珠海口岸首次检出的输入性猴痘病毒全基因组序列特征分析

目的了解珠海口岸首例输入性猴痘病毒基因组特征和遗传变异情况,为口岸猴痘防控工作提供技术支撑。方法提取珠海口岸首次检出的输入性猴痘病例咽拭子样本核酸,采用猴痘全基因组测序建库辅助试剂盒进行多重PCR靶向扩增病毒全基因组序列,并利用纳米孔三代测序仪开展测序,使用生物信息学软件对毒株的全基因组序列特征、毒株分型和变异位点进行分析。结果珠海口岸首例输入性猴痘病毒序列全长197177 nt,与参考序列(NC_063383.1)核苷酸同源性为95.7%,含有36个氨基酸突变,涉及宿主免疫调控、病毒表面结构等多种功能改变。系统进化分析显示,与LC760460(日本,2023)、OR855744(韩国,2023)、LC753968(日本,2022)聚类在同一分支,均属IIb C.1谱系。结论珠海口岸首次检出的输入性猴痘病毒属IIb C.1谱系,共有36个氨基酸突变,应持续开展猴痘病毒及其基因变异监测。