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基于高密度SNP标记的肉牛人工选择痕迹筛查
被引量:
1
1
作者
刘喜冬
王志鹏
+2 位作者
樊惠中
李俊雅
高会江
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1304-1313,共10页
近年来随着遗传改良工作的实施,人工选择大大提高了肉牛的生产性能并使其遗传基础发生巨大改变。文章基于Illumina BovineSNP50(54K)和BovineHD(770K)两款芯片数据,采用FST检验方法分析牛群的遗传分化,并筛查人工选择在牛的基因组留下...
近年来随着遗传改良工作的实施,人工选择大大提高了肉牛的生产性能并使其遗传基础发生巨大改变。文章基于Illumina BovineSNP50(54K)和BovineHD(770K)两款芯片数据,采用FST检验方法分析牛群的遗传分化,并筛查人工选择在牛的基因组留下的印记。通过全基因组范围内的扫描,共发现47 104个"离群"位点和3064个群体特异的人工选择"候选基因",如CLIC5、TG、CACNA2D1、FSHR等。通过基因注释对基因的生物学过程和分子功能进行富集分析。文章构建了我国肉牛的全基因组的选择信号图谱,为深入研究人工选择和理解生物进化提供线索,且研究结果也显示人工选择对基因组的影响在牛品种遗传改良中发挥了重要作用。
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关键词
牛的基因组
人工选择
单核苷酸多态性
基因注释
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职称材料
西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测
2
作者
齐欣
张静静
+9 位作者
樊惠中
李娟
胡鑫
刘飞
朱波
高雪
陈燕
张路培
高会江
李俊雅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期1539-1545,共7页
旨在探索低密度芯片标记的筛选方法并评估不同低密度芯片的准确性。本研究采用BovineHD高密度芯片,检测西门塔尔牛基因组的SNP位点及其与饱和脂肪酸含量的关联性,根据P值或效应值筛选标记构成低密度芯片,使用IBS聚类分组和随机分组进行...
旨在探索低密度芯片标记的筛选方法并评估不同低密度芯片的准确性。本研究采用BovineHD高密度芯片,检测西门塔尔牛基因组的SNP位点及其与饱和脂肪酸含量的关联性,根据P值或效应值筛选标记构成低密度芯片,使用IBS聚类分组和随机分组进行交叉验证,估计基因组育种值并评估其准确性。结果表明,在14号染色体的MYC基因附近有5个位点与饱和脂肪酸性状显著相关,可考虑作为西门塔尔牛脂肪酸含量的候选基因进行后续研究。根据P值筛选标记并使用IBS聚类分组进行交叉验证时,估计基因组育种值准确性最高,芯片密度达到7K时准确性趋于稳定。因此,本研究发现的标记位点可能对西门塔尔牛的脂肪酸含量存在一定影响,并且为低密度芯片标记位点的筛选提供参考资料。
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关键词
全基因组关联分析
基因组选择
低密度芯片
SNP
西门塔尔牛
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职称材料
中国濒危兽类保护基因组学和宏基因组学研究进展与展望
被引量:
8
3
作者
魏辅文
黄广平
+1 位作者
樊惠中
胡义波
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期581-590,共10页
揭示濒危兽类的演化历史、濒危机制及适应性演化策略,是保护生物学关注的重大科学问题。近十几年来,高通量测序技术的不断发展以及多学科交叉融合,为揭示濒危物种的演化历史、遗传结构、适应性演化及其与肠道微生物的协同演化的分子机...
揭示濒危兽类的演化历史、濒危机制及适应性演化策略,是保护生物学关注的重大科学问题。近十几年来,高通量测序技术的不断发展以及多学科交叉融合,为揭示濒危物种的演化历史、遗传结构、适应性演化及其与肠道微生物的协同演化的分子机制提供了重要的技术支撑,由此产生了保护基因组学和保护宏基因组学两个分支学科,为野生动物尤其是濒危动物的保护生物学研究提供了新的方向与思路。本文综述了我国在保护基因组学和保护宏基因组学领域取得的重要进展,并展望未来的发展趋势,以期进一步推动我国濒危兽类保护生物学的发展。
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关键词
保护基因组学
保护宏基因组学
濒危兽类
适应性演化
肠道微生物
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职称材料
浅析基层银行超量负债问题
4
作者
樊惠中
陈继朝
《武汉金融》
1988年第6期34-36,共3页
我国银行信贷资金管理体制改革以来,逐步解决了信贷资金“供给制”的问题,打破了信贷资金管理上的“大锅饭”。人民银行不包专业银行的资金,上级行不包下级行的资金,对各专业银行搞活资金,加速社会经济活动中的资金周转,提高资金使用效...
