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富集分析框架下的致病SNP位点识别
被引量:
2
1
作者
杨利英
殷黎洋
+1 位作者
袁细国
张军英
《西安电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期43-48,共6页
针对复杂疾病致病单核苷酸多态性位点识别中单一方法的片面性问题,提出了基于富集分析的致病单核苷酸多态性位点识别方法.通过富集分析机制设计了一种集成学习框架,可将不同的方法有机结合以提升学习性能.基于此组合框架,将ReliefF和CA...
针对复杂疾病致病单核苷酸多态性位点识别中单一方法的片面性问题,提出了基于富集分析的致病单核苷酸多态性位点识别方法.通过富集分析机制设计了一种集成学习框架,可将不同的方法有机结合以提升学习性能.基于此组合框架,将ReliefF和CA趋势检验进行了集成,在识别单个致病位点的同时兼顾位点之间的交互作用.在模拟数据集和真实数据集上进行了实验研究,结果表明所提出的方法能显著地提升致病单核苷酸多态性位点的识别性能,且所设计的组合框架具有良好的扩展性,可为其他方法的组合研究提供借鉴.
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关键词
模式识别
集成学习
交互作用
富集分析
致病SNP位点识别
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职称材料
题名
富集分析框架下的致病SNP位点识别
被引量:
2
1
作者
杨利英
殷黎洋
袁细国
张军英
机构
西安电子科技大学计算机学院
出处
《西安电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期43-48,共6页
基金
陕西省自然科学基金资助项目(2015JM6275)
国家自然科学基金资助项目(61201312)
+1 种基金
中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(K5051303017
JB140306)
文摘
针对复杂疾病致病单核苷酸多态性位点识别中单一方法的片面性问题,提出了基于富集分析的致病单核苷酸多态性位点识别方法.通过富集分析机制设计了一种集成学习框架,可将不同的方法有机结合以提升学习性能.基于此组合框架,将ReliefF和CA趋势检验进行了集成,在识别单个致病位点的同时兼顾位点之间的交互作用.在模拟数据集和真实数据集上进行了实验研究,结果表明所提出的方法能显著地提升致病单核苷酸多态性位点的识别性能,且所设计的组合框架具有良好的扩展性,可为其他方法的组合研究提供借鉴.
关键词
模式识别
集成学习
交互作用
富集分析
致病SNP位点识别
Keywords
pattern recognition
ensemble learning
interaction
enrichment analysis
recognition of pathogenic single nucleotide polymorphisms loci
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
富集分析框架下的致病SNP位点识别
杨利英
殷黎洋
袁细国
张军英
《西安电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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参考文献
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