通过生物信息学评估CDKN2A的表达对头颈部鳞状细胞癌预后价值

目的分析细胞周期依赖性激酶抑制基因(CDKN2A)在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达对其预后的影响。方法通过生物信息学,利用从TCGA数据库和Oncomine下载的头颈鳞癌患者mRNA及临床资料,分析CDKN2A基因在多种癌症中的表达情况、以及其在配对和非配对的头颈鳞癌样本中的表达,采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析CDKN2A在HNSCC中的临床特征关系及预后价值。结果对于TCGA数据库下载的数据进行分析,可以得到CDKN2A在33种癌症中的表达情况,发现CDKN2A在膀胱癌、卵巢癌、宫颈癌、胰腺癌及头颈鳞癌中高表达(P<0.001);只在睾丸生殖细胞癌(TGCT)中表达下降(P<0.001);对546例头颈鳞状细胞癌及正常组织进行分析,发现CDKN2A在HNSCC中高表达(P<0.001);在头颈部鳞状细胞癌中CDKN2A的表达与患者的T分期(P=0.006)、性别(P=0.012)、病理分级(P=0.002)、解剖部位(P<0.001)、吸烟(P<0.001)有关;将546例头颈鳞状细胞癌患者分为高、低表达CDKN2A两组,总体生存时间(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无进展生存期(PFI)具有显著差异;ROC分析CDKN2A mRNA表达水平对预测患者有较好敏感性。结论CDKN2A在头颈鳞状细胞癌中高表达,与其临床特征和患者预后情况具有相关性,可以作为预测头颈部鳞状细胞癌不良预后的一种潜在标志物。

TRBC1和TCR Vβ两种流式细胞仪T细胞克隆性检测方法的对比分析

目的:分析健康人T细胞各亚群TRBC1和TCR Vβ家族的表达,比较两种流式细胞仪检测T细胞克隆的方法及其判定标准。方法:收集40例健康志愿者外周血,分别对全部CD3^(+)和去除TCRγδ^(+)细胞后的CD3^(+)TCRγδ^(-)T细胞设门,每群T细胞分为CD7^(+)CD5^(+)(T1)、CD7^(+)CD5^(dim+)(T2)、CD7^(+)CD5^(dim2+)(T3)、CD7^(+)CD5^(-)(T4)和CD7^(-)CD5^(+)(T5)5个亚群,分析亚群中CD4、CD8、TCR Vβ家族和TRBC1的表达。结果:39例纳入统计分析,CD3^(+)细胞中,T1、T2、T3、T4和T5的平均比例分别为57.29%、27.74%、5.15%、1.43%和5.99%;T1和T5以CD4^(+)细胞为主,T2、T3和T4以CD8^(+)细胞为主;CD3^(+)中T2、T3和T4亚群中TRBC1+%均明显低于CD3^(+)TCRγδ^(-)T门内相应值(P<0.01)。21例健康人22个亚群中出现TRBC1+%异常(<15%或>85%),主要见于T3和T4亚群;部分亚群可见单个优势Vβ表位,以优势Vβ表位占比≥60%或Vβ总和占比<15%作为判定异常克隆的标准;同时将TRBC1克隆性诊断标准修订为TRBC1+%<12%或>82%后,TRBC1和TCR Vβ两种方法判断克隆性的一致性为96.77%(180/186)。将TCRγδ^(+)细胞影响去除后,分布趋势不变。最终确定的单克隆T细胞发生率为38.46%(15/39),86.67%(13例)克隆性T细胞在淋巴细胞中的比例均低于5%,考虑为生理性克隆性增生;另外2例在淋巴细胞中分别占6.76%和33.24%,可能为意义未明的T细胞克隆(T-cell clones of uncertain signifificance,T-CUS)和T细胞增殖性疾病。结论:健康人利用CD7/CD5分群后在CD5^(dim+)或CD5^(-)亚群内可出现较多的生理性克隆性T细胞,对克隆性T细胞的解释必须与临床密切结合。