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猪主要经济性状的基因组选择研究
被引量:
18
1
作者
彭潇
尹立林
+6 位作者
梅全顺
王海燕
刘小磊
朱猛进
李新云
付亮亮
赵书红
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期439-445,共7页
旨在系统比较GBLUP、SSGBLUP、BayesA、BayesB、BayesC、BayesLASSO、BSLMM和BayesR等8种方法对猪重要经济性状基因组选择的准确性。本研究以本实验室收集的2 585头大白猪达100kg日龄、达100kg背膘厚和母猪乳头数3个性状为分析对象,结合...
旨在系统比较GBLUP、SSGBLUP、BayesA、BayesB、BayesC、BayesLASSO、BSLMM和BayesR等8种方法对猪重要经济性状基因组选择的准确性。本研究以本实验室收集的2 585头大白猪达100kg日龄、达100kg背膘厚和母猪乳头数3个性状为分析对象,结合猪50K基因芯片分型数据,以加性模型为基础,利用5倍交叉验证比较8种方法的基因组选择准确性。研究发现,基因组选择的准确性与不同性状估计遗传力呈正相关。交叉验证结果表明,预测准确性最高的性状为达100kg日龄,但不同方法在不同性状中表现并不完全相同,在达100kg日龄和达100kg背膘厚中SSGBLUP基因组预测准确性均为最高,而在母猪乳头数中BayesA的基因组预测准确性最高。综上表明,对小样本开展基因组预测时,中、高等遗传力性状可以选择SSGBLUP方法,低等遗传力性状可以选择BayesA方法。如何优化和选择一种广泛适用于所有性状的方法,可能是未来研究的方向。
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关键词
猪
基因组选择
遗传力
准确性
下载PDF
职称材料
题名
猪主要经济性状的基因组选择研究
被引量:
18
1
作者
彭潇
尹立林
梅全顺
王海燕
刘小磊
朱猛进
李新云
付亮亮
赵书红
机构
华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
生猪健康养殖协同创新中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期439-445,共7页
基金
国家生猪产业技术体系项目(CARS-35)
国家自然科学基金地区间国际重大合作项目(CGIAR31361140365)
+1 种基金
国家自然科学基金(31672391)
华中农业大学大北农青年学者提升专项资助项目(2017DBN019)
文摘
旨在系统比较GBLUP、SSGBLUP、BayesA、BayesB、BayesC、BayesLASSO、BSLMM和BayesR等8种方法对猪重要经济性状基因组选择的准确性。本研究以本实验室收集的2 585头大白猪达100kg日龄、达100kg背膘厚和母猪乳头数3个性状为分析对象,结合猪50K基因芯片分型数据,以加性模型为基础,利用5倍交叉验证比较8种方法的基因组选择准确性。研究发现,基因组选择的准确性与不同性状估计遗传力呈正相关。交叉验证结果表明,预测准确性最高的性状为达100kg日龄,但不同方法在不同性状中表现并不完全相同,在达100kg日龄和达100kg背膘厚中SSGBLUP基因组预测准确性均为最高,而在母猪乳头数中BayesA的基因组预测准确性最高。综上表明,对小样本开展基因组预测时,中、高等遗传力性状可以选择SSGBLUP方法,低等遗传力性状可以选择BayesA方法。如何优化和选择一种广泛适用于所有性状的方法,可能是未来研究的方向。
关键词
猪
基因组选择
遗传力
准确性
Keywords
pig
genomic selection
heritability
accuracy
分类号
S114 [农业科学—农业基础科学]
S828.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪主要经济性状的基因组选择研究
彭潇
尹立林
梅全顺
王海燕
刘小磊
朱猛进
李新云
付亮亮
赵书红
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
18
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