目的对陕西省2009~2012年肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)的分子流行病学特征进行研究。方法采用体外逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction,RT—PCR),对陕西省2009—2012年分离白手足...目的对陕西省2009~2012年肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)的分子流行病学特征进行研究。方法采用体外逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction,RT—PCR),对陕西省2009—2012年分离白手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)病例的38株EV71进行衣壳蛋白(Capsid Protein)VP1编码区基因序列扩增。通过双脱氧末端终止法(Sanger法)测序,获得VP1编码区核苷酸序列。采用软件Sequeneher5.0和MEGA5.0对序列进行生物信息学分析。结果陕西省2009~2012年流行的EV71与C4基因型C4a分支具有最高的核苻酸序列同源性,为93.4%~99.4%;与C4a分支代表株在亲缘性关系树上具有最近的进化关系。陕西省EV71具有较高核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为93.3%~100%(平均97.3%)和98.3%~100%(平均99.4%)。但相同年代和不同年代EV71毒株间的核苷酸序列平均差异随年代逐渐增大。结论陕西省2009~2012年流行的EV71均属于C4基因亚型C4a分支,为中国近年来流行的优势基因亚型。陕西省EV71具有较高的基因同源性,但基因多态性随着时间逐渐增大。进一步阐明EV71在陕西省的变异变迁规律,需继续开展并加强EV71的分子流行病学监测。展开更多
目的探讨支原体污染对手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)相关肠道病毒(Enterovirus,EV)分离率的影响。方法随机选择13个省的HFMD相关EV培养物共26份,同时从EV复核率较低的某省送检的HFMD相关EV培养物中,随机挑选18份,采用套...目的探讨支原体污染对手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)相关肠道病毒(Enterovirus,EV)分离率的影响。方法随机选择13个省的HFMD相关EV培养物共26份,同时从EV复核率较低的某省送检的HFMD相关EV培养物中,随机挑选18份,采用套式聚合酶链反应(Nested Polymerase Chain Reaction,nPCR)对细胞培养物中的支原体核酸进行检测。对阳性产物进行序列测定,通过基本多序列比对工具(Basic Local Alignment Search Tool,BLAST)对序列进行同源性比对。结果随机挑选13个省的EV培养物中,4个省的标本支原体检测结果为阴性,1个省同时检出猪鼻支原体和精氨酸支原体,8个省检出精氨酸支原体。EV复核率较低省送检的18份培养物中均检出牛支原体。结论支原体污染在中国HFMD实验室使用的细胞系中普遍存在,某些支原体的污染,可能降低细胞的敏感性,引起病毒分离率的下降。避免细胞系的支原体污染对提高HFMD实验室网络运转质量具有重要意义。展开更多
目的开展手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原学和流行病学系统研究,以满足我国对HFMD防控的迫切需求。方法建立并完善覆盖全国范围的HFMD三级实验室监测网络体系,将研制的针对我国HFMD防控所急需的系列组合检测和监测技术...目的开展手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原学和流行病学系统研究,以满足我国对HFMD防控的迫切需求。方法建立并完善覆盖全国范围的HFMD三级实验室监测网络体系,将研制的针对我国HFMD防控所急需的系列组合检测和监测技术推广应用到各省、市级实验室,开展全国范围内的HFMD病原学检测和流行病学监测工作。结果通过连续多年、系统的HFMD病原学和流行病学研究,结果显示,肠道病毒71型(EV-A71)在HFMD病原的构成比例与当地出现重症和死亡病例的多少呈高度正相关;证实C4基因亚型是我国EV-A71引起的HFMD流行的绝对优势本土基因亚型,同时依据C4基因亚型的变异变迁规律,将其进一步划分为C4a和C4b两个进化分支,EV-A71C4a和C4b的更替与2008年之后我国HFMD重症和死亡病例增多密切相关;在此基础上,完成了EV-A71灭活疫苗种子毒株的筛选;同时,阐明了我国HFMD流行特征及规律,揭示了健康人群中EV-A71和CV-A16抗体水平及变化趋势;解析了我国HFMD病原谱构成,发现多种肠道病毒可引起HFMD疫情暴发,且不同年代和地区HFMD病原谱构成存在动态变化。结论本研究是国内外唯一连续多年针对HFMD开展系统病原学监测和研究的项目。对我国HFMD防控,保护我国儿童生命健康有非常重要的科学意义。展开更多
