翘嘴鳜雄性特异NLRP3基因cDNA的克隆及表达分析

NLRP3基因是能够识别PAMPs和胞内危险信号的1种重要的炎性小体,参与机体对体内外病原微生物的防御和维持自身稳态。首次发现翘嘴鳜存在1个雄性特异的NLRP3基因。通过设计基因特异扩增引物,并在22条雌鱼和22条雄鱼中进行PCR扩增,证实了该基因只在翘嘴鳜雄鱼中存在。为了解该NLRP3基因的潜在功能,成功克隆得到该基因的全长蛋白编码序列,并通过序列比对和系统发育分析,初步证明该基因具有NACHT、LRR和PYD等多个关键结构域,在鲈形目鱼类中具有较高的保守性。另外,通过荧光定量分析的方法研究了NLRP3基因在雄性翘嘴鳜不同组织以及在不同时期性腺中的表达差异,发现翘嘴鳜NLRP3基因在肝脏、胃和肠等组织有较高的表达,且在翘嘴鳜雄性性别分化早期有显著高表达,在性别分化后几乎不表达。

基于转录组测序解析翘嘴鳜适应人工饲料的分子机制

对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)进行了为期4个月的饲养对比试验,针对不同食性翘嘴鳜开展转录组测序分析。研究结果显示,对照组与实验组差异基因(DEGs)注释主要集中在糖代谢、脂代谢以及免疫反应。GO富集分析显示,肝脏中有36个条目被显著富集,而KEGG通路富集显示,蛋白酶体通路及神经活性配体与受体的相互作用通路被显著富集。研究结果发现蛋白酶体以及神经活性配体与受体的相互作用通路可能在翘嘴鳜适应人工配合饲料的过程中发挥重要作用。同时,荧光定量PCR结果显示,投喂人工饲料后,翘嘴鳜糖代谢、脂代谢以及摄食相关基因表达量下调,免疫相关基因表达量上调,表明糖脂代谢可能在翘嘴鳜适应人工饲料的过程中有着重要的作用。

克氏原螯虾CSGalNAcT-1基因功能初步研究

为探究硫酸软骨素N-乙酰半乳糖胺基转移酶-1(chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase-1,CSGalNAcT-1)在克氏原螯虾免疫反应中的作用,利用RACE技术成功获得克氏原螯虾CSGalNAcT-1基因完整cDNA序列,并通过荧光定量PCR分析该基因在各组织中的表达模式以及在CpG寡脱氧核苷酸(ODN)、嗜水气单胞菌和白斑综合征病毒(WSSV)刺激后的表达情况。结果显示,克氏原螯虾CSGalNAcT-1基因在中肠的相对表达量最高,其次是近胃段肠,在心脏、胃、肌肉和围食道神经中的相对表达量较低。克氏原螯虾肝胰腺、血细胞中CSGalNAcT-1基因表达量在嗜水气单胞菌和WSSV刺激下呈现出下调及上调,而在注射免疫刺激剂CpG ODN后,CSGalNAcT-1基因表达水平在大部分组织中呈现上调。表明克氏原螯虾CSGalNAcT-1基因可能在抵御外界病原侵染以及增强自身免疫反应的过程中发挥重要作用。