利用生物信息学方法,对丹参LBD(later organ boundaries domain)家族成员(SmLBDs)进行了系统的筛选和鉴定,并分析了其在高温胁迫(37℃)下的表达模式。结果表明,丹参中共有52个SmLBDs,可分为groupⅠ、groupⅡ、groupⅢ、groupⅣ、groupⅤ...利用生物信息学方法,对丹参LBD(later organ boundaries domain)家族成员(SmLBDs)进行了系统的筛选和鉴定,并分析了其在高温胁迫(37℃)下的表达模式。结果表明,丹参中共有52个SmLBDs,可分为groupⅠ、groupⅡ、groupⅢ、groupⅣ、groupⅤ、groupⅥ和groupⅦ共7组。52个SmLBDs编码蛋白的氨基酸残基数为103~298,相对分子质量为11.29~31.72 k Da,等电点分布于4.44~10.71,均为亲水性蛋白,且大多定位在细胞核中。此外,分析52个SmLBDs在高温胁迫(37℃)下的表达模式发现,7个基因的表达水平下降,37个基因的表达水平上升,尤其是SmLBD8、SmLBD40和SmLBD44的表达水平显著提高,表明这些基因可能与丹参的抗热性相关。展开更多
文摘利用生物信息学方法,对丹参LBD(later organ boundaries domain)家族成员(SmLBDs)进行了系统的筛选和鉴定,并分析了其在高温胁迫(37℃)下的表达模式。结果表明,丹参中共有52个SmLBDs,可分为groupⅠ、groupⅡ、groupⅢ、groupⅣ、groupⅤ、groupⅥ和groupⅦ共7组。52个SmLBDs编码蛋白的氨基酸残基数为103~298,相对分子质量为11.29~31.72 k Da,等电点分布于4.44~10.71,均为亲水性蛋白,且大多定位在细胞核中。此外,分析52个SmLBDs在高温胁迫(37℃)下的表达模式发现,7个基因的表达水平下降,37个基因的表达水平上升,尤其是SmLBD8、SmLBD40和SmLBD44的表达水平显著提高,表明这些基因可能与丹参的抗热性相关。
