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2017年黑龙江省禽腺病毒4型分离株Hexon基因的遗传特征分析
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作者 王天 步梦娇 +5 位作者 刘增禄 周金玲 刘宇 刘通 岳山 朱战波 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2018年第9期965-968,973,共5页
目的分析2017年黑龙江省禽腺病毒4型(fowl adenovirus-4,FAd V-4)分离株Hexon基因的遗传特征。方法提取疑似心包积液综合征(hydropericardium syndrome,HPS)的病鸡肝脏DNA,以其为模板,经PCR扩增Hexon基因,并进行测序。采用BLAST软件对He... 目的分析2017年黑龙江省禽腺病毒4型(fowl adenovirus-4,FAd V-4)分离株Hexon基因的遗传特征。方法提取疑似心包积液综合征(hydropericardium syndrome,HPS)的病鸡肝脏DNA,以其为模板,经PCR扩增Hexon基因,并进行测序。采用BLAST软件对Hexon基因序列进行数据库比对;采用Meg Align软件进行核苷酸和氨基酸同源性比对;采用Mega 6软件将分离获得的FAd V-4菌株及35个参考FAd V菌株的全长Hexon基因构建系统进化树。结果 Hexon基因PCR产物长度为1 204 bp,将分离株命名为FAd V-4-DQ。与其他8个FAd V分离株核苷酸和氨基酸的同源性分别为34.6%~98.7%和22.0%~95.7%,其中与中国2015年FAd V-4 HNHB分离株及2016年FAd V-4 HN151025分离株的核苷酸和氨基酸的同源性较高,分别为98.7%、95.7%和98.6%、95.2%;其次是与印度2008年的FAd V-4 PJ-06分离株的核苷酸和氨基酸的同源性较高,分别为98.2%和94.4%。基因进化树分析显示,FAd V-4-DQ株与中国2015及2016年的15个分离株基因型属于同一个进化分枝,并由同一祖先进化。结论本研究获得的FAd V分离株属血清型FAd V-4型,FAd V-C种,与中国2015及2016年流行毒株同属一个基因簇,并推测该分离株起源于印度早期菌株。 展开更多
关键词 禽腺病毒4型 Hexon基因 序列分析 同源性
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