份样品原虫为阳性,总检出率40.5%(17/42);其中隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和芽囊原虫感染率分别为2.4%(1/42)、14.3%(6/42)和23.8%(10/42)。检出动物阳性占比分别为:非人灵长类64.7%(11/17)、偶蹄类23.5%(4/17)、奇蹄类5.9%(1/17)、有袋类5.9%(1/17);且非人灵长类动物存在毕氏肠微孢子虫和芽囊原虫混合感染。通过序列比对及系统进化分析,在矮马(奇蹄类)鉴定出1种隐孢子虫基因型(姬鼠基因型II),在长臂猿、金丝猴、博士猴、红尾长尾猴和羊驼中共鉴定到2种毕氏肠微孢子虫基因型(D,ALP1)。在松鼠猴、黑白疣猴、博士猴、黑叶猴、金丝猴、羚羊和袋鼠中共鉴定到5种芽囊原虫基因型(ST1、ST2、ST5、ST13和ST14);其中芽囊原虫(ST1、ST5)和毕氏肠微孢子虫(D、ALP1)均属人兽共患基因型。【结论】南昌市动物园圈养动物存在毕氏肠微孢子虫、芽囊原虫和隐孢子虫感染;从毕氏肠微孢子虫和芽囊原虫中鉴定出人兽共患基因型,有潜在的人兽共患传播风险。动物园应进一步加强圈养动物肠道寄生原虫的监测,做好驱虫、消毒及预防人-兽传播等预防工作。