SEMA3B在胃癌中的表达及临床意义

目的探讨Semaphorin-3B(SEMA3B)在胃癌细胞中的表达及其与胃癌患者临床病理特征及预后的关系。方法用RT-qPCR检测20对新鲜的胃癌与癌旁组织中SEMA3B基因mRNA表达水平,用免疫组织化学的方法检测27对石蜡包埋的胃癌与癌旁组织样品中蛋白表达水平。同时利用TCGA和GEO数据库中的相关数据对胃癌与正常胃黏膜中SEMA3B基因mRNA水平进行差异分析。利用免疫组织化学的方法检测232例胃癌组织中SEMA3B蛋白的表达水平,进一步分析SEMA3B蛋白表达水平与胃癌患者的临床病理特征及预后的关系。结果与正常胃黏膜相比,SEMA3B基因在胃癌组织中的mRNA和蛋白表达水平均显著降低。胃癌组织中,SEMA3B蛋白表达水平与肿瘤细胞分化程度(P<0.001)、肿瘤长径(P<0.05)、M分期(P<0.05)及TNM分期(P<0.05)显著相关。此外,SEMA3B在胃癌中的低表达与胃癌患者术后更高的死亡风险相关,多因素Cox回归分析表明SEMA3B蛋白表达水平可作为提示胃癌患者预后的独立因素(HR=1.616,95%CI:1.121-2.332,P=0.010)。结论SEMA3B在胃癌组织中显著低表达,SEMA3B蛋白低表达与胃癌患者的不良预后密切相关。SEMA3B的表达水平可作为胃癌患者预后的分子指标。

结直肠癌奥沙利铂耐药关键基因的生物信息学分析及意义

目的筛选与结直肠癌(CRC)中奥沙利铂(OXA)耐药性相关的基因和通路。方法首先通过GEO数据库分析GSE76092的基因表达谱,筛选出CRC的OXA敏感和OXA耐药细胞系之间的差异表达基因(DEGs)。利用DAVID数据库进行基因本体论(Go)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。通过STRING工具构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。经MCODE插件选择关键基因,并利用GEPIA工具进行生存分析。最后使用miRWalk数据库预测相关的miRNA。结果通过数据分析总共获得474个DEGs,并筛选了相关的信号通路和PPI网络。筛选出15个中心基因,其中7个显著参与NF-κB和趋化因子信号等通路。对7个关键基因的生存分析表明,CXCL8、IL-1β和PTGS2表达水平与CRC患者的总体生存相关。预测hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-7851-3p和hsa-miR-96-3p是OXA耐药相关核心miRNA。结论基于生物信息学筛选出来的OXA耐药关键基因和信号通路,为CRC中OXA耐药的潜在机制提供更深入的了解。