猪CREBRF基因生物信息学和表达规律分析

CREBRF基因在雌性动物生殖过程中具有重要调控作用,为了深入了解猪的CREBRF基因特征和功能,对CREBRF基因进行生物信息学分析,并通过RT-qPCR分析不同阶段巴马猪卵巢组织中CREBRF的表达规律。结果显示,在5个品种猪基因组上鉴定到20个CREBRF基因的碱基突变,其中7个为同义突变,13个为错义突变。猪CREBRF基因的CDS区全长1920 bp,共编码639个氨基酸,不稳定系数较高,为亲水性蛋白,有85个高置信度的磷酸化位点和4个糖基化位点,且CREBRF的mRNA具有20个高可信度的m6A甲基化修饰位点,猪、人和小鼠中的CREBRF蛋白保守性较强。RT-qPCR结果显示,猪卵巢中CREBRF基因的表达量在猪出生0和28 d时表达水平较高,随着猪生长发育,在出生180 d时表达量显著降低,在母猪妊娠38和80 d时CREBRF的表达再次升高。通过比对不同品种猪中CREBRF基因CDS区的碱基突变并分析该基因的理化性质及表达规律,发现了CREBRF基因在猪胎儿期、出生早期和妊娠期卵巢组织中的高表达,推测CREBRF在母猪生殖过程中起重要作用,为猪高繁殖力基因挖掘和分子标记开发提供参考。