目的:研究黄柏(phellodendri chinrnsis cortex,PCC)治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的作用机制。方法:运用中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)从化...目的:研究黄柏(phellodendri chinrnsis cortex,PCC)治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的作用机制。方法:运用中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)从化合物口服利用度以及类药性两方面对黄柏的活性成分进行筛选和收集,通过人类基因数据库(GeneCards)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选OA的作用靶标。结合STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络,筛选连接度排名前5位的靶蛋白,并利用分子对接服务器预测其与PCC活性成分的结合活性。借助网络拓扑属性分析软件Cytoscape 3.7.1构建PCC活性成分-靶点-OA疾病网络。使用Cytoscape 3.7.1软件中的ClueGO插件对靶点基因本体(gene ontology,GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)中代谢通路进行富集分析。结果:获得生物活性成分37个,相对应的作用靶标78个,得到OA相关的基因靶点共2470个;获取PCC治疗OA的关键靶蛋白45个,筛选出连接度排名前5位的靶蛋白;GO分析与KEGG分析共富集到抗炎、抗软骨氧化、正向调控软骨细胞分化等35个生物过程条目(P<0.001),以及炎症、细胞凋亡、糖尿病相关等47个信号通路条目(P<0.001)。结论:黄柏治疗骨性关节炎的机制具有多成分-多靶点-多层次-多通路的特点,其治疗机制可能通过多个生物过程与通路对骨性关节炎引发的炎症反应进行抑制、对关节软骨进行保护以防治疾病。展开更多
文摘目的:研究黄柏(phellodendri chinrnsis cortex,PCC)治疗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的作用机制。方法:运用中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)从化合物口服利用度以及类药性两方面对黄柏的活性成分进行筛选和收集,通过人类基因数据库(GeneCards)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选OA的作用靶标。结合STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络,筛选连接度排名前5位的靶蛋白,并利用分子对接服务器预测其与PCC活性成分的结合活性。借助网络拓扑属性分析软件Cytoscape 3.7.1构建PCC活性成分-靶点-OA疾病网络。使用Cytoscape 3.7.1软件中的ClueGO插件对靶点基因本体(gene ontology,GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)中代谢通路进行富集分析。结果:获得生物活性成分37个,相对应的作用靶标78个,得到OA相关的基因靶点共2470个;获取PCC治疗OA的关键靶蛋白45个,筛选出连接度排名前5位的靶蛋白;GO分析与KEGG分析共富集到抗炎、抗软骨氧化、正向调控软骨细胞分化等35个生物过程条目(P<0.001),以及炎症、细胞凋亡、糖尿病相关等47个信号通路条目(P<0.001)。结论:黄柏治疗骨性关节炎的机制具有多成分-多靶点-多层次-多通路的特点,其治疗机制可能通过多个生物过程与通路对骨性关节炎引发的炎症反应进行抑制、对关节软骨进行保护以防治疾病。