目的分析引起吉林省2009--2010年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型的基因进化特征。方法选择31株2009-2010年分离于吉林省8个地市(州)HFMD病例的EV71代表株,对VP1编码区基因进行逆转录.聚合酶链反...目的分析引起吉林省2009--2010年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型的基因进化特征。方法选择31株2009-2010年分离于吉林省8个地市(州)HFMD病例的EV71代表株,对VP1编码区基因进行逆转录.聚合酶链反应扩增、扩增产物的序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1基因进行同源性、基因亲缘关系分析。结果吉林省2009-2010年的31株EV71分离株均属于C4a基因亚型,3l株EV7t株在VP1区的核苷酸的同源性在94.5%~100%之间,分属于5个分支,其中25株病毒(分离于8个地市)形成一个大的分支,属于绝对优势传播链,其余6株形成4个小分支。结论2009-2010年在吉林省内有多个EV71C4a基因型的传播链同时存在,其中分支1为绝对优势传播链,在8个地市持续传播,引起HFMD的暴发流行。展开更多
文摘目的对陕西省2009~2012年肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)的分子流行病学特征进行研究。方法采用体外逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction,RT—PCR),对陕西省2009—2012年分离白手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)病例的38株EV71进行衣壳蛋白(Capsid Protein)VP1编码区基因序列扩增。通过双脱氧末端终止法(Sanger法)测序,获得VP1编码区核苷酸序列。采用软件Sequeneher5.0和MEGA5.0对序列进行生物信息学分析。结果陕西省2009~2012年流行的EV71与C4基因型C4a分支具有最高的核苻酸序列同源性,为93.4%~99.4%;与C4a分支代表株在亲缘性关系树上具有最近的进化关系。陕西省EV71具有较高核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为93.3%~100%(平均97.3%)和98.3%~100%(平均99.4%)。但相同年代和不同年代EV71毒株间的核苷酸序列平均差异随年代逐渐增大。结论陕西省2009~2012年流行的EV71均属于C4基因亚型C4a分支,为中国近年来流行的优势基因亚型。陕西省EV71具有较高的基因同源性,但基因多态性随着时间逐渐增大。进一步阐明EV71在陕西省的变异变迁规律,需继续开展并加强EV71的分子流行病学监测。
文摘目的开展手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原学和流行病学系统研究,以满足我国对HFMD防控的迫切需求。方法建立并完善覆盖全国范围的HFMD三级实验室监测网络体系,将研制的针对我国HFMD防控所急需的系列组合检测和监测技术推广应用到各省、市级实验室,开展全国范围内的HFMD病原学检测和流行病学监测工作。结果通过连续多年、系统的HFMD病原学和流行病学研究,结果显示,肠道病毒71型(EV-A71)在HFMD病原的构成比例与当地出现重症和死亡病例的多少呈高度正相关;证实C4基因亚型是我国EV-A71引起的HFMD流行的绝对优势本土基因亚型,同时依据C4基因亚型的变异变迁规律,将其进一步划分为C4a和C4b两个进化分支,EV-A71C4a和C4b的更替与2008年之后我国HFMD重症和死亡病例增多密切相关;在此基础上,完成了EV-A71灭活疫苗种子毒株的筛选;同时,阐明了我国HFMD流行特征及规律,揭示了健康人群中EV-A71和CV-A16抗体水平及变化趋势;解析了我国HFMD病原谱构成,发现多种肠道病毒可引起HFMD疫情暴发,且不同年代和地区HFMD病原谱构成存在动态变化。结论本研究是国内外唯一连续多年针对HFMD开展系统病原学监测和研究的项目。对我国HFMD防控,保护我国儿童生命健康有非常重要的科学意义。
文摘目的分析引起吉林省2009--2010年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型的基因进化特征。方法选择31株2009-2010年分离于吉林省8个地市(州)HFMD病例的EV71代表株,对VP1编码区基因进行逆转录.聚合酶链反应扩增、扩增产物的序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1基因进行同源性、基因亲缘关系分析。结果吉林省2009-2010年的31株EV71分离株均属于C4a基因亚型,3l株EV7t株在VP1区的核苷酸的同源性在94.5%~100%之间,分属于5个分支,其中25株病毒(分离于8个地市)形成一个大的分支,属于绝对优势传播链,其余6株形成4个小分支。结论2009-2010年在吉林省内有多个EV71C4a基因型的传播链同时存在,其中分支1为绝对优势传播链,在8个地市持续传播,引起HFMD的暴发流行。