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UV-B胁迫下紫花苜蓿qRT-PCR内参基因的筛选
被引量:
5
1
作者
张薇
崔为体
+3 位作者
段星亮
汪瑾
沈文飚
谢彦杰
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期248-254,共7页
[目的]在植物代谢通路关键调控基因表达的相关研究中,筛选各种条件下合适的内参基因至关重要。[方法]以UV-B为主要胁迫,运用荧光定量PCR技术以及geNorm和NormFinder软件,对不同取样时间(处理后0、1、2和5d)的紫花苜蓿(MedicagosativaL....
[目的]在植物代谢通路关键调控基因表达的相关研究中,筛选各种条件下合适的内参基因至关重要。[方法]以UV-B为主要胁迫,运用荧光定量PCR技术以及geNorm和NormFinder软件,对不同取样时间(处理后0、1、2和5d)的紫花苜蓿(MedicagosativaL.)幼苗根、茎、叶组织中Actin2、GAPDH、MSC27、18SRNA、β-tublin、bZIP、UBQ、PPPrep、Ms03_50f03和Ms03_69f07等候选内参基因表达的稳定性进行研究。[结果]geNorm软件显示:紫花苜蓿幼苗根部UV-B胁迫下MSC27和UBQ的稳定值(M)较小,增加第3个内参基因后变异值(V)基本不变,表明选用2个内参基因即可;茎部则是MSC27和Actin2的M值较小,同时相应的V值也满足要求;而使用M值较小的Actin2和GAPDH为内参,在研究叶片基因表达时可以获得更加准确的结果,当增加第3个内参基因时,V值变大,反而影响结果。同时发现,18SRNA和β-tublin在根和茎叶中的稳定性均较差,因此不适宜作为内参基因使用。NormFinder的结果与上述结果相似,结果差异部分的原因可能是因为算法不同。[结论]在UV-B胁迫下,紫花苜蓿幼苗根部中MSC27和UBQ的表达较为稳定,而在茎部则以MSC27和Actin2为宜,使用Actin2和GAPDH为内参在研究叶片基因表达时可以获得更加准确的结果。本研究对UV-B胁迫下紫花苜蓿中关键基因的定量表达分析具有重要的实用价值。
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关键词
紫花苜蓿
实时荧光定量PCR
内参基因
GENORM
NORMFINDER
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职称材料
植物ABI4转录因子的研究进展
被引量:
5
2
作者
段星亮
张晶
+2 位作者
宋晓东
谢彦杰
沈文飚
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期19-27,共9页
Abscisic acid-insensitive 4(ABI4)属于APETALA2/ethy lene responsive factor(AP2/ERF)类转录因子,它是在研究ABA信号转导途径中被发现和鉴定的。近年来,ABI4被认为是一种具有多种调节功能的转录因子,它参与了植物种子萌发和幼苗形态...
Abscisic acid-insensitive 4(ABI4)属于APETALA2/ethy lene responsive factor(AP2/ERF)类转录因子,它是在研究ABA信号转导途径中被发现和鉴定的。近年来,ABI4被认为是一种具有多种调节功能的转录因子,它参与了植物种子萌发和幼苗形态建成、质体/线粒体反向信号传递、脂类合成和分解、糖信号和ABA应答等诸多重要的生物学事件。本文综述了ABI4转录因子的结构特征、转录调控模式、基因表达调控和参与的信号转导功能等的最新研究进展。
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关键词
植物
ABI4
转录因子
信号转导
原文传递
题名
UV-B胁迫下紫花苜蓿qRT-PCR内参基因的筛选
被引量:
5
1
作者
张薇
崔为体
段星亮
汪瑾
沈文飚
谢彦杰
机构
南京农业大学生命科学学院
南京农业大学生物学实验教学中心
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期248-254,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31200195
J1210056和J1310015)
+2 种基金
江苏省自然科学基金青年基金项目(BK2012364)
教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20120097120019)
南京农业大学青年科技创新基金项目(KJ2012022)
文摘
[目的]在植物代谢通路关键调控基因表达的相关研究中,筛选各种条件下合适的内参基因至关重要。[方法]以UV-B为主要胁迫,运用荧光定量PCR技术以及geNorm和NormFinder软件,对不同取样时间(处理后0、1、2和5d)的紫花苜蓿(MedicagosativaL.)幼苗根、茎、叶组织中Actin2、GAPDH、MSC27、18SRNA、β-tublin、bZIP、UBQ、PPPrep、Ms03_50f03和Ms03_69f07等候选内参基因表达的稳定性进行研究。[结果]geNorm软件显示:紫花苜蓿幼苗根部UV-B胁迫下MSC27和UBQ的稳定值(M)较小,增加第3个内参基因后变异值(V)基本不变,表明选用2个内参基因即可;茎部则是MSC27和Actin2的M值较小,同时相应的V值也满足要求;而使用M值较小的Actin2和GAPDH为内参,在研究叶片基因表达时可以获得更加准确的结果,当增加第3个内参基因时,V值变大,反而影响结果。同时发现,18SRNA和β-tublin在根和茎叶中的稳定性均较差,因此不适宜作为内参基因使用。NormFinder的结果与上述结果相似,结果差异部分的原因可能是因为算法不同。[结论]在UV-B胁迫下,紫花苜蓿幼苗根部中MSC27和UBQ的表达较为稳定,而在茎部则以MSC27和Actin2为宜,使用Actin2和GAPDH为内参在研究叶片基因表达时可以获得更加准确的结果。本研究对UV-B胁迫下紫花苜蓿中关键基因的定量表达分析具有重要的实用价值。
关键词
紫花苜蓿
实时荧光定量PCR
内参基因
GENORM
NORMFINDER
Keywords
alfalfa
qRT-PCR
reference genes
ge Norm
Norm Finder
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
植物ABI4转录因子的研究进展
被引量:
5
2
作者
段星亮
张晶
宋晓东
谢彦杰
沈文飚
机构
南京农业大学生命科学实验中心
南京农业大学生命科学学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期19-27,共9页
基金
国家自然科学基金(31200195)
国家自然科学基金(J1210056和J1310015)
+3 种基金
中央高校基本科研业务费专项资金(KYZ201529)
江苏省自然科学基金(BK2012364)
教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20120097120019)
南京农业大学国家大学生创新创业训练计划(201510307004)~~
文摘
Abscisic acid-insensitive 4(ABI4)属于APETALA2/ethy lene responsive factor(AP2/ERF)类转录因子,它是在研究ABA信号转导途径中被发现和鉴定的。近年来,ABI4被认为是一种具有多种调节功能的转录因子,它参与了植物种子萌发和幼苗形态建成、质体/线粒体反向信号传递、脂类合成和分解、糖信号和ABA应答等诸多重要的生物学事件。本文综述了ABI4转录因子的结构特征、转录调控模式、基因表达调控和参与的信号转导功能等的最新研究进展。
关键词
植物
ABI4
转录因子
信号转导
Keywords
plant
ABI4
transcription factor
signal transduction
分类号
Q943 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
UV-B胁迫下紫花苜蓿qRT-PCR内参基因的筛选
张薇
崔为体
段星亮
汪瑾
沈文飚
谢彦杰
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
5
下载PDF
职称材料
2
植物ABI4转录因子的研究进展
段星亮
张晶
宋晓东
谢彦杰
沈文飚
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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