DNA损伤环境下的裂殖酵母lncRNA表达谱分析

LncRNA在真核生物中广泛转录,且响应于细胞外环境的变化.相比于mRNA,人们对lncRNA在DNA损伤应答中的作用了解甚少.基于高通量测序,本文系统地分析了裂殖酵母在4种DNA损伤药物(喜树碱、羟基脲、甲基磺酸甲酯和腐草霉素)处理下的lncRNA表达谱.与mRNA相似,在DNA损伤环境下,lncRNA的表达谱也发生了剧烈变化.161个受到4种药物共同诱导的lncRNA及194个受到共同抑制的lncRNA被定义为核心DNA损伤应答lncRNA.LncRNA表达谱和mRNA表达谱之间的差异表明,lncRNA在DNA损伤应答中起着重要功能,且这些功能可能并不依赖于调控邻近的mRNA.这项研究为进一步研究裂殖酵母中的lncRNA在DNA损伤应答中的功能提供了基础和参考.