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题名与NADPH氧化酶相关的植物抗病性研究进展
被引量:1
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作者
梅鹏颖
周常勇
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机构
西南大学
中国农业科学院 柑桔研究所
西南大学植物保护学院
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出处
《江西农业学报》
CAS
2013年第9期90-94,共5页
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基金
教育部创新团队项目(IRT0976)
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文摘
综述了烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)氧化酶及其催化产生的活性氧在植物抗病过程中的作用。
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关键词
NADPH氧化酶
活性氧
植物
抗病性
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Keywords
NADPH oxidase
ROS
Plant
Disease resistance
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分类号
Q554.5
[生物学—生物化学]
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题名基于RNA-Seq技术的黄连根茎与须根转录组分析
被引量:2
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作者
宋旭红
梅鹏颖
李隆云
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机构
重庆市中药研究院
重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心
中国中医科学院中药资源中心重庆分中心
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出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2020年第4期584-593,共10页
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基金
国家中药材产业技术体系(CARS-21)
重庆市现代山地特色高效农业技术体系(2019[5]号)
+2 种基金
重庆市自然基金面上项目(cstc2019jcyj-msxmX0762)
科研机构绩效激励引导专项(cstc2018jxjl-jbky120013)
重庆市卫生卫计委中医药科技项目(ZY201802038)共同资助。
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文摘
采用RNA-Seq技术,对黄连根茎与须根进行转录组分析,经过trinity软件组装得到130592条Unigenes,平均长度为700bp,其中68976条Unigenes在NR、GO、KEGG、egg NOG、Swiss-Prot和Pfam数据库获得基因注释信息,仅占全部Unigenes的52.82%。39572个Unigene被注释到GO数据库的生物学进程、细胞组分和分子功能三大类的52个小类中;参与KEGG的5大类代谢通路,34个代谢路径,共搜索到24999个SSR位点,单核苷酸、两核苷酸和三核苷酸为黄连根部SSR的主要重复基序。黄连根茎与须根的差异表达基因有13496个,在黄连须根中上调的差异基因有8375个,下调的有5121个。两者差异基因GO富集分析表明,跟次生代谢相关进程的前5项为次生代谢进程、次生代谢物生物合成过程、生物碱代谢过程、异喹啉生物碱生物合成过程和异喹啉生物碱代谢过程。在细胞组分分类中,膜结构、细胞壁和外封装结构为差异基因富集的前三;在分子功能分类中,跟氧化还原酶活性相关条目占差异基因富集显著的前四。在KEGG数据库中,共有3749个差异基因定位到125个代谢途径中,其中,24个差异基因注释到异喹啉生物碱生物合成,在关联的8条KEGG通路中,筛选得到11个关键酶基因;同时,有39个差异基因注释到络氨酸代谢途径中,在关联的21条KEGG通路中,筛选得到10种关键酶基因。黄连根部转录组数据的获得为研究黄连异喹啉类生物碱的合成及黄连根茎与须根代谢差异奠定了基础。
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关键词
黄连
根茎与须根
转录组测序技术
差异分析
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Keywords
Coptis chinensis
rhizome and fibrous root
transcriptome sequencing
variance analysis
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分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
S567.52
[农业科学—中草药栽培]
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