我国银行信贷资金管理体制改革以来,逐步解决了信贷资金“供给制”的问题,打破了信贷资金管理上的“大锅饭”。人民银行不包专业银行的资金,上级行不包下级行的资金,对各专业银行搞活资金,加速社会经济活动中的资金周转,提高资金使用效益起到了积极作用。同时对银行资金经营管理也提出了更高的要求。特别是资金贫缺、投资饥渴地区的银行,如果不对资金的经营进行认真研究,量体裁衣,采取切实可行的对策,就很容易导致资金经营的恶性循环。一方面资金短缺成为经济发展的难点。
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关键词
基层银行
银行信贷资金
资金市场
银行资金
信贷管理体制
资金周转
负债问题
经济活动
沉淀资金
自有流动资金
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职称材料
加强工会企事业财务管理
5
作者
樊惠中
《中国工会财会》
1999年第1期15-15,共1页
工会企事业财务管理工作,是近年来工会财务工作的新课题。如何做好这项工作,是各级工会财务人员一直探讨的问题。加强工会企事业财务管理,一要完善企事业外部制约机制,二要加强企事业内部管理。我想结合我市情况谈一些粗浅看法。一...
工会企事业财务管理工作,是近年来工会财务工作的新课题。如何做好这项工作,是各级工会财务人员一直探讨的问题。加强工会企事业财务管理,一要完善企事业外部制约机制,二要加强企事业内部管理。我想结合我市情况谈一些粗浅看法。一、逐步完善工会企事业的外部制约机制...
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关键词
工会企事业
财务管理
对策
原文传递
题名
基于高密度SNP标记的肉牛人工选择痕迹筛查
被引量:
1
1
作者
刘喜冬
王志鹏
樊惠中
李俊雅
高会江
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
东北农业大学动物科学技术学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1304-1313,共10页
基金
优质肉牛新品种(系)选育与关键技术研究及示范项目(编号:2011BAD28B04)
基于高密度SNP建立中国肉牛群体全基因组选择优化方案(编号:2010jc-2)
现代农业(肉牛)产业技术体系岗位科学家项目(编号:CARS-38)资助
文摘
近年来随着遗传改良工作的实施,人工选择大大提高了肉牛的生产性能并使其遗传基础发生巨大改变。文章基于Illumina BovineSNP50(54K)和BovineHD(770K)两款芯片数据,采用FST检验方法分析牛群的遗传分化,并筛查人工选择在牛的基因组留下的印记。通过全基因组范围内的扫描,共发现47 104个"离群"位点和3064个群体特异的人工选择"候选基因",如CLIC5、TG、CACNA2D1、FSHR等。通过基因注释对基因的生物学过程和分子功能进行富集分析。文章构建了我国肉牛的全基因组的选择信号图谱,为深入研究人工选择和理解生物进化提供线索,且研究结果也显示人工选择对基因组的影响在牛品种遗传改良中发挥了重要作用。
关键词
牛的基因组
人工选择
单核苷酸多态性
基因注释
Keywords
bovine genome
artificial selection
single nucleotide polymorphism
gene annotation
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测
2
作者
齐欣
张静静
樊惠中
李娟
胡鑫
刘飞
朱波
高雪
陈燕
张路培
高会江
李俊雅
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
吉林农业大学动物科技学院
内蒙古民族大学动物科学技术学院
河北农业大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期1539-1545,共7页
基金
农业部专项(CARS-38)
国家自然科学基金(31372294)
中国农业科学院科技创新工程经费(cxgc-ias-03)
文摘
旨在探索低密度芯片标记的筛选方法并评估不同低密度芯片的准确性。本研究采用BovineHD高密度芯片,检测西门塔尔牛基因组的SNP位点及其与饱和脂肪酸含量的关联性,根据P值或效应值筛选标记构成低密度芯片,使用IBS聚类分组和随机分组进行交叉验证,估计基因组育种值并评估其准确性。结果表明,在14号染色体的MYC基因附近有5个位点与饱和脂肪酸性状显著相关,可考虑作为西门塔尔牛脂肪酸含量的候选基因进行后续研究。根据P值筛选标记并使用IBS聚类分组进行交叉验证时,估计基因组育种值准确性最高,芯片密度达到7K时准确性趋于稳定。因此,本研究发现的标记位点可能对西门塔尔牛的脂肪酸含量存在一定影响,并且为低密度芯片标记位点的筛选提供参考资料。
