鸭源H6N6禽流感病毒贵州株NS基因的克隆及序列分析

为明确贵州地区鸭群中H6N6亚型禽流感病毒(AIV)中非结构蛋白基因(NS)系统进化情况,试验于2014年从贵州省健康三穗鸭体内分离鉴定出的一株H6N6亚型禽流感病毒A/duck/Guizhou/013/2014(DK/GZ/14),对其禽流感病毒NS基因进行扩增,并克隆到p MD-18T载体中测序,获得NS蛋白的完整编码序列;同时将NS核苷酸序列与Gen Bank中已有的参考序列作比对。结果表明:DK/GZ/14的NS基因与江西毒株2009年鸭源H6N6亚型禽流感病毒同源性最高,达99.5%;由遗传进化树可知,NS基因在遗传进化关系上与2009年广西分离株位于同一分支,而与2005年分离的汕头毒株不处于同一分支,DK/GZ/14与邻省的H6N6毒株亲缘关系较近。