关键词
全基因组关联分析
基因组选择
低密度芯片
SNP
西门塔尔牛
Keywords
GWAS
genomic selection
low density chip
SNP
Simmental
分类号
S823.92 [农业科学—畜牧学]
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
中国濒危兽类保护基因组学和宏基因组学研究进展与展望
被引量:
8
3
作者
魏辅文
黄广平
樊惠中
胡义波
机构
中国科学院动物研究所
出处
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期581-590,共10页
基金
国家自然科学基金创新研究群体项目(31821001)
文摘
揭示濒危兽类的演化历史、濒危机制及适应性演化策略,是保护生物学关注的重大科学问题。近十几年来,高通量测序技术的不断发展以及多学科交叉融合,为揭示濒危物种的演化历史、遗传结构、适应性演化及其与肠道微生物的协同演化的分子机制提供了重要的技术支撑,由此产生了保护基因组学和保护宏基因组学两个分支学科,为野生动物尤其是濒危动物的保护生物学研究提供了新的方向与思路。本文综述了我国在保护基因组学和保护宏基因组学领域取得的重要进展,并展望未来的发展趋势,以期进一步推动我国濒危兽类保护生物学的发展。
关键词
保护基因组学
保护宏基因组学
濒危兽类
适应性演化
肠道微生物
Keywords
Conservation genomics
Conservation metagenomics
Threatened mammals
Adaptive evolution
Gut microbiota
分类号
Q16 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
浅析基层银行超量负债问题
4
作者
樊惠中
陈继朝
机构
人民银行湖北蒲圻支行
出处
《武汉金融》
1988年第6期34-36,共3页
文摘
我国银行信贷资金管理体制改革以来,逐步解决了信贷资金“供给制”的问题,打破了信贷资金管理上的“大锅饭”。人民银行不包专业银行的资金,上级行不包下级行的资金,对各专业银行搞活资金,加速社会经济活动中的资金周转,提高资金使用效益起到了积极作用。同时对银行资金经营管理也提出了更高的要求。特别是资金贫缺、投资饥渴地区的银行,如果不对资金的经营进行认真研究,量体裁衣,采取切实可行的对策,就很容易导致资金经营的恶性循环。一方面资金短缺成为经济发展的难点。
关键词
基层银行
银行信贷资金
资金市场
银行资金
信贷管理体制
资金周转
负债问题
经济活动
沉淀资金
自有流动资金
分类号
F83 [经济管理—金融学]
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职称材料
题名
加强工会企事业财务管理
5
作者
樊惠中
机构
张家口市总工会财务部
出处
《中国工会财会》
1999年第1期15-15,共1页
文摘
工会企事业财务管理工作,是近年来工会财务工作的新课题。如何做好这项工作,是各级工会财务人员一直探讨的问题。加强工会企事业财务管理,一要完善企事业外部制约机制,二要加强企事业内部管理。我想结合我市情况谈一些粗浅看法。一、逐步完善工会企事业的外部制约机制...
关键词
工会企事业
财务管理
对策
分类号
D412.67 [政治法律—国际共产主义运动]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高密度SNP标记的肉牛人工选择痕迹筛查
刘喜冬
王志鹏
樊惠中
李俊雅
高会江
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
下载PDF
职称材料
2
西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测
齐欣
张静静
樊惠中
李娟
胡鑫
刘飞
朱波
高雪
陈燕
张路培
高会江
李俊雅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
下载PDF
职称材料
3
中国濒危兽类保护基因组学和宏基因组学研究进展与展望
魏辅文
黄广平
樊惠中
胡义波
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
8
下载PDF
职称材料
4
浅析基层银行超量负债问题
樊惠中
陈继朝
《武汉金融》
1988
0
下载PDF
职称材料
5
加强工会企事业财务管理
樊惠中
《中国工会财会》
1999
0
原文传递
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